doc/schemapy.rst

   1
   2 .. _schemapy:
   3
   4 Defining a calculation scheme with the Python programming interface
   5 ============================================================================
   6 A YACS calculation scheme can be defined from a program written in the Python language (http://www.python.org/).
   7 Refer to the `Python tutorial <http://docs.python.org/tut/tut.html>`_ for an introduction to the language.
   8
   9 The programming interface (API) is carried on three Python modules:  pilot, SALOMERuntime and loader.
  10
  11 The SALOMERuntime module is used to initialise YACS for SALOME.
  12
  13 The loader module is used to create calculation schemes by loading files in the XML format.
  14
  15 The pilot module is used to create calculation schemes.
  16
  17 These modules must be imported at the beginning of the Python program and YACS must be initialised::
  18
  19     import sys
  20     import pilot
  21     import SALOMERuntime
  22     import loader
  23     SALOMERuntime.RuntimeSALOME_setRuntime()
  24
  25 Before YACS modules can be imported, the environment must be correctly configured, as it will be if the
  26 SALOME application is used.  Otherwise, the PYTHONPATH environment variable has to be set to
  27 <YACS_ROOT_DIR>/lib/pythonX.Y/site-packages/salome.
  28
  29 .. _loadxml:
  30
  31 Create a calculation scheme by loading an XML file
  32 --------------------------------------------------------------
  33 This is the easiest way of creating a calculation scheme.  If there is a file conforming with the YACS syntax (see :ref:`schemaxml`),
  34 then all that is necessary is to create an XML file loader and then to use its load method to obtain a calculation scheme object in Python.
  35
  36 The following shows the sufficient Python code to load an XML file::
  37
  38   xmlLoader = loader.YACSLoader()
  39   try:
  40     p = xmlLoader.load("simple1.xml")
  41   except IOError,ex:
  42     print "IO exception:",ex
  43     sys.exit(1)
  44
  45 Then, if the initialisation code and the loading code are put into a file named testLoader.py, proceed as follows::
  46
  47   python testLoader.py
  48
  49 to execute the program.  The IOError exception can be raised by the loading operation principally if the file does not exist
  50 or if it cannot be read.  If no exception has been raised, it is necessary to make sure that the file analysis took place correctly.
  51 This is done using the Logger object associated with the calculation scheme::
  52
  53    logger=p.getLogger("parser")
  54    if not logger.isEmpty():
  55      print "The imported file has errors :"
  56      print logger.getStr()
  57      sys.exit(1)
  58
  59 Finally, if the file analysis took place correctly, the validity of the scheme (completeness of connections, no unconnected
  60 input port, etc.) has to be checked.  This is done using the isValid method of the calculation scheme object, and
  61 then the p.checkConsistency method of this object as below::
  62
  63    if not p.isValid():
  64      print "The schema is not valid and can not be executed"
  65      print p.getErrorReport()
  66      sys.exit(1)
  67
  68    info=pilot.LinkInfo(pilot.LinkInfo.ALL_DONT_STOP)
  69    p.checkConsistency(info)
  70    if info.areWarningsOrErrors():
  71      print "The schema is not consistent and can not be executed"
  72      print info.getGlobalRepr()
  73      sys.exit(1)
  74
  75
  76 If all these tests took place correctly, the scheme is ready to be executed (see :ref:`execpy`).
  77
  78 Create a calculation scheme from scratch
  79 -------------------------------------------
  80 We will use the same sequence as in :ref:`schemaxml`.
  81 The first step is to obtain the runtime object that will be used for creation of objects making up the scheme, before they are created::
  82
  83   r = pilot.getRuntime()
  84
  85 Creating an empty scheme
  86 ''''''''''''''''''''''''''''
  87 An empty scheme is obtained using the createProc method of the runtime object with the name of the scheme as an argument::
  88
  89   p=r.createProc("pr")
  90
  91 The scheme object named “pr” was created.  It is represented by the Python variable p.
  92
  93 Definition of data types
  94 '''''''''''''''''''''''''''''''''
  95
  96 .. _basictypes:
  97
  98 Basic types
  99 ++++++++++++++++
 100 A basic type cannot be defined.  These types are defined by YACS.  However, it must be possible to retrieve a Python object
 101 equivalent to a basic type so as to be able to subsequently create ports.
 102
 103 A basic data type is recovered using the getTypeCode method in the calculation scheme with the name of the type as an argument.
 104 For example::
 105
 106    td=p.getTypeCode("double")
 107
 108 will obtain a double type (Python td object).  Other basic types are obtained by::
 109
 110    ti=p.getTypeCode("int")
 111    ts=p.getTypeCode("string")
 112    tb=p.getTypeCode("bool")
 113    tf=p.getTypeCode("file")
 114
 115 Object reference
 116 +++++++++++++++++++++
 117 The createInterfaceTc method in the calculation scheme is used to define an object reference type.
 118 This method accepts three arguments:  the repository id of the corresponding SALOME object, the name of the type, and a
 119 list of types that will be basic types of this type.  If the repository id is equal to “”, the default value will be used.
