CMakeLists.txt

   1 cmake_minimum_required (VERSION 3.1)
   2 set(CMAKE_CXX_STANDARD 11)
   3 set(CMAKE_CXX_STANDARD_REQUIRED ON)
   4
   5 # Project name
   6 project (SOLVERLAB C CXX)
   7 set (SOLVERLAB_VERSION_MAJOR 0)
   8 set (SOLVERLAB_VERSION_MINOR 1)
   9
  10 option (SOLVERLAB_WITH_DOCUMENTATION "Generate SOLVERLAB documentation" ON)
  11 option (SOLVERLAB_WITH_PYTHON        "Compile Python interface of SOLVERLAB" ON)
  12 option (SOLVERLAB_WITH_GUI           "Compile a Graphic user Interface for SOLVERLAB" OFF)
  13 option (SOLVERLAB_WITH_PACKAGE       "Generate RPM, Debian and tarball packages" OFF)
  14 option (SOLVERLAB_WITH_COREFLOWS     "Generate COREFLOWS module" ON)
  15 option (SOLVERLAB_WITH_TESTS         "Generate SOLVERLAB example tests" ON)
  16
  17 #Path to installed libraries
  18 set (PETSC_DIR            OFF CACHE STRING "PETSc library path" )
  19 set (SLEPC_DIR            OFF CACHE STRING "SLEPc library path" )
  20 set (HDF5_ROOT            OFF CACHE STRING "HDF5 library path" )#For the compilation of MED with a specific version of HDF5
  21 set (MEDFILE_ROOT_DIR     OFF CACHE STRING "MED library path" )
  22 set (MEDCOUPLING_ROOT_DIR OFF CACHE STRING "MEDCoupling library path" )
  23 set (PYTHON_ROOT_DIR      OFF CACHE STRING "Python library path" )
  24
  25 #url of tarball librairies
  26 set (DOWNLOAD_PETSC         http://ftp.mcs.anl.gov/pub/petsc/release-snapshots/petsc-lite-3.14.0.tar.gz
  27      CACHE STRING           "PETSc tarball path/url" )
  28 set (DOWNLOAD_SLEPC         https://slepc.upv.es/download/distrib/slepc-3.14.0.tar.gz
  29      CACHE STRING           "SLEPC tarball path/url" )
  30 set (DOWNLOAD_F2CBLASLAPACK https://www.mcs.anl.gov/petsc/mirror/externalpackages/f2cblaslapack-3.4.2.q4.tar.gz
  31      CACHE STRING           "F2CBLASLAPACK tarball path/url" )
  32 set (DOWNLOAD_HDF5          https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.10/hdf5-1.10.3/src/hdf5-1.10.3.tar.gz
  33      CACHE STRING           "HDF5 tarball path/url" )
  34 set (DOWNLOAD_MED           http://files.salome-platform.org/Salome/other/med-4.1.0.tar.gz
  35      CACHE STRING           "MED tarball path/url")
  36 set (DOWNLOAD_MEDCOUPLING   http://files.salome-platform.org/Salome/other/medCoupling-9.4.0.tar.gz
  37      CACHE STRING           "MEDCoupling tarball path/url" )
  38
  39 set (CMAKE_BUILD_TYPE Release CACHE STRING "Installation mode")
  40
  41 list (APPEND CMAKE_MODULE_PATH "${SOLVERLAB_SOURCE_DIR}/cmake_files")
  42
  43 include(ExternalProject)#For PETSc, MED and MEDCoupling
  44
  45 set(Python_ROOT_DIR $ENV{PYTHON_ROOT_DIR} )
  46 set(PYQT5_ROOT_DIR $ENV{PYQT5_ROOT_DIR} )
  47 set(PARAVIEW_ROOT_DIR $ENV{PARAVIEW_ROOT_DIR} )
  48 set(MATPLOTLIB_ROOT_DIR $ENV{MATPLOTLIB_ROOT_DIR} )
  49 set(HDF5_ROOT_DIR $ENV{HDF5_ROOT_DIR} )
  50
  51 ######################################################
  52 # Detection or compilation of PETSc+SLEPc+HDF5       #
  53 ######################################################
  54   if ( DEFINED ENV{PETSC_DIR} OR PETSC_DIR)
  55     if   (NOT PETSC_DIR)
  56       set(PETSC_DIR $ENV{PETSC_DIR})
  57       message ( STATUS "Checking variable PETSC_DIR : " $ENV{PETSC_DIR} )
  58     else (NOT PETSC_DIR)
  59       message ( STATUS "Checking variable PETSC_DIR : " ${PETSC_DIR} )
  60     endif(NOT PETSC_DIR)
  61
  62     find_package (PETSc 3.4 REQUIRED)
  63     petsc_get_version ()
  64
  65     message ( STATUS "PETSc found. Version is ${PETSC_VERSION_MAJOR}.${PETSC_VERSION_MINOR}.${PETSC_VERSION_SUBMINOR}" )
  66     set(PETSC_INSTALL ${PETSC_DIR})
  67
  68     #Define and search slepc variables
  69     if   ( NOT SLEPC_DIR )
  70       if   ( DEFINED ENV{SLEPC_DIR} )
  71         set(SLEPC_DIR $ENV{SLEPC_DIR})
  72       else ( DEFINED ENV{SLEPC_DIR} )
  73         set(SLEPC_DIR ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH})
  74       endif( DEFINED ENV{SLEPC_DIR} )
  75     endif( NOT SLEPC_DIR)
  76
