doc/user/input/data_optimization.rst

   1 Data optimization for numerical codes
   2 =====================================
   3
   4 .. _renumbering:
   5
   6 Renumbering to improve locality
   7 -------------------------------
   8
   9 A mesher (like SMESH) often generates a scattered cell distribution in output unstructured mesh.
  10 So a common task for simulation codes is the reordering for a better locality.
  11
  12 medcoupling can do that simply by doing
  13
  14 .. literalinclude:: ../../../src/MEDCoupling_Swig/UsersGuideExamplesTest.py
  15    :start-after: UG_Optimization_0
  16    :end-before:  UG_Optimization_0
  17
  18 .. figure:: ../images/medrenumber.png
  19    :align: center
  20
  21    Numbering by MEFISTO mesher (to the left) and the same mesh after renumbering (to the right)
  22
  23 RenumberingFactory method creates a renumbering algorithm of a specified type: either "Boost" or "Metis".
  24
  25 Partitionning for multi procs
  26 -----------------------------
  27
  28 For simulation codes following the SPMD paradigm, the partitionning is a key step.
  29 medcoupling can perform this partition. Here is an example of partitioning mesh *m* into 4 parts and retrieving the first part:
  30
  31 .. literalinclude:: ../../../src/MEDCoupling_Swig/UsersGuideExamplesTest.py
  32    :start-after: UG_Optimization_1
  33    :end-before:  UG_Optimization_1
  34
  35 .. figure:: ../images/partition.png
  36    :align: center
  37
  38    A whole mesh *m* (to the left) and one fourth of it *part0* (to the right) got using the above code
  39
  40 It's then possible to add a layer or more of cells.
  41
  42 .. literalinclude:: ../../../src/MEDCoupling_Swig/UsersGuideExamplesTest.py
  43    :start-after: UG_Optimization_2
  44    :end-before:  UG_Optimization_2
  45
  46 .. figure:: ../images/partition_with_layer.png
  47    :align: center
  48
  49    *part0* (to the left) and *part0_with_layer* (to the right)