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[modules/adao.git] / doc / en / ref_algorithm_Blue.rst
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2    Copyright (C) 2008-2014 EDF R&D
3
4    This file is part of SALOME ADAO module.
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12    but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
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15
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17    License along with this library; if not, write to the Free Software
18    Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
19
20    See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
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22    Author: Jean-Philippe Argaud, jean-philippe.argaud@edf.fr, EDF R&D
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24 .. index:: single: Blue
25 .. _section_ref_algorithm_Blue:
26
27 Calculation algorithm "*Blue*"
28 ------------------------------
29
30 Description
31 +++++++++++
32
33 This algorithm realizes a BLUE (Best Linear Unbiased Estimator) type estimation
34 of the state of a system. More precisely, it is an Aitken estimator.
35
36 This algorithm is always the fastest of all the assimilation algorithms of ADAO.
37 It is theoretically reserved for observation operator cases which are linear,
38 even if it sometimes works in "slightly" non-linear cases. One can verify the
39 linearity of the observation operator with the help of the
40 :ref:`section_ref_algorithm_LinearityTest`.
41
42 In case of non-linearity, even slightly marked, it will be easily prefered the
43 :ref:`section_ref_algorithm_ExtendedBlue` or the
44 :ref:`section_ref_algorithm_3DVAR`.
45
46 Optional and required commands
47 ++++++++++++++++++++++++++++++
48
49 .. index:: single: Background
50 .. index:: single: BackgroundError
51 .. index:: single: Observation
52 .. index:: single: ObservationError
53 .. index:: single: ObservationOperator
54 .. index:: single: StoreInternalVariables
55 .. index:: single: StoreSupplementaryCalculations
56 .. index:: single: Quantiles
57 .. index:: single: SetSeed
58 .. index:: single: NumberOfSamplesForQuantiles
59 .. index:: single: SimulationForQuantiles
60
61 The general required commands, available in the editing user interface, are the
62 following:
63
64   Background
65     *Required command*. This indicates the background or initial vector used,
66     previously noted as :math:`\mathbf{x}^b`. Its value is defined as a
67     "*Vector*" or a *VectorSerie*" type object.
68
69   BackgroundError
70     *Required command*. This indicates the background error covariance matrix,
71     previously noted as :math:`\mathbf{B}`. Its value is defined as a "*Matrix*"
72     type object, a "*ScalarSparseMatrix*" type object, or a
73     "*DiagonalSparseMatrix*" type object.
74
75   Observation
76     *Required command*. This indicates the observation vector used for data
77     assimilation or optimization, previously noted as :math:`\mathbf{y}^o`. It
78     is defined as a "*Vector*" or a *VectorSerie* type object.
79
80   ObservationError
81     *Required command*. This indicates the observation error covariance matrix,
82     previously noted as :math:`\mathbf{R}`. It is defined as a "*Matrix*" type
83     object, a "*ScalarSparseMatrix*" type object, or a "*DiagonalSparseMatrix*"
84     type object.
85
86   ObservationOperator
87     *Required command*. This indicates the observation operator, previously
88     noted :math:`H`, which transforms the input parameters :math:`\mathbf{x}` to
89     results :math:`\mathbf{y}` to be compared to observations
90     :math:`\mathbf{y}^o`. Its value is defined as a "*Function*" type object or
91     a "*Matrix*" type one. In the case of "*Function*" type, different
92     functional forms can be used, as described in the section
93     :ref:`section_ref_operator_requirements`. If there is some control :math:`U`
94     included in the observation, the operator has to be applied to a pair
95     :math:`(X,U)`.
96
97 The general optional commands, available in the editing user interface, are
98 indicated in :ref:`section_ref_assimilation_keywords`. In particular, the
99 optional command "*AlgorithmParameters*" allows to choose the specific options,
100 described hereafter, of the algorithm. See
101 :ref:`section_ref_options_AlgorithmParameters` for the good use of this command.
102
103 The options of the algorithm are the following:
104
105   StoreInternalVariables
106     This Boolean key allows to store default internal variables, mainly the
107     current state during iterative optimization process. Be careful, this can be
108     a numerically costly choice in certain calculation cases. The default is
109     "False".
110
111     Example : ``{"StoreInternalVariables":True}``
112
113   StoreSupplementaryCalculations
114     This list indicates the names of the supplementary variables that can be
115     available at the end of the algorithm. It involves potentially costly
116     calculations or memory consumptions. The default is a void list, none of
117     these variables being calculated and stored by default. The possible names
118     are in the following list: ["APosterioriCovariance", "BMA", "OMA", "OMB",
119     "Innovation", "SigmaBck2", "SigmaObs2", "MahalanobisConsistency",
120     "SimulationQuantiles"].
121
122     Example : ``{"StoreSupplementaryCalculations":["BMA","Innovation"]}``
123
124   Quantiles
125     This list indicates the values of quantile, between 0 and 1, to be estimated
126     by simulation around the optimal state. The sampling uses a multivariate
127     gaussian random sampling, directed by the *a posteriori* covariance matrix.
128     This option is useful only if the supplementary calculation
129     "SimulationQuantiles" has been chosen. The default is a void list.
130
131     Example : ``{"Quantiles":[0.1,0.9]}``
132
133   SetSeed
134     This key allow to give an integer in order to fix the seed of the random
135     generator used to generate the ensemble. A convenient value is for example
136     1000. By default, the seed is left uninitialized, and so use the default
137     initialization from the computer.
138
139     Example : ``{"SetSeed":1000}``
140
141   NumberOfSamplesForQuantiles
142     This key indicates the number of simulation to be done in order to estimate
143     the quantiles. This option is useful only if the supplementary calculation
144     "SimulationQuantiles" has been chosen. The default is 100, which is often
145     sufficient for correct estimation of common quantiles at 5%, 10%, 90% or
146     95%.
147
148     Example : ``{"NumberOfSamplesForQuantiles":100}``
149
150   SimulationForQuantiles
151     This key indicates the type of simulation, linear (with the tangent
152     observation operator applied to perturbation increments around the optimal
153     state) or non-linear (with standard observation operator applied to
154     perturbated states), one want to do for each perturbation. It changes mainly
155     the time of each elementary calculation, usually longer in non-linear than
156     in linear. This option is useful only if the supplementary calculation
157     "SimulationQuantiles" has been chosen. The default value is "Linear", and
158     the possible choices are "Linear" and "NonLinear".
159
160     Example : ``{"SimulationForQuantiles":"Linear"}``
161
162 See also
163 ++++++++
164
165 References to other sections:
166   - :ref:`section_ref_algorithm_ExtendedBlue`
167   - :ref:`section_ref_algorithm_3DVAR`
168   - :ref:`section_ref_algorithm_LinearityTest`
169
170 Bibliographical references:
171   - [Bouttier99]_