  77     message ( STATUS "Checking variable SLEPC_DIR" )
  78     if ( IS_DIRECTORY ${SLEPC_DIR}/include AND EXISTS ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc.so)
  79       set(SLEPC_INCLUDES  ${SLEPC_DIR}/include)
  80       set(SLEPC_LIBRARIES ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc.so)
  81       message( STATUS "SLEPc found at ${SLEPC_DIR}" )
  82     else()
  83       message( FATAL_ERROR "SLEPc not found at ${SLEPC_DIR}" )
  84     endif()
  85
  86     #define hdf5 variables
  87     if   ( NOT HDF5_ROOT )#hdf5 is not defined in cmake arguments
  88       if  ( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is defined in the environment
  89         set(HDF5_ROOT $ENV{HDF5_ROOT})
  90       else( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is not defined in the environment
  91         #HDF5 to be found in petsc external packages
  92         set(HDF5_ROOT ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH})# define hint for hdf5/med installation in petsc external packages
  93       endif( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )
  94     endif( NOT HDF5_ROOT )
  95     set(HDF5_LIBRARY_DIR  ${HDF5_ROOT}/lib)
  96     set(HDF5_INCLUDE_DIRS ${HDF5_ROOT}/include)
  97   else ( DEFINED ENV{PETSC_DIR} OR PETSC_DIR )
  98     message ( STATUS "PETSC_DIR not set, searching PETSc and SLEPc in the system" )
  99
 100     if ( IS_DIRECTORY "/usr/include/petsc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libpetsc.so" )  #Case fedora/redhat system install
 101       message ( STATUS "PETSC includes found in /usr/include/petsc/" )
 102       message ( STATUS "PETSC library  found in /usr/lib64" )
 103       set(PETSC_DIR /usr/)
 104       set(PETSC_INCLUDES  /usr/include/petsc /usr/include/petsc/petsc/mpiuni)
 105       set(PETSC_LIBRARIES /usr/lib64/libpetsc.so)
 106
 107       set(PETSC_VERSION "3.8") #3.8 for fedora 26 , 3.9 for fedora 29 , 3.10 for fedora 30, , 3.12 for fedora 32
 108
 109       set(CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES   "${CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES}, petsc-devel (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 110       set(PETSC_INSTALL ${PETSC_DIR})
 111
 112       #Define and search slepc variables
 113       if   ( IS_DIRECTORY "/usr/include/slepc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libslepc.so" )
 114         message( STATUS "SLEPc includes found in /usr/include/slepc/" )
 115         message( STATUS "SLEPc library  found in /usr/lib64/slepc/" )
 116         set(SLEPC_DIR /usr/)
 117         set(SLEPC_INCLUDES  ${SLEPC_DIR}/include)
 118         set(SLEPC_LIBRARIES ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc.so)
 119         set (CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES   "${CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES}, slepc-devel (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 120       else ( IS_DIRECTORY "/usr/include/slepc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libslepc.so" )
 121         message( FATAL_ERROR "SLEPc not found in the system" )
 122       endif( IS_DIRECTORY "/usr/include/slepc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libslepc.so" )
 123
 124       #HDF5 to be found in the system
 125       if   ( NOT HDF5_ROOT AND NOT DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is not defined in the environment
 126         find_package(HDF5 REQUIRED)
 127         set(CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS "libhdf5-dev")
 128         set(CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES   "hdf5-devel")
 129       endif( NOT HDF5_ROOT AND NOT DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )
 130
 131     #elseif ( IS_DIRECTORY "/usr/lib/petsc/include" AND EXISTS "/usr/lib/petsc/lib/libpetsc_real.so" ) #Case ubuntu/debian system install
 132     #  message ( STATUS "PETSc includes found in /usr/lib/petsc/include")
