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Documentation improvements and post analysis
[modules/adao.git] / doc / fr / ref_output_variables.rst
1 ..
2    Copyright (C) 2008-2021 EDF R&D
3
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18    Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
19
20    See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
21
22    Author: Jean-Philippe Argaud, jean-philippe.argaud@edf.fr, EDF R&D
23
24 .. _section_ref_output_variables:
25
26 Variables et informations disponibles en sortie
27 -----------------------------------------------
28
29 Comment obtenir les informations disponibles en sortie
30 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
31
32 .. index:: single: UserPostAnalysis
33 .. index:: single: algoResults
34 .. index:: single: getResults
35 .. index:: single: get
36 .. index:: single: ADD
37
38 En sortie, après exécution d'une assimilation de données, d'une optimisation
39 ou d'une vérification, on dispose de variables et d'informations issues du
40 calcul. L'obtention de ces informations se fait ensuite de manière standardisée
41 à l'aide de l'étape de post-processing du calcul.
42
43 L'étape est aisément identifiée par l'utilisateur dans son cas ADAO de
44 définition (par le mot-clé "*UserPostAnalysis*") ou dans son schéma YACS
45 d'exécution (par des noeuds ou blocs situés après le bloc de calcul, et reliés
46 graphiquement au port de sortie "*algoResults*" du bloc de calcul):
47
48 #. Dans le cas où l'utilisateur définit le post-processing dans son cas ADAO, il utilise un fichier script externe ou des commandes dans le champ de type "*String*" ou "*Template*". Le script qu'il fournit dispose d'une variable fixe "*ADD*" dans l'espace de noms.
49 #. Dans le cas où l'utilisateur définit le post-processing dans son schéma YACS par un noeud Python situé après le bloc de calcul, il doit ajouter un port d'entrée de type "*pyobj*" nommé par exemple "*Study*", relié graphiquement au port de sortie "*algoResults*" du bloc de calcul. Le noeud Python de post-processing doit ensuite débuter par ``ADD = Study.getResults()``.
50
51 Des patrons (ou "templates") sont donnés ci-après en
52 :ref:`subsection_r_o_v_Template`.  Dans tous les cas, le post-processing de
53 l'utilisateur dispose dans l'espace de noms d'une variable dont le nom est
54 "*ADD*", et dont l'unique méthode utilisable est nommée ``get``. Les arguments
55 de cette méthode sont un nom d'information de sortie, comme décrit dans
56 l':ref:`subsection_r_o_v_Inventaire`.
57
58 Par exemple, pour avoir l'état optimal après un calcul d'assimilation de données
59 ou d'optimisation, on utilise l'appel suivant::
60
61     ADD.get("Analysis")
62
63 Cet appel renvoie une liste de valeurs de la notion demandée (ou, dans le cas
64 de variables d'entrées qui ne sont par nature qu'en un unique exemplaire, la
65 valeur elle-même). On peut alors demander un élément particulier de la liste par
66 les commandes standards de liste (en particulier ``[-1]`` pour le dernier, et
67 ``[:]`` pour tous les éléments).
68
69 .. _subsection_r_o_v_Template:
70
71 Exemples de scripts Python pour obtenir ou traiter les sorties
72 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
73
74 .. index:: single: Template
75 .. index:: single: AnalysisPrinter
76 .. index:: single: AnalysisSaver
77 .. index:: single: AnalysisPrinterAndSaver
78
79 Ces exemples présentent des commandes ou scripts Python qui permettent d'obtenir
80 ou de traiter les sorties d'une exécution d'algorithme. Pour aider
81 l'utilisateur, ils sont directement disponibles dans l'interface, à la
82 construction du cas ADAO dans l'éditeur intégré de cas, dans les champs de type
83 "*Template*". De manière équivalente, ces commandes peuvent être contenues dans
84 un script utilisateur externe (et insérées dans le cas ADAO par l'entrée de type
85 "*Script*") ou contenues dans une chaîne de caractères, y compris les retour à
86 la ligne (et insérées dans le cas ADAO par l'entrée de type "*String*"). De
87 nombreuses variantes peuvent être imaginées à partir de ces exemples simples,
88 l'objectif étant surtout d'aider l'utilisateur à effectuer le traitement exact
89 dont il a besoin en sortie.
