CMakeLists.txt

   1 cmake_minimum_required (VERSION 3.1)
   2 set(CMAKE_CXX_STANDARD 11)
   3 set(CMAKE_CXX_STANDARD_REQUIRED ON)
   4
   5 # Project name
   6 project (SOLVERLAB C CXX)
   7 set (SOLVERLAB_VERSION_MAJOR 0)
   8 set (SOLVERLAB_VERSION_MINOR 1)
   9
  10 option (SOLVERLAB_WITH_DOCUMENTATION "Generate SOLVERLAB documentation" ON)
  11 option (SOLVERLAB_WITH_PYTHON        "Compile Python interface of SOLVERLAB" ON)
  12 option (SOLVERLAB_WITH_GUI           "Compile a Graphic user Interface for SOLVERLAB" OFF)
  13 option (SOLVERLAB_WITH_PACKAGE       "Generate RPM, Debian and tarball packages" OFF)
  14 option (SOLVERLAB_WITH_COREFLOWS     "Generate COREFLOWS module" ON)
  15 option (SOLVERLAB_WITH_TESTS         "Generate SOLVERLAB example tests" ON)
  16
  17 #Path to installed libraries
  18 set (PETSC_DIR            OFF CACHE STRING "PETSc library path" )
  19 set (SLEPC_DIR            OFF CACHE STRING "SLEPc library path" )
  20 set (HDF5_ROOT            OFF CACHE STRING "HDF5 library path" )#For the compilation of MED with a specific version of HDF5
  21 set (MEDFILE_ROOT_DIR     OFF CACHE STRING "MED library path" )
  22 set (MEDCOUPLING_ROOT_DIR OFF CACHE STRING "MEDCoupling library path" )
  23
  24 #url of tarball librairies
  25 set (DOWNLOAD_PETSC         http://ftp.mcs.anl.gov/pub/petsc/release-snapshots/petsc-lite-3.13.5.tar.gz
  26      CACHE STRING           "PETSc tarball path/url" )
  27 set (DOWNLOAD_SLEPC         https://slepc.upv.es/download/distrib/slepc-3.13.4.tar.gz
  28      CACHE STRING           "SLEPC tarball path/url" )
  29 set (DOWNLOAD_F2CBLASLAPACK https://www.mcs.anl.gov/petsc/mirror/externalpackages/f2cblaslapack-3.4.2.q4.tar.gz
  30      CACHE STRING           "F2CBLASLAPACK tarball path/url" )
  31 set (DOWNLOAD_HDF5          https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.10/hdf5-1.10.3/src/hdf5-1.10.3.tar.gz
  32      CACHE STRING           "HDF5 tarball path/url" )
  33 set (DOWNLOAD_MED           http://files.salome-platform.org/Salome/other/med-4.1.0.tar.gz
  34      CACHE STRING           "MED tarball path/url")
  35 set (DOWNLOAD_MEDCOUPLING   http://files.salome-platform.org/Salome/other/medCoupling-9.4.0.tar.gz
  36      CACHE STRING           "MEDCoupling tarball path/url" )
  37
  38 list (APPEND CMAKE_MODULE_PATH "${SOLVERLAB_SOURCE_DIR}/cmake_files")
  39 include(ExternalProject)#For PETSc, MED and MEDCoupling
  40 ######################################################
  41 # Detection or compilation of PETSc+SLEPc+HDF5       #
  42 ######################################################
  43   if ( DEFINED ENV{PETSC_DIR} OR PETSC_DIR)
  44     if   (NOT PETSC_DIR)
  45       set(PETSC_DIR $ENV{PETSC_DIR})
  46       message ( STATUS "Checking variable PETSC_DIR : " $ENV{PETSC_DIR} )
  47     else (NOT PETSC_DIR)
  48       message ( STATUS "Checking variable PETSC_DIR : " ${PETSC_DIR} )
  49     endif(NOT PETSC_DIR)
  50
  51     find_package (PETSc 3.4 REQUIRED)
  52     petsc_get_version ()
  53
  54     message ( STATUS "PETSc found. Version is ${PETSC_VERSION_MAJOR}.${PETSC_VERSION_MINOR}.${PETSC_VERSION_SUBMINOR}" )
  55     set(PETSC_INSTALL ${PETSC_DIR})
  56
  57     #Define and search slepc variables
  58     if   ( NOT SLEPC_DIR )
  59       if   ( DEFINED ENV{SLEPC_DIR} )
  60         set(SLEPC_DIR $ENV{SLEPC_DIR})
  61       else ( DEFINED ENV{SLEPC_DIR} )
  62         set(SLEPC_DIR ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH})
  63       endif( DEFINED ENV{SLEPC_DIR} )
  64     endif( NOT SLEPC_DIR)
  65