 133     #  message ( STATUS "PETSc library  found in /usr/lib/petsc/lib/libpetsc_real.so")
 134     #  set(PETSC_DIR /usr/lib/petsc/)
 135     #  set(PETSC_INCLUDES  ${PETSC_DIR}/include ${PETSC_DIR}/include/petsc/mpiuni)
 136     #  set(PETSC_LIBRARIES ${PETSC_DIR}/lib/libpetsc_real.so)
 137
 138     #  find_package (PETSc 3.4 REQUIRED)
 139     #  petsc_get_version ()
 140     #  set (CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS "${CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS}, petsc-dev   (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 141
 142     #  Define and search slepc variables
 143     #  if   ( IS_DIRECTORY "/usr/lib/slepc/include" AND EXISTS "/usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 144     #    message( STATUS "SLEPc includes found in /usr/lib/slepc/include" )
 145     #    message( STATUS "SLEPc library  found in /usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 146     #    set(SLEPC_DIR /usr/lib/slepc/)
 147     #    set(SLEPC_INCLUDES ${SLEPC_DIR}/include)
 148     #    set(SLEPC_LIBRARIES ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc_real.so)
 149     #    set (CPACK_DEBIAN_PACKAGE_REQUIRES   "${CPACK_DEBIAN_PACKAGE_REQUIRES}, slepc-devel (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 150     #  else ( IS_DIRECTORY "/usr/lib/slepc/include" AND EXISTS "/usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 151     #    message( FATAL_ERROR "SLEPc not found in the system" )
 152     #  endif( IS_DIRECTORY "/usr/lib/slepc/include" AND EXISTS "/usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 153
 154     #elseif ( IS_DIRECTORY "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/petsc") #Case ubuntu/debian system pip install
 155
 156     else ( IS_DIRECTORY "/usr/include/petsc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libpetsc.so" )  # No petsc in system, do compile petsc along with slepc as an external package
 157       message (STATUS "PETSC not found in the system")
 158       message (STATUS "PETSC will be downloaded and compiled from ${DOWNLOAD_PETSC}" )
 159       message (STATUS "SLEPC will be downloaded and compiled from ${DOWNLOAD_SLEPC}" )
 160       message (STATUS "HDF5  will be downloaded and compiled from ${DOWNLOAD_HDF5}" )
 161
 162       #extract tarball name
 163       string(LENGTH "${DOWNLOAD_PETSC}" tarball_url_length)#length of the tarball
 164       string(FIND   "${DOWNLOAD_PETSC}" "/" start_tarball_name REVERSE )# last occurence of "/"
 165       MATH(EXPR start_tarball_name  "${start_tarball_name}+1")#start after the occurence of "/"
 166       MATH(EXPR tarball_name_length "${tarball_url_length}-${start_tarball_name}-7")#name ends before .tar.gz that counts for 7 characters
 167       string(SUBSTRING ${DOWNLOAD_PETSC} ${start_tarball_name} ${tarball_name_length} PETSC_TARBALL_NAME)
 168
 169       set(PETSC_DIR ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis/${PETSC_TARBALL_NAME}) # Location of the final install
 170       set(PETSC_ARCH arch-linux-c-opt)
 171       set(PETSC_INSTALL ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/petsc)#folder to copy petsc libraries and include files
 172
 173       ExternalProject_Add (PETSc
 174       URL               ${DOWNLOAD_PETSC}
 175       SOURCE_DIR        ${PETSC_DIR}
 176       BUILD_IN_SOURCE   TRUE
 177       CONFIGURE_COMMAND <SOURCE_DIR>/configure --prefix=${PETSC_INSTALL} --with-debugging=0 --with-mpi=0 --download-f2cblaslapack=${DOWNLOAD_F2CBLASLAPACK} --with-fc=0 --download-slepc=${DOWNLOAD_SLEPC} --download-hdf5=${DOWNLOAD_HDF5}
 178       BUILD_COMMAND     make all
 179       TEST_COMMAND      make check
 180       INSTALL_COMMAND   make install
 181       INSTALL_DIR       ${PETSC_DIR}
 182       STAMP_DIR         ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis
 183       LOG_DOWNLOAD      TRUE           # Wrap download in script to log output
 184       LOG_UPDATE        TRUE           # Wrap update in script to log output