 120
 121 The following is a minimal example for a reference definition of an object name Obj (default repository id, no basic type)::
 122
 123   tc1=p.createInterfaceTc("","Obj",[])
 124
 125 The same Obj type can be defined giving the repository id::
 126
 127   tc1=p.createInterfaceTc("IDL:GEOM/GEOM_Object","Obj",[])
 128
 129 A list of basic types is also provided so as to define a reference object type derived from another type.
 130
 131 The following gives a definition of the MyObj type derived from the Obj type::
 132
 133   tc2=p.createInterfaceTc("","MyObj",[tc1])
 134
 135 Sequence
 136 +++++++++++++++++++++
 137 The createSequenceTc method in the calculation scheme is used to define a sequence type.
 138 This method accepts three arguments, namely the repository id, the type name, and the type of elements in the sequence.
 139 There is generally no point in specifying the repository id.  The value “” will be given.
 140
 141 The following gives an example definition of the seqdbl double sequence type::
 142
 143   tc3=p.createSequenceTc("","seqdbl",td)
 144
 145 td is the double type that is obtained as above in the section on :ref:`basictypes`.
 146
 147 A sequence type of sequence is defined as follows::
 148
 149   tc4=p.createSequenceTc("","seqseqdbl",tc3)
 150
 151 A reference sequence type is defined as follows::
 152
 153   tc5=p.createSequenceTc("","seqobj",tc1)
 154
 155 Structure
 156 ++++++++++++
 157 A structure type is defined using the createStructTc method in the calculation scheme.
 158 This method accepts two arguments, namely the repository id and the type name.  For standard use, the repository id is
 159 equal to the value “”.  The structure type is the only type that is defined in two steps.  It is created empty after
 160 calling the createStructTc method.  Its members are then defined by adding them with the addMember method.
 161
 162 The following shows an example definition of an s1 type structure with 2 members (m1 and m2) of the double and double sequence types::
 163
 164   ts1=p.createStructTc("","s1")
 165   ts1.addMember("m1",td)
 166   ts1.addMember("m2",tc3)
 167
 168 Retrieve predefined types
 169 +++++++++++++++++++++++++++++++++
 170 By default, YACS only defines the basic types.  If more predefined types are required, they must be requested from SALOME.
 171 These other predefined types are contained in module catalogs such as GEOM or SMESH.
 172
 173 The following code sequence is used to obtain an image of SALOME catalogs in YACS::
 174
 175   try:
 176     cata=r.loadCatalog("session",
 177            "corbaname::localhost:2810/NameService#Kernel.dir/ModulCatalog.object")
 178   except CORBA.TRANSIENT,ex:
 179     print "Unable to contact server:",ex
 180   except CORBA.SystemException,ex:
 181     print ex,CORBA.id(ex)
 182
 183 The SALOME application must be running before the catalog is accessible.
 184 Predefined types are then accessible in the cata._typeMap dictionary.
 185 If the name of the required type is known (for example ‘GEOM_Shape’), it is obtained as follows::
 186
 187   tgeom=cata._typeMap['GEOM_Shape']
 188
 189 .. _typedict:
 190
 191 Add a type into the scheme types dictionary
 192 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
 193 Some operations require that types are defined in the scheme dictionary.  Proceed as follows if you want to add a type
 194 into the dictionary, for example for the seqobj type defined above::
 195
 196   p.typeMap["seqobj"]=tc5
 197
 198 where the type name is the dictionary key and the type is the value.
 199
 200 Definition of elementary calculation nodes
 201 ''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
 202
 203 .. _pyscript:
 204
 205 Python script node
 206 +++++++++++++++++++++
 207 Several steps are used to define a script node in a given context (for example the calculation scheme).
 208 The first step consists of creating the node object by calling the runtime createScriptNode method.
 209 This method uses 2 arguments, the first of which in standard use must be equal to “” and the second is the node name.
 210 The following is an example to create node node1::
 211
 212   n=r.createScriptNode("","node1")
 213
 214 The second step consists of attaching the node to its definition context by calling the edAddChild method for the context object.
 215 This method has one argument, namely the node to be attached.  The following is an example of the attachment of the node node1
 216 to the calculation scheme::
 217
 218   p.edAddChild(n)
 219
 220 Warning: the name of the method to be used depends on the type of context node.  We will see which method should be used for other
 221 node types later.
 222
 223 The third step consists of defining the Python script associated with the node.  This is done using the setScript method for the node
 224 with a character string argument that contains the Python code.  The following shows an example definition of the associated code::
 225
 226   n.setScript("p1=p1+2.5")
 227
 228 The fourth step consists of defining input and output data ports.  An input port is created by calling the edAddInputPort method
 229 for the node.  An output port is created by calling the edAddOutputPort method for the node.