  66     message ( STATUS "Checking variable SLEPC_DIR" )
  67     if ( IS_DIRECTORY ${SLEPC_DIR}/include AND EXISTS ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc.so)
  68       set(SLEPC_INCLUDES  ${SLEPC_DIR}/include)
  69       set(SLEPC_LIBRARIES ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc.so)
  70       message( STATUS "SLEPc found at ${SLEPC_DIR}" )
  71     else()
  72       message( FATAL_ERROR "SLEPc not found at ${SLEPC_DIR}" )
  73     endif()
  74
  75     #define hdf5 variables
  76     if   ( NOT HDF5_ROOT )#hdf5 is not defined in cmake arguments
  77       if  ( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is defined in the environment
  78         set(HDF5_ROOT $ENV{HDF5_ROOT})
  79       else( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is not defined in the environment
  80         #HDF5 to be found in petsc external packages
  81         set(HDF5_ROOT ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH})# define hint for hdf5/med installation in petsc external packages
  82       endif( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )
  83     endif( NOT HDF5_ROOT )
  84     set(HDF5_LIBRARY_DIR  ${HDF5_ROOT}/lib)
  85     set(HDF5_INCLUDE_DIRS ${HDF5_ROOT}/include)
  86   else ( DEFINED ENV{PETSC_DIR} OR PETSC_DIR )
  87     message ( STATUS "PETSC_DIR not set, searching PETSc and SLEPc in the system" )
  88
  89     if ( IS_DIRECTORY "/usr/include/petsc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libpetsc.so" )  #Case fedora/redhat system install
  90       message ( STATUS "PETSC includes found in /usr/include/petsc/" )
  91       message ( STATUS "PETSC library  found in /usr/lib64" )
  92       set(PETSC_DIR /usr/)
  93       set(PETSC_INCLUDES  /usr/include/petsc /usr/include/petsc/petsc/mpiuni)
  94       set(PETSC_LIBRARIES /usr/lib64/libpetsc.so)
  95
  96       set(PETSC_VERSION "3.8") #3.8 for fedora 26 , 3.9 for fedora 29 , 3.10 for fedora 30, , 3.12 for fedora 32
  97
  98       set(CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES   "${CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES}, petsc-devel (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
  99       set(PETSC_INSTALL ${PETSC_DIR})
 100
 101       #Define and search slepc variables
 102       if   ( IS_DIRECTORY "/usr/include/slepc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libslepc.so" )
 103         message( STATUS "SLEPc includes found in /usr/include/slepc/" )
 104         message( STATUS "SLEPc library  found in /usr/lib64/slepc/" )
 105         set(SLEPC_DIR /usr/)
 106         set(SLEPC_INCLUDES  ${SLEPC_DIR}/include)
 107         set(SLEPC_LIBRARIES ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc.so)
 108         set (CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES   "${CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES}, slepc-devel (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 109       else ( IS_DIRECTORY "/usr/include/slepc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libslepc.so" )
 110         message( FATAL_ERROR "SLEPc not found in the system" )
 111       endif( IS_DIRECTORY "/usr/include/slepc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libslepc.so" )
 112
 113       #HDF5 to be found in the system
 114       if   ( NOT HDF5_ROOT AND NOT DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is not defined in the environment
 115         find_package(HDF5 REQUIRED)
 116         set(CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS "libhdf5-dev")