 185       LOG_CONFIGURE     TRUE           # Wrap configure in script to log output
 186       LOG_BUILD         TRUE           # Wrap build in script to log output
 187       LOG_TEST          TRUE           # Wrap test in script to log output
 188       LOG_INSTALL       TRUE           # Wrap install in script to log output
 189        )
 190
 191       message( STATUS "PETSc, SLEPc and HDF5 will be installed at ${PETSC_INSTALL}")
 192
 193       string(LENGTH "${PETSC_TARBALL_NAME}" tarball_name_length)#length of the tarball
 194       string(FIND   "${PETSC_TARBALL_NAME}" "-" start_version_name REVERSE )# last occurence of "-"
 195       MATH(EXPR start_version_name  "${start_version_name}+1")#start after the occurence of "/"
 196       string(SUBSTRING ${PETSC_TARBALL_NAME} ${start_version_name} ${tarball_name_length} PETSC_VERSION)
 197       message( STATUS "PETSc version ${PETSC_VERSION}  will be installed" )
 198
 199       set(PETSC_INCLUDES  ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/include ${PETSC_DIR}/include)
 200       set(PETSC_LIBRARIES ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/lib/libpetsc.so)
 201
 202       #define slepc variables
 203       set(SLEPC_DIR ${PETSC_INSTALL})
 204       set(SLEPC_INCLUDES ${SLEPC_DIR}/include  ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/externalpackages/slepc-3.13.4/include ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/externalpackages/slepc-3.13.4/installed-arch-linux2-c-opt/include)
 205       set(SLEPC_LIBRARIES ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/externalpackages/slepc-3.13.4/installed-arch-linux2-c-opt/lib/libslepc.so)
 206       message( STATUS "SLEPc includes ${SLEPC_INCLUDES}")
 207
 208       #define hdf5 variables
 209       if   ( NOT HDF5_ROOT )#hdf5 is not defined in cmake arguments
 210         if  ( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is defined in the environment
 211           set(HDF5_ROOT $ENV{HDF5_ROOT})
 212         else( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is not defined in the environment
 213           set(HDF5_ROOT ${PETSC_INSTALL})#HDF5 to be found in petsc installation
 214         endif( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )
 215       endif( NOT HDF5_ROOT )
 216       set(HDF5_LIBRARY_DIR ${HDF5_ROOT}/lib)
 217       set(HDF5_INCLUDE_DIRS ${HDF5_ROOT}/include)
 218
 219     endif ( IS_DIRECTORY "/usr/include/petsc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libpetsc.so" )
 220   endif ( DEFINED ENV{PETSC_DIR} OR PETSC_DIR )
 221
 222   if   ( ${PETSC_VERSION} VERSION_GREATER 3.5 )
 223     add_definitions(-DPETSC_VERSION_GREATER_3_5)
 224   endif( ${PETSC_VERSION} VERSION_GREATER 3.5 )
 225
 226 string(REPLACE ";" ":"  PETSC_INCLUDES_INSTALL "${PETSC_INCLUDES}")# use colon instead of semicolon in environment file env_SOLVERLAB.sh
 227
 228 add_library(petsc   SHARED IMPORTED)
 229 set_property(TARGET petsc  PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${PETSC_LIBRARIES})
 230 add_library(slepc   SHARED IMPORTED)
 231 set_property(TARGET slepc  PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${SLEPC_LIBRARIES})
 232
 233 ######################################################
 234 # Detection or compilation of MEDFile                #
 235 ######################################################
 236 if( MEDFILE_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDFILE_ROOT_DIR})
 237
 238   if   ( NOT MEDFILE_ROOT_DIR )
 239     set(MEDFILE_ROOT_DIR $ENV{MEDFILE_ROOT_DIR} )
 240   endif( NOT MEDFILE_ROOT_DIR )
 241
 242   find_package (MEDFile REQUIRED)
 243   message (STATUS "MEDFile found in ${MEDFILE_ROOT_DIR}")
 244
 245 else( MEDFILE_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDFILE_ROOT_DIR})
 246
 247   message(STATUS "MED will be downloaded and installed from ${DOWNLOAD_MED}")
 248   set(MACHINE PCLINUX)
 249   set(MEDFILE_DEFINITIONS "-D${MACHINE} -DMEDFILE_INSTALL_DOC=OFF")#Comment ne pas compiler la doc ?
