2 Lecture, écriture d'un fichier MED grâce à l'API basique de MEDLoader
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5 L'API basique de MEDLoader est contenue dans la classe ``MEDLoader``.
6 Toutes les méthodes de cette classe sont *statiques* (elles ne dépendent pas d'une instance particulière de la
7 classe), leurs noms commencent par une majuscule.
8 L'ensemble des lectures/écritures sont exécutées à chaque appel de méthode et aucun état interne à la classe n'est
14 Ecrire un maillage et un champ à partir de rien, les relire et comparer les résultats.
16 Points abordés: en utilisant l'API basique de ``MEDLoader``
21 Début d'implémentation
22 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
24 Cet exercice repose comme tous les autres sur le language de script Python. On charge
25 le module Python ``MEDLoader``.
27 Pour information, le module ``MEDCoupling`` complet est inclus dans ``MEDLoader``. Pas besoin de l'importer
28 si ``MEDLoader`` a été chargé. ::
30 import MEDLoader as ml
31 from MEDLoader import MEDLoader
33 Lecture, écriture d'un maillage
34 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
36 Tout d'abord créons un maillage ``targetMesh`` composé de plusieurs types géométriques. ::
38 targetCoords = [-0.3,-0.3, 0.2,-0.3, 0.7,-0.3, -0.3,0.2, 0.2,0.2, 0.7,0.2, -0.3,0.7, 0.2,0.7, 0.7,0.7 ]
39 targetConn = [0,3,4,1, 1,4,2, 4,5,2, 6,7,4,3, 7,8,5,4]
40 targetMesh = ml.MEDCouplingUMesh("MyMesh",2)
41 targetMesh.allocateCells(5)
42 targetMesh.insertNextCell(ml.NORM_TRI3,3,targetConn[4:7])
43 targetMesh.insertNextCell(ml.NORM_TRI3,3,targetConn[7:10])
44 targetMesh.insertNextCell(ml.NORM_QUAD4,4,targetConn[0:4])
45 targetMesh.insertNextCell(ml.NORM_QUAD4,4,targetConn[10:14])
46 targetMesh.insertNextCell(ml.NORM_QUAD4,4,targetConn[14:18])
47 myCoords = ml.DataArrayDouble(targetCoords,9,2)
48 myCoords.setInfoOnComponents(["X [km]","YY [mm]"])
49 targetMesh.setCoords(myCoords)
51 .. note:: Le maillage ``targetMesh`` est ordonné par type géométrique.
53 Le maillage peut alors directement être écrit ... ::
55 MEDLoader.WriteUMesh("TargetMesh.med",targetMesh,True) # True means 'from scratch'
59 meshRead = MEDLoader.ReadUMeshFromFile("TargetMesh.med",targetMesh.getName(),0)
60 print "Is the read mesh equal to 'targetMesh' ?", meshRead.isEqual(targetMesh,1e-12)
62 Lire/Ecrire un champ sur un pas de temps
63 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
65 Nous créons maintenant un champ de vecteurs ``f`` aux cellules (P0) avec ``targetMesh`` comme support.
66 Ce champ correspond par exemple au temps physique 5.6, repéré par l'itération 7 et la sous-itération 8.
67 Nous en profitons pour rappeler
68 que dans les champs MEDCoupling, le temps physique est donné pour information seulement, le stockage et la plupart des
69 fonctions de l'API se basent sur les deux derniers entiers. ::
71 f = ml.MEDCouplingFieldDouble.New(ml.ON_CELLS, ml.ONE_TIME)
72 f.setTime(5.6,7,8) # Declare the timestep associated to the field
73 f.setArray(targetMesh.getBarycenterAndOwner())
75 f.setName("AFieldName")
76 MEDLoader.WriteField("MyFirstField.med",f,True)
78 Question subsidiaire : à quoi correspond le champ ainsi créé ?
80 .. note:: Le maillage **et** le champ sont écrits d'un seul coup dans le fichier "MyFirstField.med".
82 Nous relisons ensuite MyFirstField.med : ::
84 f2 = MEDLoader.ReadFieldCell("MyFirstField.med", f.getMesh().getName(), 0, f.getName(), 7, 8)
85 print "Is the read field identical to 'f' ?", f2.isEqual(f,1e-12,1e-12)
87 .. note:: Lors de la lecture du champ, on doit donc connaître: son nom, le nom de sa mesh de support
88 et le pas de temps voulu. Des fonctions du type ``MEDFileFields.getFieldsNames()`` ou encore
89 ``MEDFileMeshes.getMeshesNames()`` aident à cela.
91 .. note:: Le nom ``ReadFieldCell()`` rappelle que le champ doit être lu aux cellules. Souvenez-vous que suivant la
92 norme MED fichier, un même champ peut avoir une partie de ses données stockées aux cellules, mais aussi
93 simultanément aux noeuds, aux points de Gauss, etc ... même si ce genre de mélange exotique n'est généralement
96 Lire/Ecrire un champ sur plusieurs pas de temps
97 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
99 Ici contrairement au cas précédent, nous écrivons en plusieurs fois dans le *même* fichier MED.
100 Ecrivons tout d'abord le maillage. ::
102 MEDLoader.WriteUMesh("MySecondField.med",f.getMesh(),True)
104 Ensuite, nous écrivons seulement les informations relatives au champ (principalement son tableau de valeurs en fait
107 MEDLoader.WriteFieldUsingAlreadyWrittenMesh("MySecondField.med",f) # mesh is not re-written
109 Nous rajoutons ensuite un second pas de temps sur le *même* maillage. ::
111 f2 = f.clone(True) # 'True' means that we need a deep copy
112 f2.getArray()[:] = 2.0
114 MEDLoader.WriteFieldUsingAlreadyWrittenMesh("MySecondField.med",f2)
116 Maintenant le fichier "MySecondField.med" contient le maillage et un champ à deux pas de temps porté par ce maillage.
118 Nous pouvons relire tout cela avec des méthodes similaires à ce qui a été vu précédemment : ::
120 f3 = MEDLoader.ReadFieldCell("MySecondField.med",f.getMesh().getName(),0,f.getName(),7,8)
121 print "Is the field read in file equals to 'f' ?", f.isEqual(f3,1e-12,1e-12)
122 f4 = MEDLoader.ReadFieldCell("MySecondField.med",f.getMesh().getName(),0,f.getName(),9,10)
123 print "Is the field read in file equals to 'f2' ?", f2.isEqual(f4,1e-12,1e-12)
128 :ref:`python_testMEDLoaderBasicAPI1_solution`