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[tools/medcoupling.git] / doc / tutorial / medcouplingloaderex1_fr.rst
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2 MEDCoupling / MEDLoader - Exemple complet 1 - Agitateur
3 -------------------------------------------------------
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5 Nous partons ici d'un fichier :download:`agitateur.med <data/agitateur.med>` ayant le contenu suivant :
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7 .. image:: images/agitateur.jpg
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9 Il s'agit du résultat d'un petit calcul diphasique : l'agitateur magnétique en vert (repéré seulement par un champ 
10 aux cellules, et n'ayant *pas* de maillage propre) tourne d'un pas de temps à l'autre au 
11 sein d'une phase liquide. Deux gouttes de liquide chutent pendant ce temps vers l'interface air/eau (en gris).  
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13 Le but de l'exercice est de calculer le couple appliqué sur cet agitateur, qui est la pièce mécanique entraînant la
14 partie basse du fluide.
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16 Objectif
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19 L'objectif est de donner un exemple complet de post-traitement non trivial à partir d'un fichier MED.
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21 Début de l'implémentation
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24 Pour commencer l'exercice importer tout le module python ``MEDLoader`` (qui inclut ``MEDCoupling``). 
25 Importer aussi ``numpy``. ::
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27         import MEDLoader as ml
28         import numpy as np
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30 Extraction des maillages et champs avec l'API avancée
31 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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33 Avec l'API avancée lire tout le fichier "agitateur.med" et afficher tous les pas de temps du 1er champ. ::
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35         data = ml.MEDFileData("agitateur.med")
36         ts = data.getFields()[0].getTimeSteps()
37         print ts
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39 Récupérer le maillage de l'agitateur (en vert) au pas de temps (2,-1) (cf. ts).
40 La position de l'agitateur est définie par un champ sur le maillage global du système et n'a pas de maillage propre.
41 Il faut donc utiliser le champ aux cellules "DISTANCE_INTERFACE_ELEM_BODY_ELEM_DOM"
42 et ne sélectionner que la partie du champ ayant une valeur entre dans ``[0.,1.]``. Mettre les identifiants
43 de cellules correspondant dans ``ids`` : ::
44
45         fMts = data.getFields()["DISTANCE_INTERFACE_ELEM_BODY_ELEM_DOM"]
46         f1ts = fMts[(2,-1)]
47         fMc = f1ts.getFieldAtLevel(ml.ON_CELLS,0)
48         arr = fMc.getArray()
49         arr.getMinMaxPerComponent()      # just to see the field variation range per component
50         ids = arr.findIdsInRange(0.,1.)
51         f2Mc = fMc[ids]
52
53 A l'aide du champ "PRESSION_ELEM_DOM" trouver le champ de pression 3D qu'applique l'agitateur. Mettre le résultat dans
54 ``pressOnAgitateur``. ::
55
56         pressMts = data.getFields()["PRESSION_ELEM_DOM"]
57         press1ts = pressMts[(2,-1)]
58         pressMc = press1ts.getFieldAtLevel(ml.ON_CELLS,0)
59         pressOnAgitateurMc = pressMc[ids]
60
61 Supprimer les noeuds inutiles de ``pressOnAgitateurMc.getMesh()`` : ::
62
63         pressOnAgitateurMc.getMesh().zipCoords()
64
65 Passer d'un champ aux cellules 3D à un champ surfacique 3D
66 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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68 Deduire le champ 3D de pression sur la *peau* de l'agitateur.
69 Pour ce faire passer par le maillage descendant ``MEDCouplingUMesh.buildDescendingConnectivity()``. ::
70
71         agitateurMesh3DMc = pressOnAgitateurMc.getMesh()
72         m3DSurf,desc,descI,revDesc,revDescI = agitateurMesh3DMc.buildDescendingConnectivity()
73         nbOf3DCellSharing = revDescI.deltaShiftIndex()
74         ids2 = nbOf3DCellSharing.findIdsEqual(1)            # Cells with only one neighbor are on the boundary, i.e. on the skin
75         agitateurSkinMc = m3DSurf[ids2]
76         offsetsOfTupleIdsInField = revDescI[ids2]
77         tupleIdsInField = revDesc[offsetsOfTupleIdsInField]
78         pressOnSkinAgitateurMc = pressOnAgitateurMc[tupleIdsInField]
79         pressOnSkinAgitateurMc.setMesh(agitateurSkinMc)
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81 Manipuler les champs
82 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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84 Calculer le champ vectoriel de force sur la peau de l'agitateur en multipliant pour chaque cellule
85 la pression par la surface et ensuite par le vecteur normal.
