doc/schemapy.rst

   1
   2 .. _schemapy:
   3
   4 Defining a calculation scheme with the Python programming interface
   5 ============================================================================
   6 A YACS calculation scheme can be defined from a program written in the Python language (http://www.python.org/).
   7 Refer to the `Python tutorial <http://docs.python.org/tut/tut.html>`_ for an introduction to the language.
   8
   9 The programming interface (API) is carried on three Python modules:  pilot, SALOMERuntime and loader.
  10
  11 The SALOMERuntime module is used to initialise YACS for SALOME.
  12
  13 The loader module is used to create calculation schemes by loading files in the XML format.
  14
  15 The pilot module is used to create calculation schemes.
  16
  17 These modules must be imported at the beginning of the Python program and YACS must be initialised::
  18
  19     import sys
  20     import pilot
  21     import SALOMERuntime
  22     import loader
  23     SALOMERuntime.RuntimeSALOME_setRuntime()
  24
  25 Before YACS modules can be imported, the environment must be correctly configured, as it will be if the
  26 SALOME application is used.  Otherwise, the PYTHONPATH environment variable has to be set to
  27 <YACS_ROOT_DIR>/lib/pythonX.Y/site-packages/salome.
  28
  29 When you build your own Salome application and use your own modules and components (using YACSGEN for example), you may need to load
  30 the module catalog::
  31
  32     import SALOMERuntime
  33     SALOMERuntime.RuntimeSALOME_setRuntime()
  34     salome_runtime = SALOMERuntime.getSALOMERuntime()
  35     import salome
  36     salome.salome_init()
  37     mc = salome.naming_service.Resolve('/Kernel/ModulCatalog')
  38     ior = salome.orb.object_to_string(mc)
  39     session_catalog = salome_runtime.loadCatalog("session", ior)
  40     salome_runtime.addCatalog(session_catalog)
  41
  42
  43 .. _loadxml:
  44
  45 Create a calculation scheme by loading an XML file
  46 --------------------------------------------------------------
  47 This is the easiest way of creating a calculation scheme.  If there is a file conforming with the YACS syntax (see :ref:`schemaxml`),
  48 then all that is necessary is to create an XML file loader and then to use its load method to obtain a calculation scheme object in Python.
  49
  50 The following shows the sufficient Python code to load an XML file::
  51
  52   xmlLoader = loader.YACSLoader()
  53   try:
  54     p = xmlLoader.load("simple1.xml")
  55   except IOError,ex:
  56     print "IO exception:",ex
  57     sys.exit(1)
  58
  59 Then, if the initialisation code and the loading code are put into a file named testLoader.py, proceed as follows::
  60
  61   python testLoader.py
  62
  63 to execute the program.  The IOError exception can be raised by the loading operation principally if the file does not exist
  64 or if it cannot be read.  If no exception has been raised, it is necessary to make sure that the file analysis took place correctly.
  65 This is done using the Logger object associated with the calculation scheme::
  66
  67    logger=p.getLogger("parser")
  68    if not logger.isEmpty():
  69      print "The imported file has errors :"
  70      print logger.getStr()
  71      sys.exit(1)
  72
  73 Finally, if the file analysis took place correctly, the validity of the scheme (completeness of connections, no unconnected
  74 input port, etc.) has to be checked.  This is done using the isValid method of the calculation scheme object, and
  75 then the p.checkConsistency method of this object as below::
  76
  77    if not p.isValid():
  78      print "The schema is not valid and can not be executed"
  79      print p.getErrorReport()
  80      sys.exit(1)
  81
  82    info=pilot.LinkInfo(pilot.LinkInfo.ALL_DONT_STOP)
  83    p.checkConsistency(info)
  84    if info.areWarningsOrErrors():
  85      print "The schema is not consistent and can not be executed"
  86      print info.getGlobalRepr()
  87      sys.exit(1)
  88
  89
  90 If all these tests took place correctly, the scheme is ready to be executed (see :ref:`execpy`).
  91
  92 Create a calculation scheme from scratch
  93 -------------------------------------------
  94 We will use the same sequence as in :ref:`schemaxml`.
  95 The first step is to obtain the runtime object that will be used for creation of objects making up the scheme, before they are created::
  96
  97   r = pilot.getRuntime()
  98
  99 Creating an empty scheme
 100 ''''''''''''''''''''''''''''
 101 An empty scheme is obtained using the createProc method of the runtime object with the name of the scheme as an argument::
 102
 103   p=r.createProc("pr")
 104
 105 The scheme object named “pr” was created.  It is represented by the Python variable p.
 106
 107 Definition of data types
 108 '''''''''''''''''''''''''''''''''
 109
 110 .. _basictypes:
 111
 112 Basic types
 113 ++++++++++++++++
 114 A basic type cannot be defined.  These types are defined by YACS.  However, it must be possible to retrieve a Python object
 115 equivalent to a basic type so as to be able to subsequently create ports.