90
91 Le premier exemple (appelé "*AnalysisPrinter*" dans les entrées de type
92 "*Template*") consiste à afficher, dans la sortie standard d'exécution, la
93 valeur de l'analyse ou de l'état optimal, noté :math:`\mathbf{x}^a` dans la
94 partie :ref:`section_theory`. Cela se réalise par les commandes::
95
96     import numpy
97     xa=numpy.ravel(ADD.get('Analysis')[-1])
98     print('Analysis:',xa)
99
100 La fonction ``numpy.ravel`` assure simplement que la variable ``xa`` contienne
101 un vrai vecteur unidimensionnel, quels que soient les choix informatiques
102 précédents.
103
104 Un second exemple (appelé "*AnalysisSaver*" dans les entrées de type
105 "*Template*") consiste à enregistrer sur fichier la valeur de l'analyse ou de
106 l'état optimal :math:`\mathbf{x}^a`. Cela se réalise par les commandes::
107
108     import numpy
109     xa=numpy.ravel(ADD.get('Analysis')[-1])
110     f='/tmp/analysis.txt'
111     print('Analysis saved in "%s"'%f)
112     numpy.savetxt(f,xa)"
113
114 Le fichier d'enregistrement choisi est un fichier texte ``/tmp/analysis.txt``.
115
116 Il est aisé de combiner ces deux exemples pour en construire un troisième
117 (appelé "*AnalysisPrinterAndSaver*" dans les entrées de type "*Template*"). Il
118 consiste à simultanément afficher dans la sortie standard d'exécution et à
119 enregistrer sur fichier la valeur de :math:`\mathbf{x}^a`. Cela se réalise par
120 les commandes::
121
122     import numpy
123     xa=numpy.ravel(ADD.get('Analysis')[-1])
124     print('Analysis:',xa)
125     f='/tmp/analysis.txt'
126     print('Analysis saved in "%s"'%f)
127     numpy.savetxt(f,xa)
128
129 Pour faciliter l'extension de ces exemples selon les besoins utilisateurs, on
130 rappelle que l'ensemble des fonctions de SALOME sont disponibles au même niveau
131 que ces commandes. L'utilisateur peut en particulier requérir des actions de
132 représentation graphique avec le module PARAVIS [#]_ ou d'autres modules, des
133 actions de calcul pilotés par YACS [#]_ ou un autre module, etc.
134
135 D'autres exemples d'utilisation sont aussi donnés en :ref:`section_u_step4` de
136 la partie :ref:`section_gui_in_salome`, ou en partie :ref:`section_tutorials_in_salome`.
137
138 Conditionnalité des informations disponibles en sortie
139 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
140
141 .. index:: single: AlgorithmParameters
142 .. index:: single: Stored
143
144 La disponibilité des informations après le calcul est conditionnée par le fait
145 qu'elles aient été calculées ou demandées.
146
147 Chaque algorithme ne fournit pas obligatoirement les mêmes informations, et
148 n'utilise par exemple pas nécessairement les mêmes quantités intermédiaires. Il
149 y a donc des informations toujours présentes comme l'état optimal résultant du
150 calcul. Les autres informations ne sont présentes que pour certains algorithmes
151 et/ou que si elles ont été réclamées avant l'exécution du calcul.