 230 These two methods have two arguments:  the port name and the port data type.  The following is an example creating a double
 231 type input port p1 and a double type output port p1::
 232
 233   n.edAddInputPort("p1",td)
 234   n.edAddOutputPort("p1",td)
 235
 236 Our node is now fully defined with its name, script, ports and context.  It retrieves the double in the input port p1, adds 2.5 to it
 237 and puts the result into the output port p1.
 238
 239 If you want to execute your script node on a remote container, you have to set the execution mode of the node to **remote**
 240 and to assign a container (see :ref:`py_container` to define a container) to the node as in the following example::
 241
 242   n.setExecutionMode("remote")
 243   n.setContainer(cont1)
 244
 245 .. _pyfunc:
 246
 247 Python function node
 248 ++++++++++++++++++++++
 249 The same procedure is used to define a function node.  The only differences apply to creation, in using the createFuncNode
 250 method and defining the function:  the setFname method must also be called to give the name of the function to be executed.
 251 The following is a complete example for the definition of a function node that is functionally identical to the previous script node::
 252
 253   n2=r.createFuncNode("","node2")
 254   p.edAddChild(n2)
 255   n2.setScript("""
 256   def f(p1):
 257     p1=p1+2.5
 258     return p1
 259   """)
 260   n2.setFname("f")
 261   n2.edAddInputPort("p1",td)
 262   n2.edAddOutputPort("p1",td)
 263
 264 If you want to execute your function node on a remote container, you have to set the execution mode of the node to **remote**
 265 and to assign a container (see :ref:`py_container` to define a container) to the node as in the following example::
 266
 267   n2.setExecutionMode("remote")
 268   n2.setContainer(cont1)
 269
 270 .. _pyservice:
 271
 272 SALOME service node
 273 ++++++++++++++++++++++++++
 274 There are two definition forms for a SALOME service node.
 275
 276 The first form in which the component name is given, uses the createCompoNode method to create the node.  The name of the
 277 component is given as an argument to the setRef method for the node.  The service name is given as an argument for the
 278 setMethod method for the node.  The remainder of the definition is exactly the same as for the previous Python nodes.
 279
 280 The following is an example of a node that calls the makeBanner service for a PYHELLO component::
 281
 282   n3=r.createCompoNode("","node3")
 283   p.edAddChild(n3)
 284   n3.setRef("PYHELLO")
 285   n3.setMethod("makeBanner")
 286   n3.edAddInputPort("p1",ts)
 287   n3.edAddOutputPort("p1",ts)
 288
 289 The second form is used to define a node that uses the same component as another node uses the createNode method of this other node.
 290 This method only has one argument, which is the node name.
 291 The remainder of the definition is identical to the definition for the previous form.
 292
 293 The following gives an example of a service node that makes a second call to the makeBanner service for the same component
 294 instance as the previous node::
 295
 296   n4=n3.createNode("node4")
 297   p.edAddChild(n4)
 298   n4.setMethod("makeBanner")
 299   n4.edAddInputPort("p1",ts)
 300   n4.edAddOutputPort("p1",ts)
 301
 302 Definition of connections
 303 ''''''''''''''''''''''''''''
 304 Obtaining a node port
 305 ++++++++++++++++++++++++++++
 306 Before links can be defined, it is almost always necessary to have Python objects representing the output port to be
 307 connected to the input port.  There are two ways of obtaining this object.
 308
 309 The first way is to retrieve the port when it is created using the edAddInputPort and edAddOutputPort methods.
 310 For example, we can then write::
 311
 312   pin=n4.edAddInputPort("p1",ts)
 313   pout=n4.edAddOutputPort("p1",ts)
 314
 315 pin and pout are then the objects necessary to define links.
 316
 317 The second way is to interrogate the node and ask it for one of its ports by its name.
 318 This is done using the getInputPort and getOutputPort methods.
 319 pin and pout can then be obtained as follows::
 320
 321   pin=n4.getInputPort("p1")
 322   pout=n4.getOutputPort("p1")
 323
 324 Control link
 325 ++++++++++++++++++++++++++++
 326 The edAddCFLink method for the context is used to define a control link between two nodes, transferring the two nodes to be
 327 connected to it as arguments.  For example, a control link between nodes n3 and n4 will be written::
 328
 329   p.edAddCFLink(n3,n4)
 330
 331 Node n3 will be executed before node n4.
 332
 333 Dataflow link
 334 ++++++++++++++++++++++++++++
 335 The first step in defining a dataflow link is to obtain port objects using one of the methods described above.
 336 The edAddDFLink method for the context node is then used, transferring the two ports to be connected to it.
 337 The following gives an example of a dataflow link between the output port p1 of node n3 and the input port of node n4::
 338
 339   pout=n3.getOutputPort("p1")
 340   pin=n4.getInputPort("p1")
 341   p.edAddDFLink(pout,pin)
 342
 343 Data link
 344 ++++++++++++++++++++++++++++
 345 A data link is defined as being a dataflow link using the edAddLink method instead of edAddDFLink.
 346 The same example as above with a data link::
 347
 348   pout=n3.getOutputPort("p1")
 349   pin=n4.getInputPort("p1")
 350   p.edAddLink(pout,pin)
 351
 352 Initialising an input data port
 353 '''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
 354 An input data port is initialised firstly by obtaining the corresponding port object.  There are then two methods of initialising it.