 250   set(MEDFILE_ROOT_DIR ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/med) # Location of the final install
 251
 252   #extraction of the tarball archive name
 253   string(LENGTH "${DOWNLOAD_MED}" tarball_url_length)#length of the name of the tarball
 254   string(FIND "${DOWNLOAD_MED}" "/" start_tarball_name REVERSE )# last occurence of "/"
 255   MATH(EXPR start_tarball_name "${start_tarball_name}+1")#start after the occurence of "/"
 256   MATH(EXPR tarball_name_length "${tarball_url_length}-${start_tarball_name}-7")#name ends before .tar.gz that counts for 7 characters
 257   string(SUBSTRING ${DOWNLOAD_MED} ${start_tarball_name} ${tarball_name_length} MED_TARBALL_NAME)
 258
 259   ExternalProject_Add (MED
 260         URL               ${DOWNLOAD_MED}  #location of med tarball
 261         SOURCE_DIR        ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis/${MED_TARBALL_NAME}
 262         BUILD_IN_SOURCE   TRUE
 263         CONFIGURE_COMMAND <SOURCE_DIR>/configure --prefix=${MEDFILE_ROOT_DIR}  --with-hdf5=${HDF5_ROOT} --with-hdf5-include=${HDF5_ROOT}/include --with-hdf5-lib=${HDF5_LIBRARY_DIR} --with-hdf5-bin=${HDF5_ROOT}/bin  --with-swig=yes
 264         BUILD_COMMAND     make
 265         INSTALL_COMMAND   make install
 266         INSTALL_DIR       ${MEDFILE_ROOT_DIR}
 267         STAMP_DIR         ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis
 268         LOG_DOWNLOAD      TRUE           # Wrap download in script to log output
 269         LOG_UPDATE        TRUE           # Wrap update in script to log output
 270         LOG_CONFIGURE     TRUE           # Wrap configure in script to log output
 271         LOG_BUILD         TRUE           # Wrap build in script to log output
 272         LOG_TEST          TRUE           # Wrap test in script to log output
 273         LOG_INSTALL       TRUE           # Wrap install in script to log output
 274   )
 275
 276   set(MEDFILE_INCLUDE_DIRS ${MEDFILE_ROOT_DIR}/include)# Nécessaire pour le medloader et les sous-dossiers mesh, et IJKMesh
 277   set(MEDFILE_LIBRARIES    ${MEDFILE_ROOT_DIR}/lib)# Nécessaire pour le env_SOLVERLAB.sh
 278   set(MEDFILE_C_LIBRARIES med medC)# Nécessaire pour le medloader
 279
 280 endif( MEDFILE_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDFILE_ROOT_DIR})
 281
 282 add_library(med   SHARED IMPORTED)
 283 set_property(TARGET med  PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDFILE_ROOT_DIR}/lib/libmed.so)
 284 add_library(medC   SHARED IMPORTED)
 285 set_property(TARGET medC PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDFILE_ROOT_DIR}/lib/libmedC.so)
 286
 287 string(REPLACE ";" ":"  MEDFILE_LIBRARIES_INSTALL "${MEDFILE_LIBRARIES}")# use colon instead of semicolon in environment file env_SOLVERLAB.sh
 288
 289 ######################################################
 290 # Detection or compilation of MEDCoupling            #
 291 ######################################################
 292 if( MEDCOUPLING_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR})
 293
 294   if( NOT MEDCOUPLING_ROOT_DIR )
 295     set(MEDCOUPLING_ROOT_DIR $ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR} )
 296   endif( NOT MEDCOUPLING_ROOT_DIR )
 297
 298   message (STATUS "Seeking MEDCoupling library in ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}")
 299
 300   if( NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include/MEDCoupling.hxx)
 301     message (FATAL_ERROR "MEDCoupling library not found in ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}")
 302   else( NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include/MEDCoupling.hxx)
 303     message (STATUS "MEDCoupling library found in ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}")