 116
 117 A basic data type is recovered using the getTypeCode method in the calculation scheme with the name of the type as an argument.
 118 For example::
 119
 120    td=p.getTypeCode("double")
 121
 122 will obtain a double type (Python td object).  Other basic types are obtained by::
 123
 124    ti=p.getTypeCode("int")
 125    ts=p.getTypeCode("string")
 126    tb=p.getTypeCode("bool")
 127    tf=p.getTypeCode("file")
 128
 129 Object reference
 130 +++++++++++++++++++++
 131 The createInterfaceTc method in the calculation scheme is used to define an object reference type.
 132 This method accepts three arguments:  the repository id of the corresponding SALOME object, the name of the type, and a
 133 list of types that will be basic types of this type.  If the repository id is equal to “”, the default value will be used.
 134
 135 The following is a minimal example for a reference definition of an object name Obj (default repository id, no basic type)::
 136
 137   tc1=p.createInterfaceTc("","Obj",[])
 138
 139 The same Obj type can be defined giving the repository id::
 140
 141   tc1=p.createInterfaceTc("IDL:GEOM/GEOM_Object","Obj",[])
 142
 143 A list of basic types is also provided so as to define a reference object type derived from another type.
 144
 145 The following gives a definition of the MyObj type derived from the Obj type::
 146
 147   tc2=p.createInterfaceTc("","MyObj",[tc1])
 148
 149 Sequence
 150 +++++++++++++++++++++
 151 The createSequenceTc method in the calculation scheme is used to define a sequence type.
 152 This method accepts three arguments, namely the repository id, the type name, and the type of elements in the sequence.
 153 There is generally no point in specifying the repository id.  The value “” will be given.
 154
 155 The following gives an example definition of the seqdbl double sequence type::
 156
 157   tc3=p.createSequenceTc("","seqdbl",td)
 158
 159 td is the double type that is obtained as above in the section on :ref:`basictypes`.
 160
 161 A sequence type of sequence is defined as follows::
 162
 163   tc4=p.createSequenceTc("","seqseqdbl",tc3)
 164
 165 A reference sequence type is defined as follows::
 166
 167   tc5=p.createSequenceTc("","seqobj",tc1)
 168
 169 Structure
 170 ++++++++++++
 171 A structure type is defined using the createStructTc method in the calculation scheme.
 172 This method accepts two arguments, namely the repository id and the type name.  For standard use, the repository id is
 173 equal to the value “”.  The structure type is the only type that is defined in two steps.  It is created empty after
 174 calling the createStructTc method.  Its members are then defined by adding them with the addMember method.
 175
 176 The following shows an example definition of an s1 type structure with 2 members (m1 and m2) of the double and double sequence types::
 177
 178   ts1=p.createStructTc("","s1")
 179   ts1.addMember("m1",td)
 180   ts1.addMember("m2",tc3)
 181
 182 Retrieve predefined types
 183 +++++++++++++++++++++++++++++++++
 184 By default, YACS only defines the basic types.  If more predefined types are required, they must be requested from SALOME.
 185 These other predefined types are contained in module catalogs such as GEOM or SMESH.
 186
 187 The following code sequence is used to obtain an image of SALOME catalogs in YACS::
 188
 189   try:
 190     cata=r.loadCatalog("session",
 191            "corbaname::localhost:2810/NameService#Kernel.dir/ModulCatalog.object")
 192   except CORBA.TRANSIENT,ex:
 193     print "Unable to contact server:",ex
 194   except CORBA.SystemException,ex:
 195     print ex,CORBA.id(ex)
 196
 197 The SALOME application must be running before the catalog is accessible.
 198 Predefined types are then accessible in the cata._typeMap dictionary.
 199 If the name of the required type is known (for example ‘GEOM_Shape’), it is obtained as follows::
 200
 201   tgeom=cata._typeMap['GEOM_Shape']
 202
 203 .. _typedict:
 204
 205 Add a type into the scheme types dictionary
 206 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
 207 Some operations require that types are defined in the scheme dictionary.  Proceed as follows if you want to add a type
 208 into the dictionary, for example for the seqobj type defined above::
 209
 210   p.typeMap["seqobj"]=tc5
 211
 212 where the type name is the dictionary key and the type is the value.
 213
 214 Definition of elementary calculation nodes
 215 ''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
 216
 217 .. _pyscript:
 218
 219 Python script node
 220 +++++++++++++++++++++
 221 Several steps are used to define a script node in a given context (for example the calculation scheme).
 222 The first step consists of creating the node object by calling the runtime createScriptNode method.
 223 This method uses 2 arguments, the first of which in standard use must be equal to “” and the second is the node name.
 224 The following is an example to create node node1::
 225
 226   n=r.createScriptNode("","node1")
 227
 228 The second step consists of attaching the node to its definition context by calling the edAddChild method for the context object.
