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Documentation and source correction and improvements for DFO
[modules/adao.git] / doc / fr / ref_algorithm_3DVAR.rst
1 ..
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18    Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
19
20    See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
21
22    Author: Jean-Philippe Argaud, jean-philippe.argaud@edf.fr, EDF R&D
23
24 .. index:: single: 3DVAR
25 .. _section_ref_algorithm_3DVAR:
26
27 Algorithme de calcul "*3DVAR*"
28 ------------------------------
29
30 Description
31 +++++++++++
32
33 Cet algorithme réalise une estimation d'état par minimisation variationnelle de
34 la fonctionnelle :math:`J` d'écart classique en assimilation de données
35 statique:
36
37 .. math:: J(\mathbf{x})=(\mathbf{x}-\mathbf{x}^b)^T.\mathbf{B}^{-1}.(\mathbf{x}-\mathbf{x}^b)+(\mathbf{y}^o-H(\mathbf{x}))^T.\mathbf{R}^{-1}.(\mathbf{y}^o-H(\mathbf{x}))
38
39 qui est usuellement désignée comme la fonctionnelle "*3D-VAR*" (voir par exemple
40 [Talagrand97]_).
41
42 Commandes requises et optionnelles
43 ++++++++++++++++++++++++++++++++++
44
45 .. index:: single: AlgorithmParameters
46 .. index:: single: Background
47 .. index:: single: BackgroundError
48 .. index:: single: Observation
49 .. index:: single: ObservationError
50 .. index:: single: ObservationOperator
51 .. index:: single: Minimizer
52 .. index:: single: Bounds
53 .. index:: single: MaximumNumberOfSteps
54 .. index:: single: CostDecrementTolerance
55 .. index:: single: ProjectedGradientTolerance
56 .. index:: single: GradientNormTolerance
57 .. index:: single: StoreSupplementaryCalculations
58 .. index:: single: Quantiles
59 .. index:: single: SetSeed
60 .. index:: single: NumberOfSamplesForQuantiles
61 .. index:: single: SimulationForQuantiles
62
63 Les commandes requises générales, disponibles dans l'interface en édition, sont
64 les suivantes:
65
66   Background
67     *Commande obligatoire*. Elle définit le vecteur d'ébauche ou
68     d'initialisation, noté précédemment :math:`\mathbf{x}^b`. Sa valeur est
69     définie comme un objet de type "*Vector*" ou de type "*VectorSerie*".
70
71   BackgroundError
72     *Commande obligatoire*. Elle définit la matrice de covariance des erreurs
73     d'ébauche, notée précédemment :math:`\mathbf{B}`. Sa valeur est définie
74     comme un objet de type "*Matrix*", de type "*ScalarSparseMatrix*", ou de
75     type "*DiagonalSparseMatrix*".
76
77   Observation
78     *Commande obligatoire*. Elle définit le vecteur d'observation utilisé en
79     assimilation de données ou en optimisation, et noté précédemment
80     :math:`\mathbf{y}^o`. Sa valeur est définie comme un objet de type "*Vector*"
81     ou de type "*VectorSerie*".
82
83   ObservationError
84     *Commande obligatoire*. Elle définit la matrice de covariance des erreurs
85     d'ébauche, notée précédemment :math:`\mathbf{R}`. Sa valeur est définie
86     comme un objet de type "*Matrix*", de type "*ScalarSparseMatrix*", ou de
87     type "*DiagonalSparseMatrix*".
88
89   ObservationOperator
90     *Commande obligatoire*. Elle indique l'opérateur d'observation, noté
91     précédemment :math:`H`, qui transforme les paramètres d'entrée
92     :math:`\mathbf{x}` en résultats :math:`\mathbf{y}` qui sont à comparer aux
93     observations :math:`\mathbf{y}^o`. Sa valeur est définie comme un objet de
94     type "*Function*" ou de type "*Matrix*". Dans le cas du type "*Function*",
95     différentes formes fonctionnelles peuvent être utilisées, comme décrit dans
96     la section :ref:`section_ref_operator_requirements`. Si un contrôle
97     :math:`U` est inclus dans le modèle d'observation, l'opérateur doit être
98     appliqué à une paire :math:`(X,U)`.
99
100 Les commandes optionnelles générales, disponibles dans l'interface en édition,
101 sont indiquées dans la :ref:`section_ref_assimilation_keywords`. De plus, les
102 paramètres de la commande "*AlgorithmParameters*" permettent d'indiquer les
103 options particulières, décrites ci-après, de l'algorithme. On se reportera à la
104 :ref:`section_ref_options_Algorithm_Parameters` pour le bon usage de cette
105 commande.
