medtool/src/MEDCoupling/MEDCouplingMultiFields.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2015  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
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   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
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   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #include "MEDCouplingMultiFields.hxx"
  22 #include "MEDCouplingFieldTemplate.hxx"
  23 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
  24 #include "MEDCouplingMesh.hxx"
  25 #include "MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr.hxx"
  26
  27 #include <sstream>
  28 #include <algorithm>
  29
  30 using namespace ParaMEDMEM;
  31
  32 MEDCouplingMultiFields *MEDCouplingMultiFields::New(const std::vector<MEDCouplingFieldDouble *>& fs)
  33 {
  34   return new MEDCouplingMultiFields(fs);
  35 }
  36
  37 MEDCouplingMultiFields *MEDCouplingMultiFields::New()
  38 {
  39   return new MEDCouplingMultiFields;
  40 }
  41
  42 MEDCouplingMultiFields *MEDCouplingMultiFields::deepCpy() const
  43 {
  44   return new MEDCouplingMultiFields(*this);
  45 }
  46
  47 bool MEDCouplingMultiFields::isEqual(const MEDCouplingMultiFields *other, double meshPrec, double valsPrec) const
  48 {
  49   std::size_t sz=_fs.size();
  50   if(sz!=other->_fs.size())
  51     return false;
  52   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
  53     {
  54       const MEDCouplingFieldDouble *f1=_fs[i];
  55       const MEDCouplingFieldDouble *f2=other->_fs[i];
  56       if(f1!=f2)
  57         {
  58           if(f1==0 || f2==0)
  59             return false;
  60           if(!_fs[i]->isEqual(other->_fs[i],meshPrec,valsPrec))
  61             return false;
  62         }
  63     }
  64   std::vector<int> refs1,refs2;
  65   std::vector<MEDCouplingMesh *> ms1=getDifferentMeshes(refs1);
  66   std::vector<MEDCouplingMesh *> ms2=other->getDifferentMeshes(refs2);
  67   if(ms1.size()!=ms2.size())
  68     return false;
  69   if(refs1!=refs2)
  70     return false;
  71   std::vector< std::vector<int> > refs3,refs4;
  72   std::vector<DataArrayDouble *> das1=getDifferentArrays(refs3);
  73   std::vector<DataArrayDouble *> das2=getDifferentArrays(refs4);
  74   if(das1.size()!=das2.size())
  75     return false;
  76   if(refs3!=refs4)
  77     return false;
  78   return true;
  79 }
  80
  81 std::string MEDCouplingMultiFields::getName() const
  82 {
  83   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> >::const_iterator it=_fs.begin();
  84   for(;it!=_fs.end();it++)
  85     if((const MEDCouplingFieldDouble *)(*it))
  86       return (*it)->getName();
  87   return std::string();
  88 }
  89
  90 std::string MEDCouplingMultiFields::getDescription() const
  91 {
  92   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> >::const_iterator it=_fs.begin();
  93   for(;it!=_fs.end();it++)
  94     if((const MEDCouplingFieldDouble *)(*it))
  95       return (*it)->getDescription();
  96   return std::string();
  97 }
  98
  99 std::string MEDCouplingMultiFields::getTimeUnit() const
 100 {
 101   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> >::const_iterator it=_fs.begin();
 102   for(;it!=_fs.end();it++)
 103     if((const MEDCouplingFieldDouble *)(*it))
 104       return (*it)->getTimeUnit();
 105   return std::string();
 106 }
 107
 108 double MEDCouplingMultiFields::getTimeResolution() const
 109 {
 110   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> >::const_iterator it=_fs.begin();
 111   for(;it!=_fs.end();it++)
 112     if((const MEDCouplingFieldDouble *)(*it))
 113       return (*it)->getTimeTolerance();
 114   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMultiFields::getTimeResolution : no not null field !");
 115 }
 116
 117 std::string MEDCouplingMultiFields::simpleRepr() const
 118 {
 119   std::ostringstream ret;
 120   ret << "MEDCouplingMultiFields with name : \"" << getName() << "\"\n";
 121   ret << "Description of MEDCouplingMultiFields is : \"" << getDescription() << "\"\n";
 122   ret << "Number of discretization : " << _fs.size() << "\n";
 123   ret << "Number of different meshes : ";
 124   std::vector<MEDCouplingMesh *> ms;
 125   std::vector<int> refms;
 126   try
 127   {
 128       ms=getDifferentMeshes(refms);
 129       ret << ms.size() << "\n";