 229 This method has one argument, namely the node to be attached.  The following is an example of the attachment of the node node1
 230 to the calculation scheme::
 231
 232   p.edAddChild(n)
 233
 234 Warning: the name of the method to be used depends on the type of context node.  We will see which method should be used for other
 235 node types later.
 236
 237 The third step consists of defining the Python script associated with the node.  This is done using the setScript method for the node
 238 with a character string argument that contains the Python code.  The following shows an example definition of the associated code::
 239
 240   n.setScript("p1=p1+2.5")
 241
 242 The fourth step consists of defining input and output data ports.  An input port is created by calling the edAddInputPort method
 243 for the node.  An output port is created by calling the edAddOutputPort method for the node.
 244 These two methods have two arguments:  the port name and the port data type.  The following is an example creating a double
 245 type input port p1 and a double type output port p1::
 246
 247   n.edAddInputPort("p1",td)
 248   n.edAddOutputPort("p1",td)
 249
 250 Our node is now fully defined with its name, script, ports and context.  It retrieves the double in the input port p1, adds 2.5 to it
 251 and puts the result into the output port p1.
 252
 253 If you want to execute your script node on a remote container, you have to set the execution mode of the node to **remote**
 254 and to assign a container (see :ref:`py_container` to define a container) to the node as in the following example::
 255
 256   n.setExecutionMode("remote")
 257   n.setContainer(cont1)
 258
 259 .. _pyfunc:
 260
 261 Python function node
 262 ++++++++++++++++++++++
 263 The same procedure is used to define a function node.  The only differences apply to creation, in using the createFuncNode
 264 method and defining the function:  the setFname method must also be called to give the name of the function to be executed.
 265 The following is a complete example for the definition of a function node that is functionally identical to the previous script node::
 266
 267   n2=r.createFuncNode("","node2")
 268   p.edAddChild(n2)
 269   n2.setScript("""
 270   def f(p1):
 271     p1=p1+2.5
 272     return p1
 273   """)
 274   n2.setFname("f")
 275   n2.edAddInputPort("p1",td)
 276   n2.edAddOutputPort("p1",td)
 277
 278 If you want to execute your function node on a remote container, you have to set the execution mode of the node to **remote**
 279 and to assign a container (see :ref:`py_container` to define a container) to the node as in the following example::
 280
 281   n2.setExecutionMode("remote")
 282   n2.setContainer(cont1)
 283
 284 .. _pyservice:
 285
 286 SALOME service node
 287 ++++++++++++++++++++++++++
 288 There are two definition forms for a SALOME service node.
 289
 290 The first form in which the component name is given, uses the createCompoNode method to create the node.  The name of the
 291 component is given as an argument to the setRef method for the node.  The service name is given as an argument for the
 292 setMethod method for the node.  The remainder of the definition is exactly the same as for the previous Python nodes.
 293
 294 The following is an example of a node that calls the makeBanner service for a PYHELLO component::
 295
 296   n3=r.createCompoNode("","node3")
 297   p.edAddChild(n3)
 298   n3.setRef("PYHELLO")
 299   n3.setMethod("makeBanner")
 300   n3.edAddInputPort("p1",ts)
 301   n3.edAddOutputPort("p1",ts)
 302
 303 The second form is used to define a node that uses the same component as another node uses the createNode method of this other node.
 304 This method only has one argument, which is the node name.
 305 The remainder of the definition is identical to the definition for the previous form.
 306
 307 The following gives an example of a service node that makes a second call to the makeBanner service for the same component
 308 instance as the previous node::
 309
 310   n4=n3.createNode("node4")
 311   p.edAddChild(n4)
 312   n4.setMethod("makeBanner")
 313   n4.edAddInputPort("p1",ts)
 314   n4.edAddOutputPort("p1",ts)
 315
 316 Definition of connections
 317 ''''''''''''''''''''''''''''
 318 Obtaining a node port
 319 ++++++++++++++++++++++++++++
 320 Before links can be defined, it is almost always necessary to have Python objects representing the output port to be
 321 connected to the input port.  There are two ways of obtaining this object.
 322
 323 The first way is to retrieve the port when it is created using the edAddInputPort and edAddOutputPort methods.
 324 For example, we can then write::
 325
 326   pin=n4.edAddInputPort("p1",ts)
 327   pout=n4.edAddOutputPort("p1",ts)
 328
 329 pin and pout are then the objects necessary to define links.