 355
 356 The first method initialises the port with a value encoded in XML-RPC.  The edInitXML method for the port is then used.
 357 The following is an example that initialises the port with the integer value 5::
 358
 359   pin.edInitXML("<value><int>5</int></value>")
 360
 361 The second method initialises the port with a Python value.  The edInitPy method is then used.
 362 The following is an example that initialises this port with the same value::
 363
 364   pin.edInitPy(5)
 365
 366 Specific methods can also be used for basic types:
 367
 368 - ``edInitInt`` for the int type
 369 - ``edInitDbl`` for the double type
 370 - ``edInitBool`` for the bool type
 371 - ``edInitString`` for the string type
 372
 373 First example starting from the previous elements
 374 '''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
 375 By collecting all previous definition elements, a complete calculation scheme identical to that given in the :ref:`schemaxml` chapter
 376 will appear as follows::
 377
 378   import sys
 379   import pilot
 380   import SALOMERuntime
 381   import loader
 382   SALOMERuntime.RuntimeSALOME_setRuntime()
 383   r = pilot.getRuntime()
 384   p=r.createProc("pr")
 385   ti=p.getTypeCode("int")
 386   #node1
 387   n1=r.createScriptNode("","node1")
 388   p.edAddChild(n1)
 389   n1.setScript("p1=p1+10")
 390   n1.edAddInputPort("p1",ti)
 391   n1.edAddOutputPort("p1",ti)
 392   #node2
 393   n2=r.createScriptNode("","node2")
 394   p.edAddChild(n2)
 395   n2.setScript("p1=2*p1")
 396   n2.edAddInputPort("p1",ti)
 397   n2.edAddOutputPort("p1",ti)
 398   #node4
 399   n4=r.createCompoNode("","node4")
 400   p.edAddChild(n4)
 401   n4.setRef("ECHO")
 402   n4.setMethod("echoDouble")
 403   n4.edAddInputPort("p1",td)
 404   n4.edAddOutputPort("p1",td)
 405   #control links
 406   p.edAddCFLink(n1,n2)
 407   p.edAddCFLink(n1,n4)
 408   #dataflow links
 409   pout=n3.getOutputPort("p1")
 410   pin=n4.getInputPort("p1")
 411   #dataflow links
 412   p.edAddDFLink(n1.getOutputPort("p1"),n2.getInputPort("p1"))
 413   p.edAddDFLink(n1.getOutputPort("p1"),n4.getInputPort("p1"))
 414   #initialisation ports
 415   n1.getInputPort("p1").edInitPy(5)
 416
 417 Definition of composite nodes
 418 '''''''''''''''''''''''''''''''''
 419
 420 .. _py_block:
 421
 422 Block
 423 +++++++
 424 A block is defined using the runtime createBloc method transferring the Block name to it as an argument.  The node is then
 425 attached to its definition context as an elementary node.  The following is an example Block definition in a calculation scheme::
 426
 427   b=r.createBloc("b1")
 428   p.edAddChild(b)
 429
 430 Once the block has been created, all nodes and links possible in its context can be added.
 431 Repeating a part of the example above, we will get::
 432
 433   n1=r.createScriptNode("","node1")
 434   b.edAddChild(n1)
 435   n1.setScript("p1=p1+10")
 436   n1.edAddInputPort("p1",ti)
 437   n1.edAddOutputPort("p1",ti)
 438   n2=r.createScriptNode("","node2")
 439   b.edAddChild(n2)
 440   n2.setScript("p1=2*p1")
 441   n2.edAddInputPort("p1",ti)
 442   n2.edAddOutputPort("p1",ti)
 443   b.edAddCFLink(n1,n2)
 444   b.edAddDFLink(n1.getOutputPort("p1"),n2.getInputPort("p1"))
 445
 446 .. _py_forloop:
 447
 448 ForLoop
 449 ++++++++
 450 A Forloop is defined using the runtime createForLoop method, transferring the node name to it as an argument.
 451 The node is then attached to its definition context.  The following is an example ForLoop definition in a calculation scheme::
 452
 453   l=r.createForLoop("l1")
 454   p.edAddChild(l)
 455
 456 The number of iterations in the loop to be executed will be initialised using the “nsteps” port that is initialised
 457 with an integer.  For example::
 458
 459   ip=l.getInputPort("nsteps")
 460   ip.edInitPy(3)
 461
 462 There is a special method for obtaining the “nsteps” port for the loop, namely edGetNbOfTimesInputPort.  Therefore, it can also be
 463 written as follows::
 464
 465   ip=l.edGetNbOfTimesInputPort()
 466   ip.edInitPy(3)
 467
 468 Finally, a method called edSetNode will be used in the context of a loop, instead of the edAddChild method, so as to add one (and only one) node.