 117         set(CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES   "hdf5-devel")
 118       endif( NOT HDF5_ROOT AND NOT DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )
 119
 120     #elseif ( IS_DIRECTORY "/usr/lib/petsc/include" AND EXISTS "/usr/lib/petsc/lib/libpetsc_real.so" ) #Case ubuntu/debian system install
 121     #  message ( STATUS "PETSc includes found in /usr/lib/petsc/include")
 122     #  message ( STATUS "PETSc library  found in /usr/lib/petsc/lib/libpetsc_real.so")
 123     #  set(PETSC_DIR /usr/lib/petsc/)
 124     #  set(PETSC_INCLUDES  ${PETSC_DIR}/include ${PETSC_DIR}/include/petsc/mpiuni)
 125     #  set(PETSC_LIBRARIES ${PETSC_DIR}/lib/libpetsc_real.so)
 126
 127     #  find_package (PETSc 3.4 REQUIRED)
 128     #  petsc_get_version ()
 129     #  set (CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS "${CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS}, petsc-dev   (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 130
 131     #  Define and search slepc variables
 132     #  if   ( IS_DIRECTORY "/usr/lib/slepc/include" AND EXISTS "/usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 133     #    message( STATUS "SLEPc includes found in /usr/lib/slepc/include" )
 134     #    message( STATUS "SLEPc library  found in /usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 135     #    set(SLEPC_DIR /usr/lib/slepc/)
 136     #    set(SLEPC_INCLUDES ${SLEPC_DIR}/include)
 137     #    set(SLEPC_LIBRARIES ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc_real.so)
 138     #    set (CPACK_DEBIAN_PACKAGE_REQUIRES   "${CPACK_DEBIAN_PACKAGE_REQUIRES}, slepc-devel (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 139     #  else ( IS_DIRECTORY "/usr/lib/slepc/include" AND EXISTS "/usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 140     #    message( FATAL_ERROR "SLEPc not found in the system" )
 141     #  endif( IS_DIRECTORY "/usr/lib/slepc/include" AND EXISTS "/usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 142
 143     #elseif ( IS_DIRECTORY "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/petsc") #Case ubuntu/debian system pip install
 144
 145     else ( IS_DIRECTORY "/usr/include/petsc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libpetsc.so" )  # No petsc in system, do compile petsc along with slepc as an external package
 146       message (STATUS "PETSC not found in the system")
 147       message (STATUS "PETSC will be downloaded and compiled from ${DOWNLOAD_PETSC}" )
 148       message (STATUS "SLEPC will be downloaded and compiled from ${DOWNLOAD_SLEPC}" )
 149       message (STATUS "HDF5  will be downloaded and compiled from ${DOWNLOAD_HDF5}" )
 150
 151       #extract tarball name
 152       string(LENGTH "${DOWNLOAD_PETSC}" tarball_url_length)#length of the tarball
 153       string(FIND   "${DOWNLOAD_PETSC}" "/" start_tarball_name REVERSE )# last occurence of "/"
 154       MATH(EXPR start_tarball_name  "${start_tarball_name}+1")#start after the occurence of "/"
 155       MATH(EXPR tarball_name_length "${tarball_url_length}-${start_tarball_name}-7")#name ends before .tar.gz that counts for 7 characters
 156       string(SUBSTRING ${DOWNLOAD_PETSC} ${start_tarball_name} ${tarball_name_length} PETSC_TARBALL_NAME)
 157
 158       set(PETSC_DIR ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis/${PETSC_TARBALL_NAME}) # Location of the final install
 159       set(PETSC_ARCH arch-linux-c-opt)
 160       set(PETSC_INSTALL ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/petsc)#folder to copy petsc libraries and include files