 304   endif( NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include/MEDCoupling.hxx)
 305
 306 else( MEDCOUPLING_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR})
 307   message(STATUS "MEDCoupling will be downloaded and installed from ${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}")
 308   set(MEDCOUPLING_ROOT_DIR ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/medcoupling) # Location of the final install
 309   SET(ENV{HDF5_ROOT} ${HDF5_ROOT})#MEDCoupling install process seems to require an environment variable
 310
 311   #extraction of the tarball archive name
 312   string(LENGTH "${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}" tarball_url_length)#length of the tarball
 313   string(FIND   "${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}" "/" start_tarball_name REVERSE )# last occurence of "/"
 314   MATH(EXPR start_tarball_name "${start_tarball_name}+1")#start after the occurence of "/"
 315   MATH(EXPR tarball_name_length "${tarball_url_length}-${start_tarball_name}-7")#name ends before .tar.gz that counts for 7 characters
 316   string(SUBSTRING ${DOWNLOAD_MEDCOUPLING} ${start_tarball_name} ${tarball_name_length} MEDCOUPLING_TARBALL_NAME)
 317   string(SUBSTRING ${MEDCOUPLING_TARBALL_NAME} 12 ${tarball_name_length} MEDCOUPLING_VERSION_NAME)
 318
 319   message(STATUS "MEDCoupling version is ${MEDCOUPLING_VERSION_NAME}")
 320
 321   ExternalProject_Add (MEDCoupling
 322         URL               ${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}  #location of medcoupling tarball
 323         SOURCE_DIR        ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis/${MEDCOUPLING_TARBALL_NAME}
 324 #        BUILD_IN_SOURCE   FALSE
 325         CONFIGURE_COMMAND cmake <SOURCE_DIR>/${MEDCOUPLING_TARBALL_NAME} -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=${MEDCOUPLING_ROOT_DIR} -DCONFIGURATION_ROOT_DIR=<SOURCE_DIR>/configuration-${MEDCOUPLING_VERSION_NAME} -DMEDFILE_ROOT_DIR=${MEDFILE_ROOT_DIR} -DMEDCOUPLING_ENABLE_PARTITIONER=OFF -DMEDCOUPLING_PARTITIONER_METIS=OFF -DMEDCOUPLING_PARTITIONER_SCOTCH=OFF -DMEDCOUPLING_ENABLE_RENUMBER=OFF -DMEDCOUPLING_BUILD_DOC=OFF -DHDF5_ROOT_DIR=${HDF5_ROOT}
 326         BUILD_COMMAND     make
 327         INSTALL_COMMAND   make install
 328         INSTALL_DIR       ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}
 329         STAMP_DIR         ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis
 330         LOG_DOWNLOAD      TRUE           # Wrap download in script to log output
 331         LOG_UPDATE        TRUE           # Wrap update in script to log output
 332         LOG_CONFIGURE     TRUE           # Wrap configure in script to log output
 333         LOG_BUILD         TRUE           # Wrap build in script to log output
 334         LOG_TEST          TRUE           # Wrap test in script to log output
 335         LOG_INSTALL       TRUE           # Wrap install in script to log output
 336   )
 337
 338 endif( MEDCOUPLING_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR} )
 339
 340 set(MEDCOUPLING_INCLUDE_DIR ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include)
 341 set(MEDCOUPLING_LIBRARIES   ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib    )#for environment file env_SOLVERLAB.sh
 342
 343 add_library(medloader   SHARED IMPORTED )
 344 set_property(TARGET medloader   PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so)
 345 add_library(medcoupling SHARED IMPORTED )
 346 set_property(TARGET medcoupling PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so)
 347
 348 if   (TARGET MED AND TARGET PETSc)
 349   ExternalProject_Add_StepDependencies( MED build PETSc )#PETSc doit être compilé avant MED car c'est PETSc qui compile HDF5
 350 endif(TARGET MED AND TARGET PETSc)
 351
 352 if   (TARGET MED AND TARGET MEDCoupling)