 469 The following is a small example definition of a node inside a loop::
 470
 471   n1=r.createScriptNode("","node1")
 472   l.edSetNode(n1)
 473   n1.setScript("p1=p1+10")
 474   n1.edAddInputPort("p1",ti)
 475   n1.edAddOutputPort("p1",ti)
 476
 477 .. _py_whileloop:
 478
 479 WhileLoop
 480 ++++++++++
 481 WhileLoop node is defined in practically the same way as a ForLoop node.  The only differences apply to creation and assignment
 482 of the end of loop condition.  The createWhileLoop method is used for creation.  The “condition” port is used for the condition.
 483 If looping takes place on a node, it is important to use a data link instead of a dataflow link.
 484 The following is an example of WhileLoop node definition with a Python script internal node.
 485 The condition is initialised to True and is then changed to False by the internal node.  This results in a link loop::
 486
 487   wh=r.createWhileLoop("w1")
 488   p.edAddChild(wh)
 489   n=r.createScriptNode("","node3")
 490   n.setScript("p1=0")
 491   n.edAddOutputPort("p1",ti)
 492   wh.edSetNode(n)
 493   cport=wh.getInputPort("condition")
 494   cport.edInitBool(True)
 495   p.edAddLink(n.getOutputPort("p1"),cport)
 496
 497 There is a special method for obtaining the loop “condition” port:  edGetConditionPort.
 498
 499 .. _py_foreachloop:
 500
 501 ForEach loop
 502 ++++++++++++++++
 503 A ForEach node is basically defined in the same way as any other loop node.  There are several differences.
 504 The node is created with the createForEachLoop method that has an additional argument, namely the data type managed by the ForEach.
 505 The number of ForEach branches is specified with the “nbBranches” port.  The collection on which the ForEach iterates is managed by
 506 connection of the “evalSamples” and “SmplsCollection” ports.
 507
 508 The following is an example definition of the ForEach node with a Python script internal node that increments
 509 the element of the collection by 3::
 510
 511   fe=r.createForEachLoop("fe1",td)
 512   p.edAddChild(fe)
 513   n=r.createScriptNode("","node3")
 514   n.setScript("p1=p1+3.")
 515   n.edAddInputPort("p1",td)
 516   n.edAddOutputPort("p1",td)
 517   fe.edSetNode(n)
 518   p.edAddLink(fe.getOutputPort("evalSamples"),n.getInputPort("p1"))
 519   fe.getInputPort("nbBranches").edInitPy(3)
 520   fe.getInputPort("SmplsCollection").edInitPy([2.,3.,4.])
 521
 522 Special ports for the ForEach can be obtained using the following methods instead of getInputPort and getOutputPort:
 523
 524 - edGetNbOfBranchesPort for the “nbBranches” port
 525 - edGetSamplePort for the “evalSamples” port
 526 - edGetSeqOfSamplesPort for the “SmplsCollection” port
 527
 528 .. _py_switch:
 529
 530 Switch
 531 ++++++++
 532 A switch node is defined in several steps.  The first two steps are creation and attachment to the context node.
 533 The node is created by calling the runtime createSwitch method with the name of the node as an argument.  The node is attached
 534 to the context node by calling the edAddChild method for a scheme or a block or edSetNode for a loop node.
 535
 536 The following is an example of a creation followed by an attachment::
 537
 538   sw=r.createSwitch("sw1")
 539   p.edAddChild(sw)
 540
 541 The next step is to create an internal elementary or composite node by case.  The node for the default case is attached to
 542 the switch using the edSetDefaultNode method.  Nodes for other cases are attached to the switch using the edSetNode method, in
 543 which the first argument is equal to the value of the case (integer) and the second argument is equal to the internal node.
 544
 545 The following is an example of a switch with one script node for case “1” and another script node for the “default” case
 546 and a script node to initialise an exchanged variable::
 547
 548   #init
 549   n=r.createScriptNode("","node3")
 550   n.setScript("p1=3.5")
 551   n.edAddOutputPort("p1",td)
 552   p.edAddChild(n)
 553   #switch
 554   sw=r.createSwitch("sw1")
 555   p.edAddChild(sw)
 556   nk1=r.createScriptNode("","ncas1")
 557   nk1.setScript("p1=p1+3.")
 558   nk1.edAddInputPort("p1",td)
 559   nk1.edAddOutputPort("p1",td)
 560   sw.edSetNode(1,nk1)
 561   ndef=r.createScriptNode("","ndefault")
 562   ndef.setScript("p1=p1+5.")