106
107 Les options de l'algorithme sont les suivantes:
108
109   Minimizer
110     Cette clé permet de changer le minimiseur pour l'optimiseur. Le choix par
111     défaut est "LBFGSB", et les choix possibles sont "LBFGSB" (minimisation non
112     linéaire sous contraintes, voir [Byrd95]_, [Morales11]_ et [Zhu97]_), "TNC"
113     (minimisation non linéaire sous contraintes), "CG" (minimisation non
114     linéaire sans contraintes), "BFGS" (minimisation non linéaire sans
115     contraintes), "NCG" (minimisation de type gradient conjugué de Newton). Il
116     est fortement conseillé de conserver la valeur par défaut.
117
118     Exemple : ``{"Minimizer":"LBFGSB"}``
119
120   Bounds
121     Cette clé permet de définir des bornes supérieure et inférieure pour chaque
122     variable d'état optimisée. Les bornes doivent être données par une liste de
123     liste de paires de bornes inférieure/supérieure pour chaque variable, avec
124     une valeur ``None`` chaque fois qu'il n'y a pas de borne. Les bornes peuvent
125     toujours être spécifiées, mais seuls les optimiseurs sous contraintes les
126     prennent en compte.
127
128     Exemple : ``{"Bounds":[[2.,5.],[1.e-2,10.],[-30.,None],[None,None]]}``
129
130   MaximumNumberOfSteps
131     Cette clé indique le nombre maximum d'itérations possibles en optimisation
132     itérative. Le défaut est 15000, qui est très similaire à une absence de
133     limite sur les itérations. Il est ainsi recommandé d'adapter ce paramètre
134     aux besoins pour des problèmes réels. Pour certains optimiseurs, le nombre
135     de pas effectif d'arrêt peut être légèrement différent de la limite à cause
136     d'exigences de contrôle interne de l'algorithme.
137
138     Exemple : ``{"MaximumNumberOfSteps":100}``
139
140   CostDecrementTolerance
141     Cette clé indique une valeur limite, conduisant à arrêter le processus
142     itératif d'optimisation lorsque la fonction coût décroît moins que cette
143     tolérance au dernier pas. Le défaut est de 1.e-7, et il est recommandé
144     de l'adapter aux besoins pour des problèmes réels.
145
146     Exemple : ``{"CostDecrementTolerance":1.e-7}``
147
148   ProjectedGradientTolerance
149     Cette clé indique une valeur limite, conduisant à arrêter le processus
150     itératif d'optimisation lorsque toutes les composantes du gradient projeté
151     sont en-dessous de cette limite. C'est utilisé uniquement par les
152     optimiseurs sous contraintes. Le défaut est -1, qui désigne le défaut
153     interne de chaque optimiseur (usuellement 1.e-5), et il n'est pas recommandé
154     de le changer.
155
156     Exemple : ``{"ProjectedGradientTolerance":-1}``
157
158   GradientNormTolerance
159     Cette clé indique une valeur limite, conduisant à arrêter le processus
160     itératif d'optimisation lorsque la norme du gradient est en dessous de cette
161     limite. C'est utilisé uniquement par les optimiseurs sans contraintes. Le
162     défaut est 1.e-5 et il n'est pas recommandé de le changer.
163
164     Exemple : ``{"GradientNormTolerance":1.e-5}``
165
166   StoreSupplementaryCalculations
167     Cette liste indique les noms des variables supplémentaires qui peuvent être
168     disponibles à la fin de l'algorithme. Cela implique potentiellement des
169     calculs ou du stockage coûteux. La valeur par défaut est une liste vide,
170     aucune de ces variables n'étant calculée et stockée par défaut. Les noms
171     possibles sont dans la liste suivante : ["APosterioriCorrelations",
172     "APosterioriCovariance", "APosterioriStandardDeviations",
173     "APosterioriVariances", "BMA", "CostFunctionJ", "CurrentOptimum",
174     "CurrentState", "IndexOfOptimum", "Innovation", "InnovationAtCurrentState",
175     "MahalanobisConsistency", "OMA", "OMB", "SigmaObs2",
176     "SimulatedObservationAtBackground", "SimulatedObservationAtCurrentOptimum",
177     "SimulatedObservationAtCurrentState", "SimulatedObservationAtOptimum",
178     "SimulationQuantiles"].
179
180     Exemple : ``{"StoreSupplementaryCalculations":["BMA", "Innovation"]}``
181
182   Quantiles
183     Cette liste indique les valeurs de quantile, entre 0 et 1, à estimer par
184     simulation autour de l'état optimal. L'échantillonnage utilise des tirages
185     aléatoires gaussiens multivariés, dirigés par la matrice de covariance a
186     posteriori. Cette option n'est utile que si le calcul supplémentaire
187     "SimulationQuantiles" a été choisi. La valeur par défaut est une liste vide.
