products/patches/med-4.1.0_hdf5-1.12.0.patch

   1 --- med-4.1.0_ref/configure     2020-03-11 12:53:46.000000000 +0100
   2 +++ med-4.1.0_dev/configure     2023-03-01 14:45:28.321320038 +0100
   3 @@ -3197,7 +3197,7 @@
   4  #med_check_hdf5.m4
   5  HDF_VERSION_REF=5-1.10.2
   6  HDF_VERSION_MAJOR_REF=1
   7 -HDF_VERSION_MINOR_REF=10
   8 +HDF_VERSION_MINOR_REF=13
   9  HDF_VERSION_RELEASE_REF=2
  10
  11
  12 @@ -7573,16 +7573,16 @@
  13        HDF5_VERSION="0"
  14        if test -n "$HDF5_ABS_PATH" ; then
  15           HDF5_USED_VER=` grep H5_VERS_INFO $HDF5_ABS_PATH | sed  's/\([^"]*\)\(".*"\)\([^"]*\)/\2/g' `
  16 -         H5_VER_MAJOR=`  grep '#define *H5_VERS_MAJOR' $HDF5_ABS_PATH | sed  's/^.*H5_VERS_MAJOR[[ \t]]*\([0-9]*\)[[ \t]]*.*$/\1/g' `
  17 -         H5_VER_MINOR=`  grep '#define *H5_VERS_MINOR' $HDF5_ABS_PATH | sed  's/^.*H5_VERS_MINOR[[ \t]]*\([0-9]*\)[[ \t]]*.*$/\1/g' `
  18 -         H5_VER_RELEASE=`grep '#define *H5_VERS_RELEASE' $HDF5_ABS_PATH | sed  's/^.*H5_VERS_RELEASE[[ \t]]*\([0-9]*\)[[ \t]]*.*$/\1/g' `
  19 +         H5_VER_MAJOR=`  grep '#define *H5_VERS_MAJOR' $HDF5_ABS_PATH | cut -d ' ' -f3 `
  20 +         H5_VER_MINOR=`  grep '#define *H5_VERS_MINOR' $HDF5_ABS_PATH | cut -d ' ' -f3 `
  21 +         H5_VER_RELEASE=`grep '#define *H5_VERS_RELEASE' $HDF5_ABS_PATH | cut -d ' ' -f3 `
  22           HDF5_VERSION=`  expr 10000 \* ${H5_VER_MAJOR} + 100 \* ${H5_VER_MINOR} + ${H5_VER_RELEASE} `
  23 -         test "0${HDF5_VERSION}" -gt "11100" || test "0${HDF5_VERSION}" -lt "11002" && as_fn_error $? "
  24 -This HDF5 version ${H5_VER_MAJOR}.${H5_VER_MINOR}.${H5_VER_RELEASE} must not be used with med-fichier${MED_NUM_MAJEUR}.${MED_NUM_MINEUR}.${MED_NUM_RELEASE}.
  25 -The HDF5 library version used by med-fichier${MED_NUM_MAJEUR}.y.z MUST NOT be > 1.10 and have to be at least HDF${HDF_VERSION_REF}.
  26 -DO NOT TRY TO COMPILE med-fichier${MED_NUM_MAJEUR}.${MED_NUM_MINEUR}.${MED_NUM_RELEASE} version with an HDF5 library which would generate an hdf5 file not compliant with HDF5-${HDF_VERSION_MAJOR_REF}.${HDF_VERSION_MINOR_REF}.z library.
  27 -This would BREAK med-fichier compatibility between files with the same revision number !
  28 -      " "$LINENO" 5
  29 +#          test "0${HDF5_VERSION}" -gt "11100" || test "0${HDF5_VERSION}" -lt "11002" && as_fn_error $? "
  30 +# This HDF5 version ${H5_VER_MAJOR}.${H5_VER_MINOR}.${H5_VER_RELEASE} must not be used with med-fichier${MED_NUM_MAJEUR}.${MED_NUM_MINEUR}.${MED_NUM_RELEASE}.
  31 +# The HDF5 library version used by med-fichier${MED_NUM_MAJEUR}.y.z MUST NOT be > 1.10 and have to be at least HDF${HDF_VERSION_REF}.
  32 +# DO NOT TRY TO COMPILE med-fichier${MED_NUM_MAJEUR}.${MED_NUM_MINEUR}.${MED_NUM_RELEASE} version with an HDF5 library which would generate an hdf5 file not compliant with HDF5-${HDF_VERSION_MAJOR_REF}.${HDF_VERSION_MINOR_REF}.z library.
  33 +# This would BREAK med-fichier compatibility between files with the same revision number !
  34 +#       " "$LINENO" 5
  35       else
  36  ## In case user explicitly ask to not use hdf5 !