 161
 162       ExternalProject_Add (PETSc
 163       URL               ${DOWNLOAD_PETSC}
 164       SOURCE_DIR        ${PETSC_DIR}
 165       BUILD_IN_SOURCE   TRUE
 166       CONFIGURE_COMMAND <SOURCE_DIR>/configure --prefix=${PETSC_INSTALL} --with-debugging=0 --with-mpi=0 --download-f2cblaslapack=${DOWNLOAD_F2CBLASLAPACK} --with-fc=0 --download-slepc=${DOWNLOAD_SLEPC} --download-hdf5=${DOWNLOAD_HDF5}
 167       BUILD_COMMAND     make all
 168       TEST_COMMAND      make check
 169       INSTALL_COMMAND   make install
 170       INSTALL_DIR       ${PETSC_DIR}
 171       STAMP_DIR         ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis
 172       LOG_DOWNLOAD      TRUE           # Wrap download in script to log output
 173       LOG_UPDATE        TRUE           # Wrap update in script to log output
 174       LOG_CONFIGURE     TRUE           # Wrap configure in script to log output
 175       LOG_BUILD         TRUE           # Wrap build in script to log output
 176       LOG_TEST          TRUE           # Wrap test in script to log output
 177       LOG_INSTALL       TRUE           # Wrap install in script to log output
 178        )
 179
 180       message( STATUS "PETSc, SLEPc and HDF5 will be installed at ${PETSC_INSTALL}")
 181
 182       string(LENGTH "${PETSC_TARBALL_NAME}" tarball_name_length)#length of the tarball
 183       string(FIND   "${PETSC_TARBALL_NAME}" "-" start_version_name REVERSE )# last occurence of "-"
 184       MATH(EXPR start_version_name  "${start_version_name}+1")#start after the occurence of "/"
 185       string(SUBSTRING ${PETSC_TARBALL_NAME} ${start_version_name} ${tarball_name_length} PETSC_VERSION)
 186       message( STATUS "PETSc version ${PETSC_VERSION}  will be installed" )
 187
 188       set(PETSC_INCLUDES  ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/include ${PETSC_DIR}/include)
 189       set(PETSC_LIBRARIES ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/lib/libpetsc.so)
 190
 191       #define slepc variables
 192       set(SLEPC_DIR ${PETSC_INSTALL})
 193       set(SLEPC_INCLUDES ${SLEPC_DIR}/include  ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/externalpackages/slepc-3.13.4/include ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/externalpackages/slepc-3.13.4/installed-arch-linux2-c-opt/include)
 194       set(SLEPC_LIBRARIES ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/externalpackages/slepc-3.13.4/installed-arch-linux2-c-opt/lib/libslepc.so)
 195       message( STATUS "SLEPc includes ${SLEPC_INCLUDES}")
 196
 197       #define hdf5 variables
 198       if   ( NOT HDF5_ROOT )#hdf5 is not defined in cmake arguments
 199         if  ( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is defined in the environment
 200           set(HDF5_ROOT $ENV{HDF5_ROOT})
 201         else( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is not defined in the environment
 202           set(HDF5_ROOT ${PETSC_INSTALL})#HDF5 to be found in petsc installation
 203         endif( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )
 204       endif( NOT HDF5_ROOT )
 205       set(HDF5_LIBRARY_DIR ${HDF5_ROOT}/lib)
 206       set(HDF5_INCLUDE_DIRS ${HDF5_ROOT}/include)
 207
 208     endif ( IS_DIRECTORY "/usr/include/petsc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libpetsc.so" )
 209   endif ( DEFINED ENV{PETSC_DIR} OR PETSC_DIR )
 210
 211   if   ( ${PETSC_VERSION} VERSION_GREATER 3.5 )
 212     add_definitions(-DPETSC_VERSION_GREATER_3_5)
 213   endif( ${PETSC_VERSION} VERSION_GREATER 3.5 )
 214