 353   ExternalProject_Add_StepDependencies( MEDCoupling build MED )#MED doit être compilé avant MEDCoupling
 354 endif(TARGET MED AND TARGET MEDCoupling)
 355
 356 if   (TARGET PETSc AND TARGET MEDCoupling)
 357   ExternalProject_Add_StepDependencies( MEDCoupling build PETSc )#PETSc doit être compilé avant MEDCoupling (car il contient hdf5)
 358 endif(TARGET PETSc AND TARGET MEDCoupling)
 359
 360 ####################
 361 # Final operations #
 362 ####################
 363
 364 # Paraview variables to choose python version and for env_SOLVERLAB.sh
 365 if  ( DEFINED PARAVIEW_VERSION OR DEFINED ENV{PARAVIEW_VERSION} )
 366   if   ( NOT DEFINED PARAVIEW_VERSION )
 367     set( PARAVIEW_VERSION  $ENV{PARAVIEW_VERSION})
 368   endif( NOT DEFINED PARAVIEW_VERSION )
 369   message(STATUS "ParaView version is ${PARAVIEW_VERSION}" )
 370 else( DEFINED PARAVIEW_VERSION OR DEFINED ENV{PARAVIEW_VERSION} )
 371   if  ( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{PARAVIEW_ROOT_DIR})
 372     if  ( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR )
 373       set( PARAVIEW_INCLUDE_DIR   ${PARAVIEW_ROOT_DIR}/include)
 374       set( PARAVIEW_LIBRARIES_DIR ${PARAVIEW_ROOT_DIR}/lib)
 375     else( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR )
 376       set( PARAVIEW_INCLUDE_DIR   $ENV{PARAVIEW_ROOT_DIR}/include)
 377       set( PARAVIEW_LIBRARIES_DIR $ENV{PARAVIEW_ROOT_DIR}/lib)
 378     endif( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR )
 379   else( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{PARAVIEW_ROOT_DIR})
 380     message(STATUS "PARAVIEW_VERSION and PARAVIEW_ROOT_DIR not set. Trying to detect paraview.")
 381     set( PARAVIEW_INCLUDE_DIR /usr/include/paraview/)
 382     set( PARAVIEW_LIBRARIES_DIR /usr/lib/paraview/:/usr/lib64/paraview/:/usr/lib64/vtk/:/usr/lib/vtk/)
 383   endif( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{PARAVIEW_ROOT_DIR})
 384
 385   set( PARAVIEW_SUFFIXES paraview-5.0 paraview-5.1 paraview-5.2 paraview-5.3 paraview-5.4 paraview-5.5 paraview-5.6 paraview-5.7 paraview-5.8 paraview-5.9 )
 386   find_file( vtkConfig_file vtkPVConfig.h HINTS ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR} PATH_SUFFIXES ${PARAVIEW_SUFFIXES})
 387
 388   #extraction of the paraview version"
 389   IF   ( ${vtkConfig_file} STREQUAL "vtkConfig_file-NOTFOUND" )
 390     message(WARNING "Could not find ParaView configuration file vtkPVConfig.h in folder ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR} and subdirectories  ${PARAVIEW_SUFFIXES}. Postprocessing may not work")
 391     set( PARAVIEW_VERSION  "5.0")
 392   ELSE ( ${vtkConfig_file} STREQUAL "vtkConfig_file-NOTFOUND" )
 393     message( STATUS "Found vtkPVConfig.h in ${vtkConfig_file}")
 394     file(STRINGS ${vtkConfig_file} vtkConfig)
 395     FOREACH(line ${vtkConfig})
 396       string(FIND "${line}" "#define PARAVIEW_VERSION_FULL " pos)
 397       IF(NOT ${pos} EQUAL -1)
 398         string(LENGTH ${line} line_length)#length of the tarball
 399         MATH(EXPR start_pv_version "${line_length}-6")#line ends with "x.y.z", that counts for 7 characters
 400         string(SUBSTRING ${line} ${start_pv_version} 5 PARAVIEW_VERSION)
 401         break()
 402       ENDIF(NOT ${pos} EQUAL -1)
 403     ENDFOREACH(line ${vtkConfig})
 404     message(STATUS "ParaView detected, version is ${PARAVIEW_VERSION}" )
 405   ENDIF( ${vtkConfig_file} STREQUAL "vtkConfig_file-NOTFOUND" )
 406 endif( DEFINED PARAVIEW_VERSION OR DEFINED ENV{PARAVIEW_VERSION} )
 407
 408
 409 IF   ( ${PARAVIEW_VERSION} STRGREATER "5.6" OR ${PARAVIEW_VERSION} STREQUAL "5.6" )#Use python 3, use VERSION_GREATER_EQUAL if cmake >=3.7
 410   SET(PYTHON2OR3 "3")
 411   message(STATUS "PARAVIEW_VERSION greater than 5.6. We need python3 for postprocessing scripts.")
