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Fix computation height of isocel triangle with base equal zero : NaN
[tools/medcoupling.git] / doc / tutorial / medloader_basicAPI1_fr.rst
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2 Lecture, écriture d'un fichier MED grâce à l'API basique de MEDLoader
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5 L'API basique de MEDLoader est contenue dans la classe ``MEDLoader``.
6 Toutes les méthodes de cette classe sont *statiques* (elles ne dépendent pas d'une instance particulière de la
7 classe), leurs noms commencent par une majuscule. 
8 L'ensemble des lectures/écritures sont exécutées à chaque appel de méthode et aucun état interne à la classe n'est
9 enregistré.
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11 Objectif
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14 Ecrire un maillage et un champ à partir de rien, les relire et comparer les résultats.
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16 Points abordés: en utilisant l'API basique de ``MEDLoader``
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18 * Ecrire un fichier
19 * Lire un fichier
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21 Début d'implémentation
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24 Cet exercice repose comme tous les autres sur le language de script Python. On charge 
25 le module Python ``medcoupling``.::
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27         import medcoupling as mc
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29 Lecture, écriture d'un maillage
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32 Tout d'abord créons un maillage ``targetMesh`` composé de plusieurs types géométriques. ::
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34         targetCoords = [-0.3,-0.3, 0.2,-0.3, 0.7,-0.3, -0.3,0.2, 0.2,0.2, 0.7,0.2, -0.3,0.7, 0.2,0.7, 0.7,0.7 ]
35         targetConn = [0,3,4,1, 1,4,2, 4,5,2, 6,7,4,3, 7,8,5,4]
36         targetMesh = mc.MEDCouplingUMesh("MyMesh",2)
37         targetMesh.allocateCells(5)
38         targetMesh.insertNextCell(mc.NORM_TRI3,3,targetConn[4:7])
39         targetMesh.insertNextCell(mc.NORM_TRI3,3,targetConn[7:10])
40         targetMesh.insertNextCell(mc.NORM_QUAD4,4,targetConn[0:4])
41         targetMesh.insertNextCell(mc.NORM_QUAD4,4,targetConn[10:14])
42         targetMesh.insertNextCell(mc.NORM_QUAD4,4,targetConn[14:18])
43         myCoords = mc.DataArrayDouble(targetCoords,9,2)
44         myCoords.setInfoOnComponents(["X [km]","YY [mm]"])
45         targetMesh.setCoords(myCoords)
46
47 .. note:: Le maillage ``targetMesh`` est ordonné par type géométrique.
48
49 Le maillage peut alors directement être écrit ... ::
50
51         mc.WriteUMesh("TargetMesh.med",targetMesh,True)  # True means 'from scratch'
52
53 ... et relu. ::
54
55         meshRead = mc.ReadUMeshFromFile("TargetMesh.med",targetMesh.getName(),0)
56         print("Is the read mesh equal to 'targetMesh' ?", meshRead.isEqual(targetMesh,1e-12))
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58 Lire/Ecrire un champ sur un pas de temps
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61 Nous créons maintenant un champ de vecteurs ``f`` aux cellules (P0) avec ``targetMesh`` comme support. 
62 Ce champ correspond par exemple au temps physique 5.6, repéré par l'itération 7 et la sous-itération 8. 
63 Nous en profitons pour rappeler
64 que dans les champs MEDCoupling, le temps physique est donné pour information seulement, le stockage et la plupart des
65 fonctions de l'API se basent sur les deux derniers entiers. ::
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67         f = mc.MEDCouplingFieldDouble.New(mc.ON_CELLS, mc.ONE_TIME)
68         f.setTime(5.6,7,8)                              # Declare the timestep associated to the field 
69         f.setArray(targetMesh.computeCellCenterOfMass())
70         f.setMesh(targetMesh)
71         f.setName("AFieldName")
72         mc.WriteField("MyFirstField.med",f,True)
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74 Question subsidiaire : à quoi correspond le champ ainsi créé ?
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76 .. note:: Le maillage **et** le champ sont écrits d'un seul coup dans le fichier "MyFirstField.med".
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78 Nous relisons ensuite MyFirstField.med : ::
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80         f2 = mc.ReadFieldCell("MyFirstField.med", f.getMesh().getName(), 0, f.getName(), 7, 8)
81         print("Is the read field identical to 'f' ?", f2.isEqual(f,1e-12,1e-12))
82         
83 .. note:: Lors de la lecture du champ, on doit donc connaître: son nom, le nom de sa mesh de support
84         et le pas de temps voulu. Des fonctions du type ``MEDFileFields.getFieldsNames()`` ou encore 
85         ``MEDFileMeshes.getMeshesNames()`` aident à cela.
86         
87 .. note:: Le nom ``ReadFieldCell()`` rappelle que le champ doit être lu aux cellules. Souvenez-vous que suivant la 
88         norme MED fichier, un même champ peut avoir une partie de ses données stockées aux cellules, mais aussi 
89         simultanément aux noeuds, aux points de Gauss, etc ... même si ce genre de mélange exotique n'est généralement
90         pas conseillé.
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92 Lire/Ecrire un champ sur plusieurs pas de temps
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95 Ici contrairement au cas précédent, nous écrivons en plusieurs fois dans le *même* fichier MED.
96 Ecrivons tout d'abord le maillage. ::
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98         mc.WriteUMesh("MySecondField.med",f.getMesh(),True)
99         
100 Ensuite, nous écrivons seulement les informations relatives au champ (principalement son tableau de valeurs en fait
101 ). ::
102
103         mc.WriteFieldUsingAlreadyWrittenMesh("MySecondField.med",f)   # mesh is not re-written
104         
105 Nous rajoutons ensuite un second pas de temps sur le *même* maillage. ::
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107         f2 = f.clone(True)         # 'True' means that we need a deep copy  
108         f2.getArray()[:] = 2.0
109         f2.setTime(7.8,9,10)
110         mc.WriteFieldUsingAlreadyWrittenMesh("MySecondField.med",f2)
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112 Maintenant le fichier "MySecondField.med" contient le maillage et un champ à deux pas de temps porté par ce maillage.
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114 Nous pouvons relire tout cela avec des méthodes similaires à ce qui a été vu précédemment : ::
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116         f3 = mc.ReadFieldCell("MySecondField.med",f.getMesh().getName(),0,f.getName(),7,8)
117         print("Is the field read in file equals to 'f' ?", f.isEqual(f3,1e-12,1e-12))
118         f4 = mc.ReadFieldCell("MySecondField.med",f.getMesh().getName(),0,f.getName(),9,10)
119         print("Is the field read in file equals to 'f2' ?", f2.isEqual(f4,1e-12,1e-12))
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121 Solution
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124 :ref:`python_testMEDLoaderBasicAPI1_solution`