README.txt

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   2 ADAO: A module for Data Assimilation and Optimization
   3 =====================================================
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   5 About
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   8 **The ADAO module provides data assimilation and optimization**
   9 features in Python or SALOME context (see
  10 http://www.salome-platform.org/). Briefly stated, Data Assimilation is
  11 a methodological framework to compute the optimal estimate of the
  12 inaccessible true value of a system state, eventually over time. It
  13 uses information coming from experimental measurements or observations,
  14 and from numerical *a priori* models, including information about their
  15 errors. Parts of the framework are also known under the names of
  16 *parameter estimation*, *inverse problems*, *Bayesian estimation*,
  17 *optimal interpolation*, etc. More details can be found in the full
  18 ADAO documentation (see http://www.salome-platform.org/).
  19
  20 Only the use of ADAO text programming interface (API/TUI) is introduced
  21 here. This interface gives ability to create a calculation object in a
  22 similar way than the case building obtained through the graphical
  23 interface (GUI). When one wants to elaborate "by hand" the TUI
  24 calculation case, it is recommended to extensively use all the ADAO
  25 module documentation, and to go back if necessary to the graphical
  26 interface (GUI), to get all the elements allowing to correctly set the
  27 commands.
  28
  29 A simple setup example of an ADAO TUI calculation case
  30 ------------------------------------------------------
  31
  32 To introduce the TUI interface, lets begin by a simple but complete
  33 example of ADAO calculation case. All the data are explicitly defined
  34 inside the script in order to make the reading easier. The whole set of
  35 commands is the following one::
  36
  37     from numpy import array, matrix
  38     from adao import adaoBuilder
  39     case = adaoBuilder.New()
  40     case.set( 'AlgorithmParameters', Algorithm='3DVAR' )
  41     case.set( 'Background',          Vector=[0, 1, 2] )
  42     case.set( 'BackgroundError',     ScalarSparseMatrix=1.0 )
  43     case.set( 'Observation',         Vector=array([0.5, 1.5, 2.5]) )
  44     case.set( 'ObservationError',    DiagonalSparseMatrix='1 1 1' )
  45     case.set( 'ObservationOperator', Matrix='1 0 0;0 2 0;0 0 3' )
  46     case.set( 'Observer',            Variable="Analysis", Template="ValuePrinter" )
  47     case.execute()
  48
  49 The result of running these commands in SALOME (either as a SALOME
  50 "*shell*" command, in the Python command window of the interface, or by
  51 the script execution entry of the menu) is the following::
  52
  53     Analysis [ 0.25000264  0.79999797  0.94999939]
  54
  55 More advanced examples of ADAO TUI calculation case
  56 ---------------------------------------------------
  57
  58 Real cases involves observations loaded from files, operators
  59 explicitly defined as generic functions including physical simulators,
  60 time dependant information in order to deal with forecast analysis in
  61 addition to calibration or re-analysis. More details can be found in
  62 the full ADAO documentation (see http://www.salome-platform.org/).
  63
  64 License and requirements
  65 ------------------------
  66
  67 The license for this module is the GNU Lesser General Public License
  68 (Lesser GPL), as stated here and in the source files::
  69
  70     <ADAO, a module for Data Assimilation and Optimization>
  71
  72     Copyright (C) 2008-2020 EDF R&D
  73
  74     This library is free software; you can redistribute it and/or
  75     modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
  76     License as published by the Free Software Foundation; either
  77     version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
  78
  79     This library is distributed in the hope that it will be useful,
  80     but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  81     MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU
  82     Lesser General Public License for more details.
  83
  84     You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  85     License along with this library; if not, write to the Free Software
  86     Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA
  87
  88     See http://www.salome-platform.org/
  89
  90 In addition, we require that all publication or presentation describing
  91 work using this software, or all commercial or not products using it,
  92 quote at least one of the references given below:
  93
  94     * *ADAO, a module for Data Assimilation and Optimization*,
  95       http://www.salome-platform.org/
  96
  97     * *ADAO, un module pour l'Assimilation de Données et l'Aide à
  98       l'Optimisation*, http://www.salome-platform.org/
  99
 100     * *SALOME The Open Source Integration Platform for Numerical Simulation*,
 101       http://www.salome-platform.org/
 102
 103 The documentation of the module is also covered by the license and the
 104 requirement of quoting.