 330
 331 The second way is to interrogate the node and ask it for one of its ports by its name.
 332 This is done using the getInputPort and getOutputPort methods.
 333 pin and pout can then be obtained as follows::
 334
 335   pin=n4.getInputPort("p1")
 336   pout=n4.getOutputPort("p1")
 337
 338 Control link
 339 ++++++++++++++++++++++++++++
 340 The edAddCFLink method for the context is used to define a control link between two nodes, transferring the two nodes to be
 341 connected to it as arguments.  For example, a control link between nodes n3 and n4 will be written::
 342
 343   p.edAddCFLink(n3,n4)
 344
 345 Node n3 will be executed before node n4.
 346
 347 Dataflow link
 348 ++++++++++++++++++++++++++++
 349 The first step in defining a dataflow link is to obtain port objects using one of the methods described above.
 350 Then, the edAddLink method links an output port to an input port::
 351
 352   pout=n3.getOutputPort("p1")
 353   pin=n4.getInputPort("p1")
 354   p.edAddLink(pout,pin)
 355
 356 Most of the time, when you need a dataflow link between two ports, you also need a control link between the nodes
 357 of the ports. In this case you can use the method edAddDFLink::
 358
 359   pout=n3.getOutputPort("p1")
 360   pin=n4.getInputPort("p1")
 361   p.edAddDFLink(pout,pin)
 362
 363 edAddDFLink is equivalent to edAddCFLink followed by edAddLink.
 364
 365 Initialising an input data port
 366 '''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
 367 An input data port is initialised firstly by obtaining the corresponding port object.  There are then two methods of initialising it.
 368
 369 The first method initialises the port with a value encoded in XML-RPC.  The edInitXML method for the port is then used.
 370 The following is an example that initialises the port with the integer value 5::
 371
 372   pin.edInitXML("<value><int>5</int></value>")
 373
 374 The second method initialises the port with a Python value.  The edInitPy method is then used.
 375 The following is an example that initialises this port with the same value::
 376
 377   pin.edInitPy(5)
 378
 379 Specific methods can also be used for basic types:
 380
 381 - ``edInitInt`` for the int type
 382 - ``edInitDbl`` for the double type
 383 - ``edInitBool`` for the bool type
 384 - ``edInitString`` for the string type
 385
 386 First example starting from the previous elements
 387 '''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
 388 By collecting all previous definition elements, a complete calculation scheme identical to that given in the :ref:`schemaxml` chapter
 389 will appear as follows::
 390
 391   import sys
 392   import pilot
 393   import SALOMERuntime
 394   import loader
 395   SALOMERuntime.RuntimeSALOME_setRuntime()
 396   r = pilot.getRuntime()
 397   p=r.createProc("pr")
 398   ti=p.getTypeCode("int")
 399   td=p.getTypeCode("double")
 400   #node1
 401   n1=r.createScriptNode("","node1")
 402   p.edAddChild(n1)
 403   n1.setScript("p1=p1+10")
 404   n1.edAddInputPort("p1",ti)
 405   n1.edAddOutputPort("p1",ti)
 406   #node2
 407   n2=r.createScriptNode("","node2")
 408   p.edAddChild(n2)
 409   n2.setScript("p1=2*p1")
 410   n2.edAddInputPort("p1",ti)
 411   n2.edAddOutputPort("p1",ti)
 412   #node4
 413   n4=r.createCompoNode("","node4")
 414   p.edAddChild(n4)
 415   n4.setRef("ECHO")
 416   n4.setMethod("echoDouble")
 417   n4.edAddInputPort("p1",td)
 418   n4.edAddOutputPort("p1",td)
 419   #control links
 420   p.edAddCFLink(n1,n2)
 421   p.edAddCFLink(n1,n4)
 422   #dataflow links
 423   p.edAddLink(n1.getOutputPort("p1"),n2.getInputPort("p1"))
 424   p.edAddLink(n1.getOutputPort("p1"),n4.getInputPort("p1"))
 425   #initialisation ports
 426   n1.getInputPort("p1").edInitPy(5)
 427
 428 Definition of composite nodes
 429 '''''''''''''''''''''''''''''''''
 430
 431 .. _py_block:
 432
 433 Block
 434 +++++++
 435 A block is defined using the runtime createBloc method transferring the Block name to it as an argument.  The node is then
 436 attached to its definition context as an elementary node.  The following is an example Block definition in a calculation scheme::
 437
 438   b=r.createBloc("b1")
 439   p.edAddChild(b)
 440
 441 Once the block has been created, all nodes and links possible in its context can be added.
 442 Repeating a part of the example above, we will get::
 443
 444   n1=r.createScriptNode("","node1")
 445   b.edAddChild(n1)
 446   n1.setScript("p1=p1+10")
 447   n1.edAddInputPort("p1",ti)
 448   n1.edAddOutputPort("p1",ti)
 449   n2=r.createScriptNode("","node2")
 450   b.edAddChild(n2)
 451   n2.setScript("p1=2*p1")
 452   n2.edAddInputPort("p1",ti)
 453   n2.edAddOutputPort("p1",ti)
 454   b.edAddDFLink(n1.getOutputPort("p1"),n2.getInputPort("p1"))
 455
 456 .. _py_forloop:
 457
 458 ForLoop
 459 ++++++++
 460 A Forloop is defined using the runtime createForLoop method, transferring the node name to it as an argument.
 461 The node is then attached to its definition context.  The following is an example ForLoop definition in a calculation scheme::
 462
 463   l=r.createForLoop("l1")
 464   p.edAddChild(l)
 465
 466 The number of iterations in the loop to be executed will be initialised using the “nsteps” port that is initialised
 467 with an integer.  For example::
 468
 469   ip=l.getInputPort("nsteps")
 470   ip.edInitPy(3)
 471
 472 There is a special method for obtaining the “nsteps” port for the loop, namely edGetNbOfTimesInputPort.  Therefore, it can also be
 473 written as follows::
 474
 475   ip=l.edGetNbOfTimesInputPort()
 476   ip.edInitPy(3)
 477
 478 Finally, a method called edSetNode will be used in the context of a loop, instead of the edAddChild method, so as to add one (and only one) node.