188
189     Exemple : ``{"Quantiles":[0.1,0.9]}``
190
191   SetSeed
192     Cette clé permet de donner un nombre entier pour fixer la graine du
193     générateur aléatoire utilisé pour générer l'ensemble. Un valeur pratique est
194     par exemple 1000. Par défaut, la graine est laissée non initialisée, et elle
195     utilise ainsi l'initialisation par défaut de l'ordinateur.
196
197     Exemple : ``{"SetSeed":1000}``
198
199   NumberOfSamplesForQuantiles
200     Cette clé indique le nombre de simulations effectuées pour estimer les
201     quantiles. Cette option n'est utile que si le calcul supplémentaire
202     "SimulationQuantiles" a été choisi. Le défaut est 100, ce qui suffit souvent
203     pour une estimation correcte de quantiles courants à 5%, 10%, 90% ou 95%.
204
205     Exemple : ``{"NumberOfSamplesForQuantiles":100}``
206
207   SimulationForQuantiles
208     Cette clé indique le type de simulation, linéaire (avec l'opérateur
209     d'observation tangent appliqué sur des incréments de perturbations autour de
210     l'état optimal) ou non-linéaire (avec l'opérateur d'observation standard
211     appliqué aux états perturbés), que l'on veut faire pour chaque perturbation.
212     Cela change essentiellement le temps de chaque simulation élémentaire,
213     usuellement plus long en non-linéaire qu'en linéaire. Cette option n'est
214     utile que si le calcul supplémentaire "SimulationQuantiles" a été choisi. La
215     valeur par défaut est "Linear", et les choix possibles sont "Linear" et
216     "NonLinear".
217
218     Exemple : ``{"SimulationForQuantiles":"Linear"}``
219
220 Informations et variables disponibles à la fin de l'algorithme
221 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
222
223 En sortie, après exécution de l'algorithme, on dispose d'informations et de
224 variables issues du calcul. La description des
225 :ref:`section_ref_output_variables` indique la manière de les obtenir par la
226 méthode nommée ``get`` de la variable "*ADD*" du post-processing. Les variables
227 d'entrée, mises à disposition de l'utilisateur en sortie pour faciliter
228 l'écriture des procédures de post-processing, sont décrites dans
229 l':ref:`subsection_r_o_v_Inventaire`.
230
231 Les sorties non conditionnelles de l'algorithme sont les suivantes:
232
233   Analysis
234     *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un état optimal :math:`\mathbf{x}*`
235     en optimisation ou une analyse :math:`\mathbf{x}^a` en assimilation de
236     données.
237
238     Exemple : ``Xa = ADD.get("Analysis")[-1]``
239
240   CostFunctionJ
241     *Liste de valeurs*. Chaque élément est une valeur de fonctionnelle d'écart
242     :math:`J`.
243
244     Exemple : ``J = ADD.get("CostFunctionJ")[:]``
245
246   CostFunctionJb
247     *Liste de valeurs*. Chaque élément est une valeur de fonctionnelle d'écart
248     :math:`J^b`, c'est-à-dire de la partie écart à l'ébauche.
249
250     Exemple : ``Jb = ADD.get("CostFunctionJb")[:]``
251
252   CostFunctionJo
253     *Liste de valeurs*. Chaque élément est une valeur de fonctionnelle d'écart
254     :math:`J^o`, c'est-à-dire de la partie écart à l'observation.
255
256     Exemple : ``Jo = ADD.get("CostFunctionJo")[:]``
257
258 Les sorties conditionnelles de l'algorithme sont les suivantes:
259
260   APosterioriCorrelations
261     *Liste de matrices*. Chaque élément est une matrice de corrélations des
262     erreurs *a posteriori* de l'état optimal, issue de la matrice
263     :math:`\mathbf{A}*` des covariances.
264
265     Exemple : ``C = ADD.get("APosterioriCorrelations")[-1]``
266
267   APosterioriCovariance
268     *Liste de matrices*. Chaque élément est une matrice :math:`\mathbf{A}*` de
269     covariances des erreurs *a posteriori* de l'état optimal.
270
271     Exemple : ``A = ADD.get("APosterioriCovariance")[-1]``
272
273   APosterioriStandardDeviations
274     *Liste de matrices*. Chaque élément est une matrice diagonale d'écarts-types
275     des erreurs *a posteriori* de l'état optimal, issue de la matrice
276     :math:`\mathbf{A}*` des covariances.