152
153 On rappelle que l'utilisateur peut réclamer des informations supplémentaires
154 lors de l'établissement de son cas ADAO, en utilisant la commande optionnelle
155 "*AlgorithmParameters*" du cas ADAO. On se reportera à la
156 :ref:`section_ref_options_Algorithm_Parameters` pour le bon usage de cette
157 commande, et à la description de chaque algorithme pour les informations
158 disponibles par algorithme. On peut aussi demander à conserver certaines
159 informations en entrée en changeant le booléen "*Stored*" qui lui est associé
160 dans l'édition du cas ADAO.
161
162 .. _subsection_r_o_v_Inventaire:
163
164 Inventaire des informations potentiellement disponibles en sortie
165 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
166
167 Les principales informations potentiellement disponibles en sortie sont
168 indiquées ici indépendamment des algorithmes, pour inventaire. On se reportera
169 directement aux détails des algorithmes pour avoir l'inventaire exhaustif.
170
171 L'état optimal est une information qui est toujours naturellement disponible
172 après un calcul d'assimilation de données ou d'optimisation. Il désigné par le
173 mot-clé suivant:
174
175   .. include:: snippets/Analysis.rst
176
177 Les variables suivantes sont des variables d'entrée que l'on peut aussi obtenir
178 en sortie. Elles sont mises à disposition de l'utilisateur en sortie pour
179 faciliter l'écriture des procédures de post-processing, et sont conditionnées
180 par une demande utilisateur explicite à l'aide d'un booléen "*Stored*" en
181 entrée. Toutes ces variables d'entrée restituées sont obtenables par la
182 commande standard ".get(...)", qui s'applique à refournir l'unique objet donné
183 en entrée.
184
185   .. include:: snippets/Background.rst
186
187   .. include:: snippets/BackgroundError.rst
188
189   .. include:: snippets/EvolutionError.rst
190
191   .. include:: snippets/Observation.rst
192
193   .. include:: snippets/ObservationError.rst
194
195 Toutes les autres informations sont conditionnées par l'algorithme et/ou par la
196 demande utilisateur de disponibilité. Les principales sont les suivantes, par
197 ordre alphabétique:
198
199   .. include:: snippets/APosterioriCorrelations.rst
200
201   .. include:: snippets/APosterioriCovariance.rst
202
203   .. include:: snippets/APosterioriStandardDeviations.rst
204
205   .. include:: snippets/APosterioriVariances.rst
206
207   .. include:: snippets/BMA.rst
208
209   .. include:: snippets/CostFunctionJ.rst
210
211   .. include:: snippets/CostFunctionJb.rst
212
213   .. include:: snippets/CostFunctionJo.rst
214
215   .. include:: snippets/CostFunctionJAtCurrentOptimum.rst
216
217   .. include:: snippets/CostFunctionJbAtCurrentOptimum.rst
218
219   .. include:: snippets/CostFunctionJoAtCurrentOptimum.rst
220
221   .. include:: snippets/CurrentOptimum.rst
222
223   .. include:: snippets/CurrentState.rst
224
225   .. include:: snippets/IndexOfOptimum.rst
226
227   .. include:: snippets/Innovation.rst
228
229   .. include:: snippets/InnovationAtCurrentState.rst
230
231   .. include:: snippets/OMA.rst
232
233   .. include:: snippets/OMB.rst
234
235   .. include:: snippets/Residu.rst
236
237   .. include:: snippets/SimulatedObservationAtBackground.rst
238
239   .. include:: snippets/SimulatedObservationAtCurrentOptimum.rst
240
241   .. include:: snippets/SimulatedObservationAtCurrentState.rst
242
243   .. include:: snippets/SimulatedObservationAtOptimum.rst
244
245   .. include:: snippets/SimulationQuantiles.rst
246
247 .. [#] Pour de plus amples informations sur PARAVIS, voir le *module PARAVIS* et son aide intégrée disponible dans le menu principal *Aide* de l'environnement SALOME.
248
249 .. [#] Pour de plus amples informations sur YACS, voir le *module YACS* et son aide intégrée disponible dans le menu principal *Aide* de l'environnement SALOME.