 563   ndef.edAddInputPort("p1",td)
 564   ndef.edAddOutputPort("p1",td)
 565   sw.edSetDefaultNode(ndef)
 566   #initialise the select port
 567   sw.getInputPort("select").edInitPy(1)
 568   #connection of internal nodes
 569   p.edAddDFLink(n.getOutputPort("p1"),nk1.getInputPort("p1"))
 570   p.edAddDFLink(n.getOutputPort("p1"),ndef.getInputPort("p1"))
 571
 572 The edGetConditionPort method can be used instead of getInputPort, to obtain the special “select” port for the Switch.
 573
 574 .. _py_optimizerloop:
 575
 576 OptimizerLoop
 577 +++++++++++++++++++
 578
 579 The following is an example of OptimizerLoop with one python script as internal node. The algorithm
 580 is defined by the class async in the python module myalgo2.py::
 581
 582   ol=r.createOptimizerLoop("ol1","myalgo2.py","async",True)
 583   p.edAddChild(ol)
 584   n=r.createScriptNode("","node3")
 585   n.setScript("p1=3")
 586   n.edAddInputPort("p1",td)
 587   n.edAddOutputPort("p1",ti)
 588   ol.edSetNode(n)
 589   ol.getInputPort("nbBranches").edInitPy(3)
 590   ol.getInputPort("algoInit").edInitPy("coucou")
 591   p.edAddLink(ol.getOutputPort("evalSamples"),n.getInputPort("p1"))
 592   p.edAddLink(n.getOutputPort("p1"),ol.getInputPort("evalResults"))
 593
 594 .. _py_container:
 595
 596 Definition of containers
 597 ''''''''''''''''''''''''''''
 598 A container is defined using the runtime createContainer method and it is then given a name using its setName method.
 599 The next step is to assign constraints to it by adding properties.
 600 The following is an example creation of a container named “A”::
 601
 602   c1=r.createContainer()
 603   c1.setName("A")
 604
 605 A property is added to a container using its setProperty method that uses 2 arguments (character strings).
 606 The first is the property name.  The second is its value.
 607 The following is an example of this container “A” with constraints::
 608
 609   c1=r.createContainer()
 610   c1.setName("A")
 611   c1.setProperty("container_name","FactoryServer")
 612   c1.setProperty("hostname","localhost")
 613   c1.setProperty("mem_mb","1000")
 614
 615 Once the containers have been defined, SALOME components can be placed on this container.  The first step to place the component
 616 of a SALOME service node is to obtain the component instance of this service node using the getComponent method for this node.
 617 The previously defined container is then assigned to this component instance using the setContainer method of the component instance.
 618
 619 If it is required to place the SALOME service defined above (node “node3”) on container “A”, we will write::
 620
 621   n3.getComponent().setContainer(c1)
 622
 623 Node properties
 624 '''''''''''''''''''''''''''
 625 A property is added to an elementary or composite node (or is modified) using its setProperty method that has two
 626 arguments (character strings).  The first is the name of the property.  The second is its value.
 627 The following is an example for the previous node “node3”::
 628
 629   n3.setProperty("VERBOSE","2")
 630
 631 Datastream connections
 632 '''''''''''''''''''''''''''
 633 Datastream connections are only possible for SALOME service nodes as we have seen in :ref:`principes`.
 634 We firstly need to define the datastream ports in the service node.  An input datastream port is defined using
 635 the edAddInputDataStreamPort method.  An output datastream port is defined using the edAddOutputDataStreamPort method.
 636 These methods use the port name and the datastream type as arguments.
 637
 638 Some datastream ports (for example CALCIUM ports) must be configured with properties.  The port setProperty method will
 639 be used to configure them.
 640 The following is an example definition of the SALOME service node with datastream ports.  This is the DSCCODC component
 641 located in the DSCCODES module in the EXAMPLES base.  The datastream ports are of the “CALCIUM_integer” type
 642 with time dependency::
 643
 644   calcium_int=cata._typeMap['CALCIUM_integer']
 645   n5=r.createCompoNode("","node5")
 646   p.edAddChild(n5)
 647   n5.setRef("DSCCODC")
 648   n5.setMethod("prun")
 649   pin=n5.edAddInputDataStreamPort("ETP_EN",calcium_int)
 650   pin.setProperty("DependencyType","TIME_DEPENDENCY")
 651   pout=n5.edAddOutputDataStreamPort("STP_EN",calcium_int)
 652   pout.setProperty("DependencyType","TIME_DEPENDENCY")