 479 The following is a small example definition of a node inside a loop::
 480
 481   n1=r.createScriptNode("","node1")
 482   l.edSetNode(n1)
 483   n1.setScript("p1=p1+10")
 484   n1.edAddInputPort("p1",ti)
 485   n1.edAddOutputPort("p1",ti)
 486
 487 .. _py_whileloop:
 488
 489 WhileLoop
 490 ++++++++++
 491 WhileLoop node is defined in practically the same way as a ForLoop node.  The only differences apply to creation and assignment
 492 of the end of loop condition.  The createWhileLoop method is used for creation.  The “condition” port is used for the condition.
 493 If looping takes place on a node, it is important to use a data link instead of a dataflow link.
 494 The following is an example of WhileLoop node definition with a Python script internal node.
 495 The condition is initialised to True and is then changed to False by the internal node.  This results in a link loop::
 496
 497   wh=r.createWhileLoop("w1")
 498   p.edAddChild(wh)
 499   n=r.createScriptNode("","node3")
 500   n.setScript("p1=0")
 501   n.edAddOutputPort("p1",ti)
 502   wh.edSetNode(n)
 503   cport=wh.getInputPort("condition")
 504   cport.edInitBool(True)
 505   p.edAddLink(n.getOutputPort("p1"),cport)
 506
 507 There is a special method for obtaining the loop “condition” port:  edGetConditionPort.
 508
 509 .. _py_foreachloop:
 510
 511 ForEach loop
 512 ++++++++++++++++
 513 A ForEach node is basically defined in the same way as any other loop node.  There are several differences.
 514 The node is created with the createForEachLoop method that has an additional argument, namely the data type managed by the ForEach.
 515 The number of ForEach branches is specified with the “nbBranches” port.  The collection on which the ForEach iterates is managed by
 516 connection of the “evalSamples” and “SmplsCollection” ports.
 517
 518 The following is an example definition of the ForEach node with a Python script internal node that increments
 519 the element of the collection by 3::
 520
 521   fe=r.createForEachLoop("fe1",td)
 522   p.edAddChild(fe)
 523   n=r.createScriptNode("","node3")
 524   n.setScript("p1=p1+3.")
 525   n.edAddInputPort("p1",td)
 526   n.edAddOutputPort("p1",td)
 527   fe.edSetNode(n)
 528   p.edAddLink(fe.getOutputPort("evalSamples"),n.getInputPort("p1"))
 529   fe.getInputPort("nbBranches").edInitPy(3)
 530   fe.getInputPort("SmplsCollection").edInitPy([2.,3.,4.])
 531
 532 Special ports for the ForEach can be obtained using the following methods instead of getInputPort and getOutputPort:
 533
 534 - edGetNbOfBranchesPort for the “nbBranches” port
 535 - edGetSamplePort for the “evalSamples” port
 536 - edGetSeqOfSamplesPort for the “SmplsCollection” port
 537
 538 .. _py_switch:
 539
 540 Switch
 541 ++++++++
 542 A switch node is defined in several steps.  The first two steps are creation and attachment to the context node.
 543 The node is created by calling the runtime createSwitch method with the name of the node as an argument.  The node is attached
 544 to the context node by calling the edAddChild method for a scheme or a block or edSetNode for a loop node.
 545
 546 The following is an example of a creation followed by an attachment::
 547
 548   sw=r.createSwitch("sw1")
 549   p.edAddChild(sw)
 550
 551 The next step is to create an internal elementary or composite node by case.  The node for the default case is attached to
 552 the switch using the edSetDefaultNode method.  Nodes for other cases are attached to the switch using the edSetNode method, in
 553 which the first argument is equal to the value of the case (integer) and the second argument is equal to the internal node.
 554
 555 The following is an example of a switch with one script node for case “1” and another script node for the “default” case
 556 and a script node to initialise an exchanged variable::
 557
 558   #init
 559   n=r.createScriptNode("","node3")
 560   n.setScript("p1=3.5")
 561   n.edAddOutputPort("p1",td)
 562   p.edAddChild(n)
 563   #switch
 564   sw=r.createSwitch("sw1")
 565   p.edAddChild(sw)
 566   nk1=r.createScriptNode("","ncas1")
 567   nk1.setScript("p1=p1+3.")