 215 string(REPLACE ";" ":"  PETSC_INCLUDES_INSTALL "${PETSC_INCLUDES}")# use colon instead of semicolon in environment file env_SOLVERLAB.sh
 216
 217 add_library(petsc   SHARED IMPORTED)
 218 set_property(TARGET petsc  PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${PETSC_LIBRARIES})
 219 add_library(slepc   SHARED IMPORTED)
 220 set_property(TARGET slepc  PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${SLEPC_LIBRARIES})
 221
 222 ######################################################
 223 # Detection or compilation of MEDFile                #
 224 ######################################################
 225 if( MEDFILE_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDFILE_ROOT_DIR})
 226
 227   if   ( NOT MEDFILE_ROOT_DIR )
 228     set(MEDFILE_ROOT_DIR $ENV{MEDFILE_ROOT_DIR} )
 229   endif( NOT MEDFILE_ROOT_DIR )
 230
 231   find_package (MEDFile REQUIRED)
 232   message (STATUS "MEDFile found in ${MEDFILE_ROOT_DIR}")
 233
 234 else( MEDFILE_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDFILE_ROOT_DIR})
 235
 236   message(STATUS "MED will be downloaded and installed from ${DOWNLOAD_MED}")
 237   set(MACHINE PCLINUX)
 238   set(MEDFILE_DEFINITIONS "-D${MACHINE} -DMEDFILE_INSTALL_DOC=OFF")#Comment ne pas compiler la doc ?
 239   set(MEDFILE_ROOT_DIR ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/med) # Location of the final install
 240
 241   #extraction of the tarball archive name
 242   string(LENGTH "${DOWNLOAD_MED}" tarball_url_length)#length of the name of the tarball
 243   string(FIND "${DOWNLOAD_MED}" "/" start_tarball_name REVERSE )# last occurence of "/"
 244   MATH(EXPR start_tarball_name "${start_tarball_name}+1")#start after the occurence of "/"
 245   MATH(EXPR tarball_name_length "${tarball_url_length}-${start_tarball_name}-7")#name ends before .tar.gz that counts for 7 characters
 246   string(SUBSTRING ${DOWNLOAD_MED} ${start_tarball_name} ${tarball_name_length} MED_TARBALL_NAME)
 247
 248   ExternalProject_Add (MED
 249         URL               ${DOWNLOAD_MED}  #location of med tarball
 250         SOURCE_DIR        ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis/${MED_TARBALL_NAME}
 251         BUILD_IN_SOURCE   TRUE
 252         CONFIGURE_COMMAND <SOURCE_DIR>/configure --prefix=${MEDFILE_ROOT_DIR}  --with-hdf5=${HDF5_ROOT} --with-hdf5-include=${HDF5_ROOT}/include --with-hdf5-lib=${HDF5_LIBRARY_DIR} --with-hdf5-bin=${HDF5_ROOT}/bin  --with-swig=yes
 253         BUILD_COMMAND     make
 254         INSTALL_COMMAND   make install
 255         INSTALL_DIR       ${MEDFILE_ROOT_DIR}
 256         STAMP_DIR         ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis
 257         LOG_DOWNLOAD      TRUE           # Wrap download in script to log output
 258         LOG_UPDATE        TRUE           # Wrap update in script to log output
 259         LOG_CONFIGURE     TRUE           # Wrap configure in script to log output
 260         LOG_BUILD         TRUE           # Wrap build in script to log output
 261         LOG_TEST          TRUE           # Wrap test in script to log output
 262         LOG_INSTALL       TRUE           # Wrap install in script to log output
 263   )
 264
 265   set(MEDFILE_INCLUDE_DIRS ${MEDFILE_ROOT_DIR}/include)# Nécessaire pour le medloader et les sous-dossiers mesh, et IJKMesh
 266   set(MEDFILE_LIBRARIES    ${MEDFILE_ROOT_DIR}/lib)# Nécessaire pour le env_SOLVERLAB.sh
 267   set(MEDFILE_C_LIBRARIES med medC)# Nécessaire pour le medloader
 268
 269 endif( MEDFILE_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDFILE_ROOT_DIR})