 412 ELSE ( ${PARAVIEW_VERSION} STRGREATER "5.6" OR ${PARAVIEW_VERSION} STREQUAL "5.6" )#Use python 2
 413   SET(PYTHON2OR3 "2")
 414   message(STATUS "PARAVIEW_VERSION smaller than 5.6. We need python2 for postprocessing scripts.")
 415 ENDIF( ${PARAVIEW_VERSION} STRGREATER "5.6" OR ${PARAVIEW_VERSION} STREQUAL "5.6" )
 416
 417 # Find python
 418 IF  ( PYTHON_ROOT_DIR OR ENV{PYTHON_ROOT_DIR})
 419   IF  ( PYTHON_ROOT_DIR )
 420     set(Python_ROOT_DIR ${PYTHON_ROOT_DIR} )
 421   ELSE( PYTHON_ROOT_DIR })
 422     set(Python_ROOT_DIR $ENV{PYTHON_ROOT_DIR} )
 423   ENDIF( PYTHON_ROOT_DIR })
 424 ENDIF(PYTHON_ROOT_DIR OR ENV{PYTHON_ROOT_DIR})
 425
 426 IF   (${CMAKE_VERSION} VERSION_GREATER "3.12.0")
 427   find_package(Python ${PYTHON2OR3} REQUIRED COMPONENTS Interpreter Development )
 428   SET(PYTHON_EXECUTABLE ${Python_EXECUTABLE})
 429 ELSE (${CMAKE_VERSION} VERSION_GREATER "3.12.0")
 430   find_package(PythonInterp ${PYTHON2OR3} REQUIRED )
 431   find_package(PythonLibs   ${PYTHON2OR3} REQUIRED )
 432   set(Python_LIBRARIES     ${PYTHON_LIBRARIES})
 433   set(Python_INCLUDE_DIRS  ${PYTHON_INCLUDE_DIRS})
 434   set(Python_VERSION       ${PYTHON_VERSION_STRING})
 435   set(Python_VERSION_MAJOR ${PYTHON_VERSION_MAJOR})
 436   set(Python_VERSION_MINOR ${PYTHON_VERSION_MINOR})
 437 ENDIF(${CMAKE_VERSION} VERSION_GREATER "3.12.0")
 438
 439 #Paraview library paths
 440 set (PV_LIB_DIR    /usr/lib/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/dist-packages/paraview/:/usr/lib64/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/site-packages/vtk/:${PARAVIEW_LIBRARIES_DIR})
 441 set (PV_PYTHON_DIR /usr/lib/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/dist-packages/paraview/:/usr/lib64/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/site-packages/vtk/:/usr/lib64/paraview/site-packages/:/usr/lib64/paraview/site-packages/paraview/:/usr/lib64/paraview/site-packages/vtk/:/usr/lib64/paraview/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/site-packages/:/usr/lib64/paraview/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/site-packages/paraview/:/usr/lib64/paraview/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/site-packages/vtkmodules:/usr/lib/paraview/site-packages/paraview:/usr/lib/paraview/site-packages/paraview/vtk:${PARAVIEW_LIBRARIES_DIR}/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/site-packages/vtkmodules/)
 442
 443 message(STATUS "Python version found is ${Python_VERSION}")
 444 find_package (SWIG 3.0 REQUIRED)
 445
 446 if (SOLVERLAB_WITH_DOCUMENTATION)                                                                           #
 447   find_package (Doxygen)                                                                                    #
 448   set (CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS "${CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS}, doxygen, graphviz, mscgen")
 449   set (CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES "${CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES}, doxygen, graphviz, mscgen")
 450   if   (NOT DOXYGEN_FOUND)
 451     message (FATAL_ERROR "Doxygen is needed to build the documentation. Please install it correctly.")
 452   endif(NOT DOXYGEN_FOUND)
 453 endif()
 454 if (SOLVERLAB_WITH_TESTS)                                                                                  #
 455   enable_testing ()
 456   find_package (CPPUNIT REQUIRED)
 457 endif()
 458 find_package (XDR REQUIRED)
 459
 460 # Enter subdirectories
 461 add_subdirectory (CDMATH)
 462 if(SOLVERLAB_WITH_COREFLOWS)
 463   add_subdirectory (CoreFlows)
 464 endif(SOLVERLAB_WITH_COREFLOWS)
 465
 466 # Configuration file
 467 configure_file(
 468     ${PROJECT_SOURCE_DIR}/env_SOLVERLAB.sh
 469     ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/env_SOLVERLAB.sh
 470     @ONLY
 471 )
 472
 473