 568   nk1.edAddInputPort("p1",td)
 569   nk1.edAddOutputPort("p1",td)
 570   sw.edSetNode(1,nk1)
 571   ndef=r.createScriptNode("","ndefault")
 572   ndef.setScript("p1=p1+5.")
 573   ndef.edAddInputPort("p1",td)
 574   ndef.edAddOutputPort("p1",td)
 575   sw.edSetDefaultNode(ndef)
 576   #initialise the select port
 577   sw.getInputPort("select").edInitPy(1)
 578   #connection of internal nodes
 579   p.edAddDFLink(n.getOutputPort("p1"),nk1.getInputPort("p1"))
 580   p.edAddDFLink(n.getOutputPort("p1"),ndef.getInputPort("p1"))
 581
 582 The edGetConditionPort method can be used instead of getInputPort, to obtain the special “select” port for the Switch.
 583
 584 .. _py_optimizerloop:
 585
 586 OptimizerLoop
 587 +++++++++++++++++++
 588
 589 The following is an example of OptimizerLoop with one python script as internal node. The algorithm
 590 is defined by the class async in the python module myalgo2.py::
 591
 592   ol=r.createOptimizerLoop("ol1","myalgo2.py","async",True)
 593   p.edAddChild(ol)
 594   n=r.createScriptNode("","node3")
 595   n.setScript("p1=3")
 596   n.edAddInputPort("p1",td)
 597   n.edAddOutputPort("p1",ti)
 598   ol.edSetNode(n)
 599   ol.getInputPort("nbBranches").edInitPy(3)
 600   ol.getInputPort("algoInit").edInitPy("coucou")
 601   p.edAddLink(ol.getOutputPort("evalSamples"),n.getInputPort("p1"))
 602   p.edAddLink(n.getOutputPort("p1"),ol.getInputPort("evalResults"))
 603
 604 .. _py_container:
 605
 606 Definition of containers
 607 ''''''''''''''''''''''''''''
 608 A container is defined using the runtime createContainer method and it is then given a name using its setName method.
 609 The next step is to assign constraints to it by adding properties.
 610 The following is an example creation of a container named “A”::
 611
 612   c1=r.createContainer()
 613   c1.setName("A")
 614
 615 A property is added to a container using its setProperty method that uses 2 arguments (character strings).
 616 The first is the property name.  The second is its value.
 617 The following is an example of this container “A” with constraints::
 618
 619   c1=r.createContainer()
 620   c1.setName("A")
 621   c1.setProperty("container_name","FactoryServer")
 622   c1.setProperty("hostname","localhost")
 623   c1.setProperty("mem_mb","1000")
 624
 625 Once the containers have been defined, SALOME components can be placed on this container.  The first step to place the component
 626 of a SALOME service node is to obtain the component instance of this service node using the getComponent method for this node.
 627 The previously defined container is then assigned to this component instance using the setContainer method of the component instance.
 628
 629 If it is required to place the SALOME service defined above (node “node3”) on container “A”, we will write::
 630
 631   n3.getComponent().setContainer(c1)
 632
 633 Node properties
 634 '''''''''''''''''''''''''''
 635 A property is added to an elementary or composite node (or is modified) using its setProperty method that has two
 636 arguments (character strings).  The first is the name of the property.  The second is its value.
 637 The following is an example for the previous node “node3”::
 638
 639   n3.setProperty("VERBOSE","2")
 640
 641 Datastream connections
 642 '''''''''''''''''''''''''''
 643 Datastream connections are only possible for SALOME service nodes as we have seen in :ref:`principes`.
 644 We firstly need to define the datastream ports in the service node.  An input datastream port is defined using
 645 the edAddInputDataStreamPort method.  An output datastream port is defined using the edAddOutputDataStreamPort method.
 646 These methods use the port name and the datastream type as arguments.
 647
 648 Some datastream ports (for example CALCIUM ports) must be configured with properties.  The port setProperty method will
 649 be used to configure them.
 650 The following is an example definition of the SALOME service node with datastream ports.  This is the DSCCODC component
 651 located in the DSCCODES module in the EXAMPLES base.  The datastream ports are of the “CALCIUM_integer” type
 652 with time dependency::
 653
 654   calcium_int=cata._typeMap['CALCIUM_integer']
 655   n5=r.createCompoNode("","node5")
 656   p.edAddChild(n5)
 657   n5.setRef("DSCCODC")
 658   n5.setMethod("prun")
 659   pin=n5.edAddInputDataStreamPort("ETP_EN",calcium_int)
 660   pin.setProperty("DependencyType","TIME_DEPENDENCY")
 661   pout=n5.edAddOutputDataStreamPort("STP_EN",calcium_int)
 662   pout.setProperty("DependencyType","TIME_DEPENDENCY")