 270
 271 add_library(med   SHARED IMPORTED)
 272 set_property(TARGET med  PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDFILE_ROOT_DIR}/lib/libmed.so)
 273 add_library(medC   SHARED IMPORTED)
 274 set_property(TARGET medC PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDFILE_ROOT_DIR}/lib/libmedC.so)
 275
 276 string(REPLACE ";" ":"  MEDFILE_LIBRARIES_INSTALL "${MEDFILE_LIBRARIES}")# use colon instead of semicolon in environment file env_SOLVERLAB.sh
 277
 278 ######################################################
 279 # Detection or compilation of MEDCoupling            #
 280 ######################################################
 281 if( MEDCOUPLING_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR})
 282
 283   if( NOT MEDCOUPLING_ROOT_DIR )
 284     set(MEDCOUPLING_ROOT_DIR $ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR} )
 285   endif( NOT MEDCOUPLING_ROOT_DIR )
 286
 287   message (STATUS "Seeking MEDCoupling library in ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}")
 288
 289   if( NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include/MEDCoupling.hxx)
 290     message (FATAL_ERROR "MEDCoupling library not found in ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}")
 291   else( NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include/MEDCoupling.hxx)
 292     message (STATUS "MEDCoupling library found in ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}")
 293   endif( NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include/MEDCoupling.hxx)
 294
 295 else( MEDCOUPLING_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR})
 296   message(STATUS "MEDCoupling will be downloaded and installed from ${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}")
 297   set(MEDCOUPLING_ROOT_DIR ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/medcoupling) # Location of the final install
 298   SET(ENV{HDF5_ROOT} ${HDF5_ROOT})#MEDCoupling install process seems to require an environment variable
 299
 300   #extraction of the tarball archive name
 301   string(LENGTH "${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}" tarball_url_length)#length of the tarball
 302   string(FIND   "${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}" "/" start_tarball_name REVERSE )# last occurence of "/"
 303   MATH(EXPR start_tarball_name "${start_tarball_name}+1")#start after the occurence of "/"
 304   MATH(EXPR tarball_name_length "${tarball_url_length}-${start_tarball_name}-7")#name ends before .tar.gz that counts for 7 characters
 305   string(SUBSTRING ${DOWNLOAD_MEDCOUPLING} ${start_tarball_name} ${tarball_name_length} MEDCOUPLING_TARBALL_NAME)
 306   string(SUBSTRING ${MEDCOUPLING_TARBALL_NAME} 12 ${tarball_name_length} MEDCOUPLING_VERSION_NAME)
 307
 308   message(STATUS "MEDCoupling version is ${MEDCOUPLING_VERSION_NAME}")
 309
 310   ExternalProject_Add (MEDCoupling
 311         URL               ${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}  #location of medcoupling tarball
 312         SOURCE_DIR        ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis/${MEDCOUPLING_TARBALL_NAME}
 313 #        BUILD_IN_SOURCE   FALSE
 314         CONFIGURE_COMMAND cmake <SOURCE_DIR>/${MEDCOUPLING_TARBALL_NAME} -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=${MEDCOUPLING_ROOT_DIR} -DCONFIGURATION_ROOT_DIR=<SOURCE_DIR>/configuration-${MEDCOUPLING_VERSION_NAME} -DMEDFILE_ROOT_DIR=${MEDFILE_ROOT_DIR} -DMEDCOUPLING_ENABLE_PARTITIONER=OFF -DMEDCOUPLING_PARTITIONER_METIS=OFF -DMEDCOUPLING_PARTITIONER_SCOTCH=OFF -DMEDCOUPLING_ENABLE_RENUMBER=OFF -DMEDCOUPLING_BUILD_DOC=OFF -DHDF5_ROOT_DIR=${HDF5_ROOT}