86 La pression est en bar, la convertir au préalable en pascal (Pa). ::
87
88         pressSkin = pressOnSkinAgitateurMc.getArray()
89         pressSkin *= 1e5                   # conversion from bar to Pa
90         areaSkin = agitateurSkinMc.getMeasureField(True).getArray()  
91         forceSkin = pressSkin*areaSkin
92         normalSkin = agitateurSkinMc.buildOrthogonalField().getArray()
93         forceVectSkin = forceSkin*normalSkin
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95 Voici maintenant le premier calcul du moment au centre de masse de l'agitateur :
96
97 Pour faire ce 1er calcul de couple exercé sur l'agitateur, calculons la position du centre de masse de l'agitateur.
98 Calculer le polyèdre représentant l'enveloppe du maillage 3D de l'agitateur ``agitateurMesh3DMc``
99 (utiliser ``MEDCouplingUMesh.buildSpreadZonesWithPoly()``). ::
100
101         singlePolyhedron = agitateurMesh3DMc.buildSpreadZonesWithPoly()
102         singlePolyhedron.orientCorrectlyPolyhedrons()
103         centerOfMass = singlePolyhedron.computeCellCenterOfMass()
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105 .. note:: L'appel à ``MEDCouplingUMesh.orientCorrectlyPolyhedrons()`` n'est pas obligatoire mais conseillé car 
106         si par malheur le polyhèdre est mal orienté, son barycentre sera incorrect !
107
108 Calculer pour chaque cellule de la peau de l'agitateur le moment par rapport au centre de masse ``centerOfMass``
109 de l'agitateur.
110 Pour ce faire calculer ``posSkin`` le ``DataArrayDouble`` donnant pour chaque cellule de la peau de l'agitateur
111 le vecteur ``centerOfMass`` -> ``G``, avec ``G`` le barycentre de la cellule courante. ::
112
113         barySkin=agitateurSkinMc.computeCellCenterOfMass()
114         posSkin = barySkin-centerOfMass
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116 Appliquer maintenant la formule classique de calcul du moment : calculer le produit 
117 vectoriel par cellule de ``posSkin`` avec ``forceVectSkin`` (méthode ``DataArrayDouble.CrossProduct()``). ::
118
119         torquePerCellOnSkin = ml.DataArrayDouble.CrossProduct(posSkin,forceVectSkin)
120
121 Sommer ``torqueOnSkin`` en utilisant la méthode ``DataArrayDouble.accumulate()``. ::
122
123         zeTorque = torquePerCellOnSkin.accumulate()
124         print "couple = %r N.m" % zeTorque[2]
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126 Vérifions le couple calculé précédemment en divisant la puissance par la vitesse *angulaire*.
127 La vitesse *linéaire* est stockée dans le champ "VITESSE_ELEM_DOM".
128
129 Calculer la puissance par cellule de la peau de l'agitateur et la sommer. ::
130
131         speedMts = data.getFields()["VITESSE_ELEM_DOM"]
132         speed1ts = speedMts[(2,-1)]
133         speedMc = speed1ts.getFieldAtLevel(ml.ON_CELLS,0)
134         speedOnSkin = speedMc.getArray()[tupleIdsInField]
135         powerSkin = ml.DataArrayDouble.Dot(forceVectSkin,speedOnSkin)
136         power = powerSkin.accumulate()[0]
137         print "power = %r W"%(power)
138
139 Calculer la vitesse *angulaire*. Pour ce faire, calculer la somme de ``x^2``, ``y^2`` et ``xz`` de ``posSkin`` et 
140 construire (avec NumPy) la matrice 2x2 d'inertie ``inertiaSkin=[[x2,xy], [xy,z2]]``.
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142 Récupérer le vecteur propre associé à la valeur propre maximale
143 avec ``linalg.eig(inertiaSkin)``. ::
144
145         x2 = posSkin[:,0]*posSkin[:,0]
146         x2 = x2.accumulate()[0]
147         y2 = posSkin[:,1]*posSkin[:,1]
148         y2 = y2.accumulate()[0]
149         xy = posSkin[:,0]*posSkin[:,1]
150         xy = xy.accumulate()[0]
151         inertiaSkin = np.matrix([[x2,xy],[xy,y2]])
152         inertiaSkinValues, inertiaSkinVects = np.linalg.eig(inertiaSkin)
153         pos = max(enumerate(inertiaSkinValues), key=lambda x: x[1])[0]
154         vect0 = inertiaSkinVects[pos].tolist()[0]
155         print vect0
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157 Grâce au calcul précédent on peut déduire que l'agitateur a tourné de 1.1183827931 radian (cf. solution complète pour le
158 détail - on remet les étapes précédentes dans une fonction que l'on applique sur plusieurs pas de temps).
159
160 Calculer et comparer le couple sur l'agitateur. ::
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162         omega = 1.1183827931 / (ts[-1][2]-ts[0][2])
163         print "At timestep (%d,%d) (physical time=%r s) the torque is: %r N.m, power/omega=%r N.m " % (ts[2][0],ts[2][1],ts[2][2],zeTorque[2],power/omega)
164
165 Solution
166 ~~~~~~~~
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168 :ref:`python_testmedcouplingloaderex1_solution`