 663
 664 Once the service nodes have been provided with datastream ports, all that remains is to connect them.
 665 This connection is made using the edAddLink method for the context node in the same way as for data links.
 666 The only difference is the type of ports transferred as arguments.
 667
 668 To complete our example, we will define a second service node and connect the datastream ports for these services::
 669
 670   n6=r.createCompoNode("","node6")
 671   p.edAddChild(n6)
 672   n6.setRef("DSCCODD")
 673   n6.setMethod("prun")
 674   pin=n6.edAddInputDataStreamPort("ETP_EN",calcium_int)
 675   pin.setProperty("DependencyType","TIME_DEPENDENCY")
 676   pout=n6.edAddOutputDataStreamPort("STP_EN",calcium_int)
 677   pout.setProperty("DependencyType","TIME_DEPENDENCY")
 678   p.edAddLink(n5.getOutputDataStreamPort("STP_EN"),n6.getInputDataStreamPort("ETP_EN"))
 679   p.edAddLink(n6.getOutputDataStreamPort("STP_EN"),n5.getInputDataStreamPort("ETP_EN"))
 680
 681 Other elementary nodes
 682 '''''''''''''''''''''''''''''''
 683 SalomePython node
 684 +++++++++++++++++++
 685 A SalomePython node is defined in practically exactly the same way as a :ref:`pyfunc`.  The runtime createSInlineNode method is used
 686 instead of the createFuncNode and information about placement on a container is added in the same way as for a
 687 SALOME service node (setContainer method).
 688
 689 The following is an example similar to that given in :ref:`schemaxml`::
 690
 691   n2=r.createSInlineNode("","node2")
 692   p.edAddChild(n2)
 693   n2.setScript("""
 694   import salome
 695   salome.salome_init()
 696   import PYHELLO_ORB
 697   def f(p1):
 698     print __container__from__YACS__
 699     machine,container=__container__from__YACS__.split('/')
 700     param={'hostname':machine,'container_name':container}
 701     compo=salome.lcc.LoadComponent(param, "PYHELLO")
 702     print compo.makeBanner(p1)
 703     print p1
 704   """)
 705   n2.setFname("f")
 706   n2.edAddInputPort("p1",ts)
 707   n2.getComponent().setContainer(c1)
 708
 709 .. _py_datain:
 710
 711 DataIn node
 712 +++++++++++++++
 713 A DataIn node is defined using the runtime createInDataNode method.  It uses two arguments, the first of which must be “” and
 714 the second the node name.  Node data are defined by adding output data ports to it using the edAddOutputPort method
 715 and transferring the data name and its type to it as arguments.
 716 The value of the data is initialised using the port setData method thus created by transferring the value encoded in
 717 XML-RPC to it (see :ref:`initialisation`).
 718
 719 The following is an example of the DataIn node that defines 2 double type data (b and c) and one file type data (f)::
 720
 721   n=r.createInDataNode("","data1")
 722   p.edAddChild(n)
 723   pout=n.edAddOutputPort('a',td)
 724   pout.setData("<value><double>-1.</double></value>")
 725   pout=n.edAddOutputPort('b',td)
 726   pout.setData("<value><double>5.</double></value>")
 727   pout=n.edAddOutputPort('f',tf)
 728   pout.setData("<value><objref>f.data</objref></value>")
 729
 730 A value can be directly assigned to a data with a Python object, using the setDataPy method.  Example for a sequence::
 731
 732   pout.setDataPy([1.,5.])
 733
 734 .. _py_dataout:
 735
 736 DataOut node
 737 +++++++++++++++++
 738 A DataOut node is defined using the runtime createOutDataNode method.  It uses two arguments, the first of which
 739 must be “” and the second the node name .  Node results are defined by adding input data ports to it using the edAddInputPort
 740 method with the result name and its type as arguments.  The results are saved in a file using the node setRef method with the
 741 file name as an argument.
 742 A result file is copied into a local file using the setData method for the port corresponding to the result with the
 743 file name as an argument.
 744
 745 The following is an example of the DataOut node that defines different types (double, int, string, doubles vector, file) of
 746 results (a, b, c, d, f) and writes the corresponding values in the g.data file.
 747 The result file will be copied into the local file myfile::
 748
 749   n=r.createOutDataNode("","data2")
 750   n.setRef("g.data")
 751   p.edAddChild(n)
 752   n.edAddInputPort('a',td)
 753   n.edAddInputPort('b',ti)
 754   n.edAddInputPort('c',ts)
 755   n.edAddInputPort('d',tc3)
 756   pin=n.edAddInputPort('f',tf)
 757   pin.setData("monfich")
 758
 759 .. _py_studyin:
 760
 761 StudyIn node
 762 ++++++++++++++
 763 A StudyIn node is defined using the runtime createInDataNode method.  It uses two arguments, the first of which must be “study”
 764 and the second the node name.  The associated study is specified by adding the “StudyID” property to the node using
 765 its setProperty method.  Node data are defined by adding output data ports using the edAddOutputPOrt method, transferring
 766 the name of the data and its type as arguments.  The data is initialised with the reference in the study, using the setData method
 767 for the port thus created, transferring a character string to it containing either the SALOME Entry or the path in the study
 768 tree structure.