 130   }
 131   catch(INTERP_KERNEL::Exception& /*e*/)
 132   { ret << "Current instance is INVALID !\n"; }
 133   return ret.str();
 134 }
 135
 136 std::string MEDCouplingMultiFields::advancedRepr() const
 137 {
 138   return simpleRepr();
 139 }
 140
 141 bool MEDCouplingMultiFields::isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMultiFields *other, double meshPrec, double valsPrec) const
 142 {
 143   std::size_t sz=_fs.size();
 144   if(sz!=other->_fs.size())
 145     return false;
 146   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 147     if(!_fs[i]->isEqualWithoutConsideringStr(other->_fs[i],meshPrec,valsPrec))
 148       return false;
 149   return true;
 150 }
 151
 152 const MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMultiFields::getFieldWithId(int id) const
 153 {
 154   if(id>=(int)_fs.size() || id < 0)
 155     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMultiFields::getFieldWithId : invalid id outside boundaries !");
 156   return _fs[id];
 157 }
 158
 159 std::vector<const MEDCouplingFieldDouble *> MEDCouplingMultiFields::getFields() const
 160 {
 161   std::vector<const MEDCouplingFieldDouble *> ret(_fs.size());
 162   std::copy(_fs.begin(),_fs.end(),ret.begin());
 163   return ret;
 164 }
 165
 166 int MEDCouplingMultiFields::getNumberOfFields() const
 167 {
 168   return (int)_fs.size();
 169 }
 170
 171 const MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMultiFields::getFieldAtPos(int id) const
 172 {
 173   if(id<0 || id>=(int)_fs.size())
 174     {
 175       std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingMultiFields::getFieldAtPos : Invalid given pos : should be >=0 and < " << _fs.size() << " !";
 176       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 177     }
 178   return _fs[id];
 179 }
 180
 181 void MEDCouplingMultiFields::updateTime() const
 182 {
 183   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> >::const_iterator it=_fs.begin();
 184   for(;it!=_fs.end();it++)
 185     if((const MEDCouplingFieldDouble *)(*it))
 186       (*it)->updateTime();
 187   it=_fs.begin();
 188   for(;it!=_fs.end();it++)
 189     if((const MEDCouplingFieldDouble *)(*it))
 190       updateTimeWith(*(*it));
 191 }
 192
 193 std::size_t MEDCouplingMultiFields::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
 194 {
 195   return 0;
 196 }
 197
 198 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDCouplingMultiFields::getDirectChildrenWithNull() const
 199 {
 200   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
 201   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> >::const_iterator it=_fs.begin();it!=_fs.end();it++)
 202     ret.push_back((const MEDCouplingFieldDouble *)*it);
 203   return ret;
 204 }
 205
 206 std::vector<MEDCouplingMesh *> MEDCouplingMultiFields::getMeshes() const
 207 {
 208   std::vector<MEDCouplingMesh *> ms;
 209   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> >::const_iterator it=_fs.begin();it!=_fs.end();it++)
 210     {
 211       const MEDCouplingMesh *m=0;
 212       if((const MEDCouplingFieldDouble *)(*it))
 213         m=(*it)->getMesh();
 214       ms.push_back(const_cast<MEDCouplingMesh *>(m));
 215     }
 216   return ms;
 217 }
 218
 219 std::vector<MEDCouplingMesh *> MEDCouplingMultiFields::getDifferentMeshes(std::vector<int>& refs) const
 220 {
 221   refs.resize(_fs.size());
 222   std::vector<MEDCouplingMesh *> ms;
 223   int id=0;
 224   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> >::const_iterator it=_fs.begin();it!=_fs.end();it++,id++)
 225     {
 226       const MEDCouplingMesh *m=0;
 227       if((const MEDCouplingFieldDouble *)(*it))
 228         m=(*it)->getMesh();
 229       if(m)
 230         {
 231           std::vector<MEDCouplingMesh *>::iterator it2=std::find(ms.begin(),ms.end(),m);
 232           if(it2==ms.end())
 233             {
 234               ms.push_back(const_cast<MEDCouplingMesh *>(m));
 235               refs[id]=(int)ms.size()-1;
 236             }
 237           else
 238             refs[id]=(int)std::distance(ms.begin(),it2);
 239         }
 240       else
 241         refs[id]=-1;
 242     }
 243   return ms;
 244 }
 245
 246 std::vector<DataArrayDouble *> MEDCouplingMultiFields::getArrays() const
 247 {
 248   std::vector<DataArrayDouble *> tmp;