 653
 654 Once the service nodes have been provided with datastream ports, all that remains is to connect them.
 655 This connection is made using the edAddLink method for the context node in the same way as for data links.
 656 The only difference is the type of ports transferred as arguments.
 657
 658 To complete our example, we will define a second service node and connect the datastream ports for these services::
 659
 660   n6=r.createCompoNode("","node6")
 661   p.edAddChild(n6)
 662   n6.setRef("DSCCODD")
 663   n6.setMethod("prun")
 664   pin=n6.edAddInputDataStreamPort("ETP_EN",calcium_int)
 665   pin.setProperty("DependencyType","TIME_DEPENDENCY")
 666   pout=n6.edAddOutputDataStreamPort("STP_EN",calcium_int)
 667   pout.setProperty("DependencyType","TIME_DEPENDENCY")
 668   p.edAddLink(n5.getOutputDataStreamPort("STP_EN"),n6.getInputDataStreamPort("ETP_EN"))
 669   p.edAddLink(n6.getOutputDataStreamPort("STP_EN"),n5.getInputDataStreamPort("ETP_EN"))
 670
 671 Other elementary nodes
 672 '''''''''''''''''''''''''''''''
 673 SalomePython node
 674 +++++++++++++++++++
 675 A SalomePython node is defined in practically exactly the same way as a :ref:`pyfunc`.  The runtime createSInlineNode method is used
 676 instead of the createFuncNode and information about placement on a container is added in the same way as for a
 677 SALOME service node (setContainer method).
 678
 679 The following is an example similar to that given in :ref:`schemaxml`::
 680
 681   n2=r.createSInlineNode("","node2")
 682   p.edAddChild(n2)
 683   n2.setScript("""
 684   import salome
 685   salome.salome_init()
 686   import PYHELLO_ORB
 687   def f(p1):
 688     print __container__from__YACS__
 689     machine,container=__container__from__YACS__.split('/')
 690     param={'hostname':machine,'container_name':container}
 691     compo=salome.lcc.LoadComponent(param, "PYHELLO")
 692     print compo.makeBanner(p1)
 693     print p1
 694   """)
 695   n2.setFname("f")
 696   n2.edAddInputPort("p1",ts)
 697   n2.getComponent().setContainer(c1)
 698
 699 .. _py_datain:
 700
 701 DataIn node
 702 +++++++++++++++
 703 A DataIn node is defined using the runtime createInDataNode method.  It uses two arguments, the first of which must be “” and
 704 the second the node name.  Node data are defined by adding output data ports to it using the edAddOutputPort method
 705 and transferring the data name and its type to it as arguments.
 706 The value of the data is initialised using the port setData method thus created by transferring the value encoded in
 707 XML-RPC to it (see :ref:`initialisation`).
 708
 709 The following is an example of the DataIn node that defines 2 double type data (b and c) and one file type data (f)::
 710
 711   n=r.createInDataNode("","data1")
 712   p.edAddChild(n)
 713   pout=n.edAddOutputPort('a',td)
 714   pout.setData("<value><double>-1.</double></value>")
 715   pout=n.edAddOutputPort('b',td)
 716   pout.setData("<value><double>5.</double></value>")
 717   pout=n.edAddOutputPort('f',tf)
 718   pout.setData("<value><objref>f.data</objref></value>")
 719
 720 A value can be directly assigned to a data with a Python object, using the setDataPy method.  Example for a sequence::
 721
 722   pout.setDataPy([1.,5.])
 723
 724 .. _py_dataout:
 725
 726 DataOut node
 727 +++++++++++++++++
 728 A DataOut node is defined using the runtime createOutDataNode method.  It uses two arguments, the first of which
 729 must be “” and the second the node name .  Node results are defined by adding input data ports to it using the edAddInputPort
 730 method with the result name and its type as arguments.  The results are saved in a file using the node setRef method with the
 731 file name as an argument.
 732 A result file is copied into a local file using the setData method for the port corresponding to the result with the
 733 file name as an argument.
 734
 735 The following is an example of the DataOut node that defines different types (double, int, string, doubles vector, file) of
 736 results (a, b, c, d, f) and writes the corresponding values in the g.data file.
 737 The result file will be copied into the local file myfile::
 738
 739   n=r.createOutDataNode("","data2")
 740   n.setRef("g.data")
 741   p.edAddChild(n)
 742   n.edAddInputPort('a',td)
 743   n.edAddInputPort('b',ti)
 744   n.edAddInputPort('c',ts)
 745   n.edAddInputPort('d',tc3)
 746   pin=n.edAddInputPort('f',tf)
 747   pin.setData("monfich")
 748
 749 .. _py_studyin:
 750
 751 StudyIn node
 752 ++++++++++++++
 753 A StudyIn node is defined using the runtime createInDataNode method.  It uses two arguments, the first of which must be “study”
 754 and the second the node name.  The associated study is specified by adding the “StudyID” property to the node using
 755 its setProperty method.  Node data are defined by adding output data ports using the edAddOutputPOrt method, transferring
 756 the name of the data and its type as arguments.  The data is initialised with the reference in the study, using the setData method
 757 for the port thus created, transferring a character string to it containing either the SALOME Entry or the path in the study
 758 tree structure.
