Salome HOME
Documentation for sampling update and examples improvement
[modules/adao.git] / doc / en / ref_algorithm_SamplingTest.rst
1 ..
2    Copyright (C) 2008-2023 EDF R&D
3
4    This file is part of SALOME ADAO module.
5
6    This library is free software; you can redistribute it and/or
7    modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
8    License as published by the Free Software Foundation; either
9    version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
10
11    This library is distributed in the hope that it will be useful,
12    but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
13    MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
14    Lesser General Public License for more details.
15
16    You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
17    License along with this library; if not, write to the Free Software
18    Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
19
20    See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
21
22    Author: Jean-Philippe Argaud, jean-philippe.argaud@edf.fr, EDF R&D
23
24 .. index:: single: SamplingTest
25 .. _section_ref_algorithm_SamplingTest:
26
27 Checking algorithm "*SamplingTest*"
28 -----------------------------------
29
30 .. ------------------------------------ ..
31 .. include:: snippets/Header2Algo01.rst
32
33 This test algorithm is used to establish the collection of values of an error
34 functional :math:`J` of type :math:`L^1`, :math:`L^2` or :math:`L^{\infty}`,
35 with or without weights, using the observation operator :math:`\mathcal{H}`,
36 for an a priori given sample of states :math:`\mathbf{x}`. The default error
37 functional is the augmented weighted least squares functional, classically used
38 in data assimilation, using in addition to observations :math:`\mathbf{y}^o`.
39
40 This test is useful for analyzing the sensitivity of the functional :math:`J`
41 to variations in the state :math:`\mathbf{x}` in particular.
42
43 The sampling of the states :math:`\mathbf{x}` can be given explicitly or under
44 form of hypercubes, explicit or sampled according to classic distributions, or
45 using Latin hypercube sampling (LHS). The computations are optimized according
46 to the computer resources available and the options requested by the user. You
47 can refer to the :ref:`section_ref_sampling_requirements` for an illustration
48 of sampling. Beware of the size of the hypercube (and then to the number of
49 computations) that can be reached, it can grow quickly to be quite large. When
50 a state is not observable, a *"NaN"* value is returned.
51
52 It is also possible to supply a set of simulations :math:`\mathbf{y}` already
53 established elsewhere (so there's no explicit need for an operator
54 :math:`\mathcal{H}`), which are implicitly associated with a set of state
55 samples :math:`\mathbf{x}`. In this case where the set of simulations is
56 provided, it is imperative to also provide the set of states :math:`\mathbf{x}`
57 by explicit sampling, whose state order corresponds to the order of the
58 simulations :math:`\mathbf{y}`.
59
60 To access the calculated information, the results of the sampling or
61 simulations must be requested **explicitly** to avoid storage difficulties (if
62 no results are requested, nothing is available). One use for that, on the
63 desired variable, the final saving through "*UserPostAnalysis*" or the
64 treatment during the calculation by well suited "*observer*".
65
66 .. ------------------------------------ ..
67 .. include:: snippets/Header2Algo02.rst
68
69 .. include:: snippets/CheckingPoint.rst
70
71 .. include:: snippets/BackgroundError.rst
72
73 .. include:: snippets/Observation.rst
74
75 .. include:: snippets/ObservationError.rst
76
77 .. include:: snippets/ObservationOperator.rst
78
79 .. ------------------------------------ ..
80 .. include:: snippets/Header2Algo03Chck.rst
81
82 .. include:: snippets/EnsembleOfSnapshots.rst
83
84 .. include:: snippets/QualityCriterion.rst
85
86 .. include:: snippets/SampleAsExplicitHyperCube.rst
87
88 .. include:: snippets/SampleAsIndependantRandomVariables.rst
89
90 .. include:: snippets/SampleAsMinMaxLatinHyperCube.rst
91
92 .. include:: snippets/SampleAsMinMaxStepHyperCube.rst
93
94 .. include:: snippets/SampleAsnUplet.rst
95
96 .. include:: snippets/SetDebug.rst
97
98 .. include:: snippets/SetSeed.rst
99
100 StoreSupplementaryCalculations
101   .. index:: single: StoreSupplementaryCalculations
102
103   *List of names*. This list indicates the names of the supplementary
104   variables, that can be available during or at the end of the algorithm, if
105   they are initially required by the user. Their availability involves,
106   potentially, costly calculations or memory consumptions. The default is then
107   a void list, none of these variables being calculated and stored by default
108   (excepted the unconditional variables). The possible names are in the
109   following list (the detailed description of each named variable is given in
110   the following part of this specific algorithmic documentation, in the
111   sub-section "*Information and variables available at the end of the
112   algorithm*"): [
113   "CostFunctionJ",
114   "CostFunctionJb",
115   "CostFunctionJo",
116   "CurrentState",
117   "EnsembleOfSimulations",
118   "EnsembleOfStates",
119   "Innovation",
120   "InnovationAtCurrentState",
121   "SimulatedObservationAtCurrentState",
122   ].
123
124   Example :
125   ``{"StoreSupplementaryCalculations":["CurrentState", "Residu"]}``
126
127 .. ------------------------------------ ..
128 .. include:: snippets/Header2Algo04.rst
129
130 .. include:: snippets/CostFunctionJ.rst
131
132 .. include:: snippets/CostFunctionJb.rst
133
134 .. include:: snippets/CostFunctionJo.rst
135
136 .. ------------------------------------ ..
137 .. include:: snippets/Header2Algo05.rst
138
139 .. include:: snippets/CostFunctionJ.rst
140
141 .. include:: snippets/CostFunctionJb.rst
142
143 .. include:: snippets/CostFunctionJo.rst
144
145 .. include:: snippets/CurrentState.rst
146
147 .. include:: snippets/EnsembleOfSimulations.rst
148
149 .. include:: snippets/EnsembleOfStates.rst
150
151 .. include:: snippets/Innovation.rst
152
153 .. include:: snippets/InnovationAtCurrentState.rst
154
155 .. include:: snippets/SimulatedObservationAtCurrentState.rst
156
157 .. ------------------------------------ ..
158 .. _section_ref_algorithm_SamplingTest_examples:
159
160 .. include:: snippets/Header2Algo06.rst
161
162 - :ref:`section_ref_algorithm_FunctionTest`
163 - :ref:`section_ref_algorithm_LocalSensitivityTest`
164
165 .. ------------------------------------ ..
166 .. include:: snippets/Header2Algo08.rst
167
168 - OPENTURNS, see the *User guide of OPENTURNS module* in the main "*Help*" menu of SALOME platform