 249   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> >::const_iterator it=_fs.begin();it!=_fs.end();it++)
 250     {
 251       std::vector<DataArrayDouble *> tmp2=(*it)->getArrays();
 252       tmp.insert(tmp.end(),tmp2.begin(),tmp2.end());
 253     }
 254   return tmp;
 255 }
 256
 257 std::vector<DataArrayDouble *> MEDCouplingMultiFields::getDifferentArrays(std::vector< std::vector<int> >& refs) const
 258 {
 259   refs.resize(_fs.size());
 260   int id=0;
 261   std::vector<DataArrayDouble *> ret;
 262   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> >::const_iterator it=_fs.begin();it!=_fs.end();it++,id++)
 263     {
 264       std::vector<DataArrayDouble *> tmp2;
 265       if((const MEDCouplingFieldDouble *)(*it))
 266         {
 267           tmp2=(*it)->getArrays();
 268           refs[id].resize(tmp2.size());
 269         }
 270       else
 271         refs[id].clear();
 272       int id2=0;
 273       for(std::vector<DataArrayDouble *>::const_iterator it2=tmp2.begin();it2!=tmp2.end();it2++,id2++)
 274         {
 275           if(*it2)
 276             {
 277               std::vector<DataArrayDouble *>::iterator it3=std::find(ret.begin(),ret.end(),*it2);
 278               if(it3==ret.end())
 279                 {
 280                   ret.push_back(*it2);
 281                   refs[id][id2]=(int)ret.size()-1;
 282                 }
 283               else
 284                 refs[id][id2]=(int)std::distance(ret.begin(),it3);
 285             }
 286           else
 287             refs[id][id2]=-1;
 288         }
 289     }
 290   return ret;
 291 }
 292
 293 void MEDCouplingMultiFields::checkCoherency() const
 294 {
 295   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> >::const_iterator it=_fs.begin();
 296   for(;it!=_fs.end();it++)
 297     {
 298       if((const MEDCouplingFieldDouble *)(*it)==0)
 299         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMultiFields::checkCoherency : There is an empty Field in array...");
 300       (*it)->checkCoherency();
 301     }
 302 }
 303
 304 MEDCouplingMultiFields::MEDCouplingMultiFields(const std::vector<MEDCouplingFieldDouble *>& fs):_fs(fs.size())
 305 {
 306   int id=0;
 307   for(std::vector< MEDCouplingFieldDouble * >::const_iterator it=fs.begin();it!=fs.end();it++,id++)
 308     {
 309       if(*it)
 310         (*it)->incrRef();
 311       else
 312         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMultiFields constructor : empty field found in vector !");
 313       (*it)->checkCoherency();
 314       _fs[id]=*it;
 315     }
 316 }
 317
 318
 319 /*!
 320  * Performs deepCpy.
 321  */
 322 MEDCouplingMultiFields::MEDCouplingMultiFields(const MEDCouplingMultiFields& other):RefCountObject(other)
 323 {
 324   std::size_t sz=other._fs.size();
 325   _fs.resize(sz);
 326   std::vector<int> refs;
 327   std::vector< std::vector<int> > refs2;
 328   std::vector<MEDCouplingMesh *> ms=other.getDifferentMeshes(refs);
 329   std::size_t msLgh=ms.size();
 330   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingMesh> > ms2(msLgh);
 331   for(std::size_t i=0;i<msLgh;i++)
 332     ms2[i]=ms[i]->deepCpy();
 333   std::vector<DataArrayDouble *> das=other.getDifferentArrays(refs2);
 334   std::size_t dasLgth=das.size();
 335   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> > das2(dasLgth);
 336   for(std::size_t i=0;i<dasLgth;i++)
 337     das2[i]=das[i]->deepCpy();
 338   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 339     {
 340       if((const MEDCouplingFieldDouble *)other._fs[i])
 341         {
 342           MEDCouplingFieldTemplate *tmp=MEDCouplingFieldTemplate::New(*other._fs[i]);
 343           _fs[i]=MEDCouplingFieldDouble::New(*tmp,other._fs[i]->getTimeDiscretization());
 344           tmp->decrRef();
 345           if(refs[i]!=-1)
 346             _fs[i]->setMesh(ms2[refs[i]]);
 347           std::size_t nbOfArr=refs2[i].size();
 348           std::vector<DataArrayDouble *> tmp2(nbOfArr);
 349           for(std::size_t j=0;j<nbOfArr;j++)
 350             {
 351               if(refs2[i][j]!=-1)
 352                 tmp2[j]=das2[refs2[i][j]];
 353               else
 354                 tmp2[j]=0;
 355             }
 356           _fs[i]->setArrays(tmp2);
 357           std::vector<int> tinyInfo;
 358           std::vector<double> tinyInfo2;