 769
 770 The following is an example of the StudyIn node that defines 2 GEOM_Object type data (a and b).  The study is assumed to be
 771 loaded into memory by SALOME as StudyID 1.  Data a is referenced by one SALOME Entry.  Data b is referenced by a path in the
 772 study tree structure::
 773
 774   n=r.createInDataNode("study","study1")
 775   p.edAddChild(n)
 776   n.setProperty("StudyID","1")
 777   pout=n.edAddOutputPort('a',tgeom)
 778   pout.setData("0:1:1:1")
 779   pout=n.edAddOutputPort('b',tgeom)
 780   pout.setData("/Geometry/Sphere_1")
 781
 782 .. _py_studyout:
 783
 784 StudyOut node
 785 ++++++++++++++
 786 A StudyOut node is defined using the runtime createOutDataNode method.  It uses two arguments, the first of
 787 which must be “study” and the second the node name.  The associated study is specified by adding
 788 the “StudyID” property to the node using its setProperty method.  The name of the file in which the study will be
 789 saved is specified using the node SetRef method with the file name as an argument.
 790 The node results are defined by adding input data ports to it using the edAddInputPort method, transferring the data name
 791 and type as arguments.  The setData method for the port is used to associate the entry into the study to the result, transferring
 792 a character string to it that contains either the SALOME Entry or the path in the study tree structure.
 793
 794 The following contains an example of the StudyOut node that defines two GEOM_Object type results (a and b).
 795 The studyId of the study used is 1.  Result a is referenced by a SALOME Entry.  The result b is referenced by a path.
 796 The complete study is saved in the study1.hdf file at the end of the calculation::
 797
 798   n=r.createOutDataNode("study","study2")
 799   n.setRef("study1.hdf")
 800   p.edAddChild(n)
 801   n.setProperty("StudyID","1")
 802   pout=n.edAddInputPort('a',tgeom)
 803   pout.setData("0:1:2:1")
 804   pout=n.edAddInputPort('b',tgeom)
 805   pout.setData("/Save/Sphere_2")
 806
 807 Save a calculation scheme in an XML file
 808 ------------------------------------------------------
 809 A calculation scheme is saved in a file in the XML format using the saveSchema method for the calculation
 810 scheme, transferring the file name to it as an argument.  Before a calculation scheme constructed under Python
 811 can be saved in a consistent form in an XML file, all types defined in Python have to be added to the scheme types
 812 dictionary (see :ref:`typedict`).  The save will not do this automatically.
 813
 814 Proceed as follows to save the scheme p constructed above in the myscheme.xml file::
 815
 816   p.saveSchema("monschema.xml")
 817
 818 The file thus obtained can then be loaded as in :ref:`loadxml`.
 819
 820 Several useful operations
 821 ------------------------------
 822
 823 Finding a node by its name
 824 '''''''''''''''''''''''''''''''''''
 825 A node (Python object) can be found, when all that is available is the calculation scheme object and
 826 the absolute name of the node, by calling the scheme getChildByName method, transferring the absolute name to it.
 827
 828 To find the Python script node defined in :ref:`pyscript`::
 829
 830   n=p.getChildByName("node1")
 831
 832 To find node “node1” node in block “b1”::
 833
 834   n=p.getChildByName("b1.node1")
 835
 836 This operation can also be used starting from a composite node provided that the relative node name is used.
 837 The previous example can be rewritten::
 838
 839   n=b.getChildByName("node1")
 840
 841 Finding a port by its name
 842 '''''''''''''''''''''''''''''''''''
 843 The first step to find a node port by its name is to retrieve the node by its name.  An input data port is then found
 844 using the getInputPort method, and an output data port is found using the getOutputPort method.
 845
 846 The following is an example starting from the previous node n::
 847
 848   pin=n.getOutputPort("p1")
 849   pout=n.getInputPort("p2")
 850
 851 Obtaining a port value
 852 '''''''''''''''''''''''''''''''''''
 853 The value of a port is obtained using its getPyObj method.  For example::
 854
 855   print pin.getPyObj()
 856   print pout.getPyObj()
 857
 858 Obtaining the state of a node
 859 '''''''''''''''''''''''''''''''''''
 860 The state of a node is obtained using its getEffectiveState method (see possible values in :ref:`etats`).
 861
 862 Removing a node from its context
 863 '''''''''''''''''''''''''''''''''''
 864 A node can be removed from its context node using a context method.  The method name will be different
 865 depending on the context type.
 866
 867 - For a block or a calculation scheme, the edRemoveChild method will be used with the node to be removed as an argument::
 868
 869     p.edRemoveChild(n)
 870
 871 - For a loop (ForLoop, WhileLoop or ForEachLoop) the edRemoveNode method will be used without any argument::
 872
 873     l.edRemoveNode()
 874
 875 - The edRemoveChild method will be used for a Switch, with the internal node concerned as an argument::
 876
 877     sw.edRemoveChild(nk1)
 878