 315         BUILD_COMMAND     make
 316         INSTALL_COMMAND   make install
 317         INSTALL_DIR       ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}
 318         STAMP_DIR         ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis
 319         LOG_DOWNLOAD      TRUE           # Wrap download in script to log output
 320         LOG_UPDATE        TRUE           # Wrap update in script to log output
 321         LOG_CONFIGURE     TRUE           # Wrap configure in script to log output
 322         LOG_BUILD         TRUE           # Wrap build in script to log output
 323         LOG_TEST          TRUE           # Wrap test in script to log output
 324         LOG_INSTALL       TRUE           # Wrap install in script to log output
 325   )
 326
 327 endif( MEDCOUPLING_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR} )
 328
 329 set(MEDCOUPLING_INCLUDE_DIR ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include)
 330 set(MEDCOUPLING_LIBRARIES   ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib    )#for environment file env_SOLVERLAB.sh
 331
 332 add_library(medloader   SHARED IMPORTED )
 333 set_property(TARGET medloader   PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so)
 334 add_library(medcoupling SHARED IMPORTED )
 335 set_property(TARGET medcoupling PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so)
 336
 337 if   (TARGET MED AND TARGET PETSc)
 338   ExternalProject_Add_StepDependencies( MED build PETSc )#PETSc doit être compilé avant MED car c'est PETSc qui compile HDF5
 339 endif(TARGET MED AND TARGET PETSc)
 340
 341 if   (TARGET MED AND TARGET MEDCoupling)
 342   ExternalProject_Add_StepDependencies( MEDCoupling build MED )#MED doit être compilé avant MEDCoupling
 343 endif(TARGET MED AND TARGET MEDCoupling)
 344
 345 if   (TARGET PETSc AND TARGET MEDCoupling)
 346   ExternalProject_Add_StepDependencies( MEDCoupling build PETSc )#PETSc doit être compilé avant MEDCoupling (car il contient hdf5)
 347 endif(TARGET PETSc AND TARGET MEDCoupling)
 348
 349 ####################
 350 # Final operations #
 351 ####################
 352
 353 # Paraview variables for env_SOLVERLAB.sh
 354 if( NOT DEFINED PARAVIEW_VERSION )
 355   if( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR)
 356     set( PARAVIEW_INCLUDE_DIR   ${PARAVIEW_ROOT_DIR}/include)
 357     set( PARAVIEW_LIBRARIES_DIR ${PARAVIEW_ROOT_DIR}/lib)
 358   else( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR)
 359     set( PARAVIEW_INCLUDE_DIR /usr/include/paraview/)
 360     set( PARAVIEW_LIBRARIES_DIR /usr/lib/paraview/:/usr/lib64/paraview/:/usr/lib64/vtk/:/usr/lib/vtk/)
 361   endif( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR)
 362
 363   #extraction of the paraview version"
 364   IF   ( EXISTS ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR}/vtkPVConfig.h )
 365     file(STRINGS ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR}/vtkPVConfig.h vtkConfig)
 366   ELSE ( EXISTS ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR}/vtkPVConfig.h )
 367     message(WARNING "Could not find ParaView configuration file vtkPVConfig.h in folder ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR}. Postprocessing may not work")
 368   ENDIF( EXISTS ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR}/vtkPVConfig.h )
 369
 370   FOREACH(line ${vtkConfig})
 371     string(FIND "${line}" "#define PARAVIEW_VERSION_FULL " pos)
 372     IF(NOT ${pos} EQUAL -1)