 359           other._fs[i]->getTimeDiscretizationUnderGround()->getTinySerializationIntInformation2(tinyInfo);
 360           other._fs[i]->getTimeDiscretizationUnderGround()->getTinySerializationDbleInformation2(tinyInfo2);
 361           _fs[i]->getTimeDiscretizationUnderGround()->finishUnserialization2(tinyInfo,tinyInfo2);
 362         }
 363     }
 364 }
 365
 366 MEDCouplingMultiFields::MEDCouplingMultiFields()
 367 {
 368 }
 369
 370 void MEDCouplingMultiFields::getTinySerializationInformation(std::vector<int>& tinyInfo, std::vector<double>& tinyInfo2, int& nbOfDiffMeshes, int& nbOfDiffArr) const
 371 {
 372   std::vector<int> refs;
 373   std::vector<MEDCouplingMesh *> ms=getDifferentMeshes(refs);
 374   nbOfDiffMeshes=(int)ms.size();
 375   std::vector< std::vector<int> > refs2;
 376   std::vector<DataArrayDouble *> fs=getDifferentArrays(refs2);
 377   nbOfDiffArr=(int)fs.size();
 378   //
 379   std::size_t sz=refs.size();//==_fs.size()
 380   int sz2=0;
 381   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 382     sz2+=(int)refs2[i].size();
 383   //
 384   tinyInfo2.clear();
 385   std::vector<int> doubleDaInd(sz);
 386   std::vector<int> timeDiscrInt;
 387   tinyInfo.resize(sz2+5*sz+3);
 388   tinyInfo[0]=(int)sz;
 389   tinyInfo[1]=sz2;
 390   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 391     {
 392       std::vector<double> tmp;
 393       std::vector<int> tmp2;
 394       _fs[i]->getTimeDiscretizationUnderGround()->getTinySerializationDbleInformation2(tmp);
 395       _fs[i]->getTimeDiscretizationUnderGround()->getTinySerializationIntInformation2(tmp2);
 396       tinyInfo[3*sz+3+i]=(int)tmp.size();
 397       tinyInfo[4*sz+3+i]=(int)tmp2.size();
 398       tinyInfo2.insert(tinyInfo2.end(),tmp.begin(),tmp.end());
 399       timeDiscrInt.insert(timeDiscrInt.end(),tmp2.begin(),tmp2.end());
 400     }
 401   int sz3=(int)timeDiscrInt.size();
 402   tinyInfo[2]=sz3;
 403   //
 404   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 405     tinyInfo[i+3]=refs[i];
 406   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 407     tinyInfo[i+sz+3]=(int)refs2[i].size();
 408   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 409     tinyInfo[i+2*sz+3]=(int)_fs[i]->getTimeDiscretization();
 410   int k=0;
 411   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 412     for(std::vector<int>::const_iterator it=refs2[i].begin();it!=refs2[i].end();it++,k++)
 413       tinyInfo[5*sz+k+3]=*it;
 414   tinyInfo.insert(tinyInfo.end(),timeDiscrInt.begin(),timeDiscrInt.end());//tinyInfo has lgth==sz3+sz2+5*sz+3
 415 }
 416
 417 void MEDCouplingMultiFields::finishUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfoI, const std::vector<double>& tinyInfoD,
 418                                                    const std::vector<MEDCouplingFieldTemplate *>& ft, const std::vector<MEDCouplingMesh *>& ms,
 419                                                    const std::vector<DataArrayDouble *>& das)
 420 {
 421   int sz=tinyInfoI[0];
 422   _fs.resize(sz);
 423   int sz2=tinyInfoI[1];
 424   // dealing with ft with no mesh set.
 425   for(int i=0;i<sz;i++)
 426     {
 427       int meshId=tinyInfoI[3+i];
 428       if(meshId!=-1)
 429         ft[i]->setMesh(ms[meshId]);
 430     }
 431   // dealing with fieldtemplate->fielddouble
 432   int k=0;
 433   int offI=0;
 434   int offD=0;
 435   for(int i=0;i<sz;i++)
 436     {
 437       _fs[i]=MEDCouplingFieldDouble::New(*ft[i],(TypeOfTimeDiscretization)tinyInfoI[2*sz+3+i]);
 438       int sz3=tinyInfoI[sz+i+3];
 439       std::vector<DataArrayDouble *> tmp(sz3);
 440       for(int j=0;j<sz3;j++,k++)
 441         {
 442           int daId=tinyInfoI[5*sz+k+3];
 443           if(daId!=-1)
 444             tmp[j]=das[daId];
 445           else
 446             tmp[j]=0;
 447         }
 448       _fs[i]->setArrays(tmp);
 449       // time discr tiny info
 450       int lgthI=tinyInfoI[4*sz+3+i];
 451       int lgthD=tinyInfoI[3*sz+3+i];
 452       //
 453       std::vector<int> tdInfoI(tinyInfoI.begin()+sz2+5*sz+3+offI,tinyInfoI.begin()+sz2+5*sz+3+offI+lgthI);
 454       std::vector<double> tdInfoD(tinyInfoD.begin()+offD,tinyInfoD.begin()+offD+lgthD);
 455       _fs[i]->getTimeDiscretizationUnderGround()->finishUnserialization2(tdInfoI,tdInfoD);
 456       //
 457       offI+=lgthI;
 458       offD+=lgthD;
 459     }
 460 }