277
278     Exemple : ``S = ADD.get("APosterioriStandardDeviations")[-1]``
279
280   APosterioriVariances
281     *Liste de matrices*. Chaque élément est une matrice diagonale de variances
282     des erreurs *a posteriori* de l'état optimal, issue de la matrice
283     :math:`\mathbf{A}*` des covariances.
284
285     Exemple : ``V = ADD.get("APosterioriVariances")[-1]``
286
287   BMA
288     *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un vecteur d'écart entre
289     l'ébauche et l'état optimal.
290
291     Exemple : ``bma = ADD.get("BMA")[-1]``
292
293   CurrentOptimum
294     *Liste de vecteurs*. Chaque élément est le vecteur d'état optimal au pas de
295     temps courant au cours du déroulement de l'algorithme d'optimisation. Ce
296     n'est pas nécessairement le dernier état.
297
298     Exemple : ``Xo = ADD.get("CurrentOptimum")[:]``
299
300   CurrentState
301     *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un vecteur d'état courant utilisé
302     au cours du déroulement de l'algorithme d'optimisation.
303
304     Exemple : ``Xs = ADD.get("CurrentState")[:]``
305
306   IndexOfOptimum
307     *Liste d'entiers*. Chaque élément est l'index d'itération de l'optimum
308     obtenu au cours du déroulement de l'algorithme d'optimisation. Ce n'est pas
309     nécessairement le numéro de la dernière itération.
310
311     Exemple : ``i = ADD.get("IndexOfOptimum")[-1]``
312
313   Innovation
314     *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un vecteur d'innovation, qui est
315     en statique l'écart de l'optimum à l'ébauche, et en dynamique l'incrément
316     d'évolution.
317
318     Exemple : ``d = ADD.get("Innovation")[-1]``
319
320   InnovationAtCurrentState
321     *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un vecteur d'innovation à l'état
322     courant.
323
324     Exemple : ``ds = ADD.get("InnovationAtCurrentState")[-1]``
325
326   MahalanobisConsistency
327     *Liste de valeurs*. Chaque élément est une valeur de l'indicateur de
328     qualité de Mahalanobis.
329
330     Exemple : ``m = ADD.get("MahalanobisConsistency")[-1]``
331
332   OMA
333     *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un vecteur d'écart entre
334     l'observation et l'état optimal dans l'espace des observations.
335
336     Exemple : ``oma = ADD.get("OMA")[-1]``
337
338   OMB
339     *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un vecteur d'écart entre
340     l'observation et l'état d'ébauche dans l'espace des observations.
341
342     Exemple : ``omb = ADD.get("OMB")[-1]``
343
344   SigmaObs2
345     *Liste de valeurs*. Chaque élément est une valeur de l'indicateur de
346     qualité :math:`(\sigma^o)^2` de la partie observation.
347
348     Exemple : ``so2 = ADD.get("SigmaObs")[-1]``
349
350   SimulatedObservationAtBackground
351     *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un vecteur d'observation simulé à
352     partir de l'ébauche :math:`\mathbf{x}^b`.
353
354     Exemple : ``hxb = ADD.get("SimulatedObservationAtBackground")[-1]``
355
356   SimulatedObservationAtCurrentOptimum
357     *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un vecteur d'observation simulé à
358     partir de l'état optimal au pas de temps courant au cours du déroulement de
359     l'algorithme d'optimisation, c'est-à-dire dans l'espace des observations.
360
361     Exemple : ``hxo = ADD.get("SimulatedObservationAtCurrentOptimum")[-1]``
362
363   SimulatedObservationAtCurrentState
364     *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un vecteur d'observation simulé à
365     partir de l'état courant, c'est-à-dire dans l'espace des observations.
366
367     Exemple : ``hxs = ADD.get("SimulatedObservationAtCurrentState")[-1]``
368
369   SimulatedObservationAtOptimum
370     *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un vecteur d'observation simulé à
371     partir de l'analyse ou de l'état optimal :math:`\mathbf{x}^a`.
372
373     Exemple : ``hxa = ADD.get("SimulatedObservationAtOptimum")[-1]``
374
375   SimulationQuantiles
376     *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un vecteur correspondant à l'état
377     observé qui réalise le quantile demandé, dans le même ordre que les
378     quantiles requis par l'utilisateur.
379
380     Exemple : ``sQuantiles = ADD.get("SimulationQuantiles")[:]``
381
382 Voir aussi
383 ++++++++++
384
385 Références vers d'autres sections :
386   - :ref:`section_ref_algorithm_Blue`
387   - :ref:`section_ref_algorithm_ExtendedBlue`
388   - :ref:`section_ref_algorithm_LinearityTest`
389
390 Références bibliographiques :
391   - [Byrd95]_
392   - [Morales11]_
393   - [Talagrand97]_