 373       string(LENGTH ${line} line_length)#length of the tarball
 374       MATH(EXPR start_pv_version "${line_length}-6")#line ends with "x.y.z", that counts for 7 characters
 375       string(SUBSTRING ${line} ${start_pv_version} 5 PARAVIEW_VERSION)
 376       break()
 377     ENDIF(NOT ${pos} EQUAL -1)
 378   ENDFOREACH(line vtkConfig)
 379 endif(NOT DEFINED PARAVIEW_VERSION)
 380
 381 message(STATUS "ParaView version is ${PARAVIEW_VERSION}" )
 382 IF   ( ${PARAVIEW_VERSION} STRGREATER "5.6" OR ${PARAVIEW_VERSION} STREQUAL "5.6" )#Use python 3, use VERSION_GREATER_EQUAL if cmake >=3.7
 383   SET(PYTHON2OR3 "3")
 384 ELSE ( ${PARAVIEW_VERSION} STRGREATER "5.6" OR ${PARAVIEW_VERSION} STREQUAL "5.6" )#Use python 2
 385   SET(PYTHON2OR3 "2")
 386 ENDIF( ${PARAVIEW_VERSION} STRGREATER "5.6" OR ${PARAVIEW_VERSION} STREQUAL "5.6" )
 387
 388     set (PV_LIB_DIR    /usr/lib/python${PYTHON2OR3}.7/dist-packages/paraview/:/usr/lib64/python${PYTHON2OR3}.7/site-packages/vtk/:${PARAVIEW_LIBRARIES_DIR})
 389     set (PV_PYTHON_DIR /usr/lib/python${PYTHON2OR3}.7/dist-packages/paraview/:/usr/lib64/python${PYTHON2OR3}.7/site-packages/vtk/:/usr/lib64/paraview/site-packages/:/usr/lib64/paraview/site-packages/paraview/:/usr/lib64/paraview/site-packages/vtk/:/usr/lib64/paraview/python${PYTHON2OR3}.7/site-packages/:/usr/lib64/paraview/python${PYTHON2OR3}.7/site-packages/paraview/:/usr/lib64/paraview/python${PYTHON2OR3}.7/site-packages/vtkmodules:/usr/lib/paraview/site-packages/paraview:/usr/lib/paraview/site-packages/paraview/vtk)
 390
 391 # Find python
 392 IF   (${CMAKE_VERSION} VERSION_GREATER "3.12.0")
 393   find_package(Python ${PYTHON2OR3} REQUIRED COMPONENTS Interpreter Development )
 394   SET(PYTHON_EXECUTABLE ${Python_EXECUTABLE})
 395 ELSE (${CMAKE_VERSION} VERSION_GREATER "3.12.0")
 396   find_package(PythonInterp ${PYTHON2OR3} REQUIRED )
 397   find_package(PythonLibs   ${PYTHON2OR3} REQUIRED )
 398   set(Python_LIBRARIES    ${PYTHON_LIBRARIES})
 399   set(Python_INCLUDE_DIRS ${PYTHON_INCLUDE_DIRS})
 400   set(Python_VERSION      ${PYTHON_VERSION_STRING})
 401 ENDIF(${CMAKE_VERSION} VERSION_GREATER "3.12.0")
 402
 403 message(STATUS "Python version is ${Python_VERSION}")
 404 find_package (SWIG 3.0 REQUIRED)
 405
 406 if (SOLVERLAB_WITH_DOCUMENTATION)                                                                           #
 407   find_package (Doxygen)                                                                                    #
 408   set (CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS "${CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS}, doxygen, graphviz, mscgen")
 409   set (CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES "${CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES}, doxygen, graphviz, mscgen")
 410   if   (NOT DOXYGEN_FOUND)
 411     message (FATAL_ERROR "Doxygen is needed to build the documentation. Please install it correctly.")
 412   endif(NOT DOXYGEN_FOUND)
 413 endif()
 414 if (SOLVERLAB_WITH_TESTS)                                                                                  #
 415   enable_testing ()
 416   find_package (CPPUNIT REQUIRED)
 417 endif()
 418 find_package (XDR REQUIRED)
 419
 420 # Enter subdirectories
 421 add_subdirectory (CDMATH)
 422 if(SOLVERLAB_WITH_COREFLOWS)
 423   add_subdirectory (CoreFlows)
 424 endif(SOLVERLAB_WITH_COREFLOWS)
 425
 426 # Configuration file
 427 configure_file(
 428     ${PROJECT_SOURCE_DIR}/env_SOLVERLAB.sh
 429     ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/env_SOLVERLAB.sh
 430     @ONLY
 431 )
 432
 433