 759
 760 The following is an example of the StudyIn node that defines 2 GEOM_Object type data (a and b).  The study is assumed to be
 761 loaded into memory by SALOME as StudyID 1.  Data a is referenced by one SALOME Entry.  Data b is referenced by a path in the
 762 study tree structure::
 763
 764   n=r.createInDataNode("study","study1")
 765   p.edAddChild(n)
 766   n.setProperty("StudyID","1")
 767   pout=n.edAddOutputPort('a',tgeom)
 768   pout.setData("0:1:1:1")
 769   pout=n.edAddOutputPort('b',tgeom)
 770   pout.setData("/Geometry/Sphere_1")
 771
 772 .. _py_studyout:
 773
 774 StudyOut node
 775 ++++++++++++++
 776 A StudyOut node is defined using the runtime createOutDataNode method.  It uses two arguments, the first of
 777 which must be “study” and the second the node name.  The associated study is specified by adding
 778 the “StudyID” property to the node using its setProperty method.  The name of the file in which the study will be
 779 saved is specified using the node SetRef method with the file name as an argument.
 780 The node results are defined by adding input data ports to it using the edAddInputPort method, transferring the data name
 781 and type as arguments.  The setData method for the port is used to associate the entry into the study to the result, transferring
 782 a character string to it that contains either the SALOME Entry or the path in the study tree structure.
 783
 784 The following contains an example of the StudyOut node that defines two GEOM_Object type results (a and b).
 785 The studyId of the study used is 1.  Result a is referenced by a SALOME Entry.  The result b is referenced by a path.
 786 The complete study is saved in the study1.hdf file at the end of the calculation::
 787
 788   n=r.createOutDataNode("study","study2")
 789   n.setRef("study1.hdf")
 790   p.edAddChild(n)
 791   n.setProperty("StudyID","1")
 792   pout=n.edAddInputPort('a',tgeom)
 793   pout.setData("0:1:2:1")
 794   pout=n.edAddInputPort('b',tgeom)
 795   pout.setData("/Save/Sphere_2")
 796
 797 Save a calculation scheme in an XML file
 798 ------------------------------------------------------
 799 A calculation scheme is saved in a file in the XML format using the saveSchema method for the calculation
 800 scheme, transferring the file name to it as an argument.  Before a calculation scheme constructed under Python
 801 can be saved in a consistent form in an XML file, all types defined in Python have to be added to the scheme types
 802 dictionary (see :ref:`typedict`).  The save will not do this automatically.
 803
 804 Proceed as follows to save the scheme p constructed above in the myscheme.xml file::
 805
 806   p.saveSchema("monschema.xml")
 807
 808 The file thus obtained can then be loaded as in :ref:`loadxml`.
 809
 810 Several useful operations
 811 ------------------------------
 812
 813 Finding a node by its name
 814 '''''''''''''''''''''''''''''''''''
 815 A node (Python object) can be found, when all that is available is the calculation scheme object and
 816 the absolute name of the node, by calling the scheme getChildByName method, transferring the absolute name to it.
 817
 818 To find the Python script node defined in :ref:`pyscript`::
 819
 820   n=p.getChildByName("node1")
 821
 822 To find node “node1” node in block “b1”::
 823
 824   n=p.getChildByName("b1.node1")
 825
 826 This operation can also be used starting from a composite node provided that the relative node name is used.
 827 The previous example can be rewritten::
 828
 829   n=b.getChildByName("node1")
 830
 831 Finding a port by its name
 832 '''''''''''''''''''''''''''''''''''
 833 The first step to find a node port by its name is to retrieve the node by its name.  An input data port is then found
 834 using the getInputPort method, and an output data port is found using the getOutputPort method.
 835
 836 The following is an example starting from the previous node n::
 837
 838   pin=n.getOutputPort("p1")
 839   pout=n.getInputPort("p2")
 840
 841 Obtaining a port value
 842 '''''''''''''''''''''''''''''''''''
 843 The value of a port is obtained using its getPyObj method.  For example::
 844
 845   print pin.getPyObj()
 846   print pout.getPyObj()
 847
 848 Obtaining the state of a node
 849 '''''''''''''''''''''''''''''''''''
 850 The state of a node is obtained using its getEffectiveState method (see possible values in :ref:`etats`).
 851
 852 Removing a node from its context
 853 '''''''''''''''''''''''''''''''''''
 854 A node can be removed from its context node using a context method.  The method name will be different
 855 depending on the context type.
 856
 857 - For a block or a calculation scheme, the edRemoveChild method will be used with the node to be removed as an argument::
 858
 859     p.edRemoveChild(n)
 860
 861 - For a loop (ForLoop, WhileLoop or ForEachLoop) the edRemoveNode method will be used without any argument::
 862
 863     l.edRemoveNode()
 864
 865 - The edRemoveChild method will be used for a Switch, with the internal node concerned as an argument::
 866
 867     sw.edRemoveChild(nk1)
 868