  37        { $as_echo "$as_me:${as_lineno-$LINENO}: WARNING: Can't compile MED without hdf5" >&5
  38 @@ -31697,7 +31697,8 @@
  39       case $am_cv_python_pythondir in
  40       $am_py_prefix*)
  41         am__strip_prefix=`echo "$am_py_prefix" | sed 's|.|.|g'`
  42 -       am_cv_python_pythondir=`echo "$am_cv_python_pythondir" | sed "s,^$am__strip_prefix,$PYTHON_PREFIX,"`
  43 +       # am_cv_python_pythondir=`echo "$am_cv_python_pythondir" | sed "s,^$am__strip_prefix,$PYTHON_PREFIX,"`
  44 +       am_cv_python_pythondir="\${PYTHON_PREFIX}/lib/python$PYTHON_VERSION/site-packages"
  45         ;;
  46       *)
  47         case $am_py_prefix in
  48 @@ -31741,7 +31742,8 @@
  49       case $am_cv_python_pyexecdir in
  50       $am_py_exec_prefix*)
  51         am__strip_prefix=`echo "$am_py_exec_prefix" | sed 's|.|.|g'`
  52 -       am_cv_python_pyexecdir=`echo "$am_cv_python_pyexecdir" | sed "s,^$am__strip_prefix,$PYTHON_EXEC_PREFIX,"`
  53 +       # am_cv_python_pyexecdir=`echo "$am_cv_python_pyexecdir" | sed "s,^$am__strip_prefix,$PYTHON_EXEC_PREFIX,"`
  54 +       am_cv_python_pyexecdir="\${PYTHON_EXEC_PREFIX}/lib/python$PYTHON_VERSION/site-packages"
  55         ;;
  56       *)
  57         case $am_py_exec_prefix in
  58 --- med-4.1.0_ref/src/hdfi/_MEDparFileCreate.c  2020-03-11 10:36:37.000000000 +0100
  59 +++ med-4.1.0_dev/src/hdfi/_MEDparFileCreate.c  2023-03-01 14:38:44.653666031 +0100
  60 @@ -64,7 +64,7 @@
  61     * En HDF5-1.10.0p1 cela n'a aucun effet !
  62     * Un test autoconf permet de fixer un intervalle de version HDF à MED.
  63     */
  64 -#if H5_VERS_MINOR > 10
  65 +#if H5_VERS_MINOR > 12
  66  #error "Don't forget to change the compatibility version of the library !"
  67  #endif
  68
  69 --- med-4.1.0_ref/src/hdfi/_MEDmemFileOpen.c    2020-03-11 11:06:04.000000000 +0100
  70 +++ med-4.1.0_dev/src/hdfi/_MEDmemFileOpen.c    2023-03-01 14:39:16.990279182 +0100
  71 @@ -434,7 +434,7 @@
  72      goto ERROR;
  73    }
  74
  75 -#if H5_VERS_MINOR > 10
  76 +#if H5_VERS_MINOR > 12
  77  #error "Don't forget to change the compatibility version of the library !"
  78  #endif
  79    if ( H5Pset_libver_bounds( _fapl, H5F_LIBVER_18, H5F_LIBVER_18) ) {
  80 --- med-4.1.0_ref/src/hdfi/_MEDfileCreate.c     2020-03-11 10:36:37.000000000 +0100
  81 +++ med-4.1.0_dev/src/hdfi/_MEDfileCreate.c     2023-03-01 14:42:38.690103638 +0100
  82 @@ -159,7 +159,7 @@
  83     * En HDF5-1.10.0p1 cela n'a aucun effet !
  84     * Un test autoconf permet de fixer un intervalle de version HDF à MED.
  85     */
  86 -#if H5_VERS_MINOR > 10
  87 +#if H5_VERS_MINOR > 12
  88  #error "Don't forget to change the compatibility version of the library !"
  89  #endif
  90
  91 --- med-4.1.0_ref/src/hdfi/_MEDparFileOpen.c    2020-03-11 10:36:36.000000000 +0100
  92 +++ med-4.1.0_dev/src/hdfi/_MEDparFileOpen.c    2023-03-01 14:43:12.134737789 +0100
  93 @@ -55,7 +55,7 @@
  94      MED_ERR_(_fid,MED_ERR_INIT,MED_ERR_PROPERTY,MED_ERR_PARALLEL_MSG);
  95      goto ERROR;
  96    }
  97 -#if H5_VERS_MINOR > 10
  98 +#if H5_VERS_MINOR > 12
  99  #error "Don't forget to change the compatibility version of the library !"
 100  #endif
 101    if ( H5Pset_libver_bounds( _fapl, H5F_LIBVER_18, H5F_LIBVER_18 ) ) {
 102 --- med-4.1.0_ref/src/hdfi/_MEDfileOpen.c       2020-03-12 16:27:49.000000000 +0100
 103 +++ med-4.1.0_dev/src/hdfi/_MEDfileOpen.c       2023-03-01 14:43:45.131363443 +0100
 104 @@ -72,7 +72,7 @@
 105
 106     •   The creation order tracking property, H5P_CRT_ORDER_TRACKED, has been set in the group creation property list (see H5Pset_link_creation_order).
 107    */
 108 -#if H5_VERS_MINOR > 10
 109 +#if H5_VERS_MINOR > 12
 110  #error "Don't forget to change the compatibility version of the library !"
 111  #endif
 112  /* L'avantage de bloquer le modèle interne HDF5
 113 --- med-4.1.0_ref/src/ci/MEDfileCompatibility.c 2020-03-11 10:36:34.000000000 +0100
 114 +++ med-4.1.0_dev/src/ci/MEDfileCompatibility.c 2023-03-01 14:38:09.220994176 +0100
 115 @@ -113,7 +113,7 @@
 116  #if MED_NUM_MAJEUR != 4
 117  #error "Don't forget to update the test version here when you change the major version of the library !"
 118  #endif
 119 -#if H5_VERS_MINOR > 10
 120 +#if H5_VERS_MINOR > 12
 121  #error "Don't forget to check the compatibility version of the library, depending on the internal hdf model choice !"
 122  #error "Cf. _MEDfileCreate ..."
 123  #endif