CMakeLists.txt

   1 cmake_minimum_required (VERSION 3.1)
   2 set(CMAKE_CXX_STANDARD 11)
   3 set(CMAKE_CXX_STANDARD_REQUIRED ON)
   4
   5 # Project name
   6 project (SOLVERLAB C CXX)
   7 set (SOLVERLAB_VERSION_MAJOR 0)
   8 set (SOLVERLAB_VERSION_MINOR 1)
   9
  10 option (SOLVERLAB_WITH_DOCUMENTATION "Generate SOLVERLAB documentation" ON)
  11 option (SOLVERLAB_WITH_PYTHON        "Compile Python interface of SOLVERLAB" ON)
  12 option (SOLVERLAB_WITH_GUI           "Compile a Graphic user Interface for SOLVERLAB" OFF)
  13 option (SOLVERLAB_WITH_PACKAGE       "Generate RPM, Debian and tarball packages" OFF)
  14 option (SOLVERLAB_WITH_COREFLOWS     "Generate COREFLOWS module" ON)
  15 option (SOLVERLAB_WITH_TESTS         "Generate SOLVERLAB example tests" ON)
  16
  17 #Path to installed libraries
  18 set (PETSC_DIR            OFF CACHE STRING "PETSc library path" )
  19 set (SLEPC_DIR            OFF CACHE STRING "SLEPc library path" )
  20 set (HDF5_ROOT            OFF CACHE STRING "HDF5 library path" )#For the compilation of MED with a specific version of HDF5
  21 set (MEDFILE_ROOT_DIR     OFF CACHE STRING "MED library path" )
  22 set (MEDCOUPLING_ROOT_DIR OFF CACHE STRING "MEDCoupling library path" )
  23
  24 #url of tarball librairies
  25 set (DOWNLOAD_PETSC         http://ftp.mcs.anl.gov/pub/petsc/release-snapshots/petsc-lite-3.13.tar.gz
  26      CACHE STRING           "PETSc tarball path/url" )
  27 set (DOWNLOAD_SLEPC         https://slepc.upv.es/download/distrib/slepc-3.13.4.tar.gz
  28      CACHE STRING           "SLEPC tarball path/url" )
  29 set (DOWNLOAD_F2CBLASLAPACK ${CDMATH_SOURCE_DIR}/pre_requis/PETSc/f2cblaslapack-3.4.2.q4.tar.gz
  30      CACHE STRING           "F2CBLASLAPACK tarball path/url" )
  31 set (DOWNLOAD_HDF5          ${CDMATH_SOURCE_DIR}/pre_requis/PETSc/hdf5-1.10.3.tar.gz
  32      CACHE STRING           "HDF5 tarball path/url" )
  33 set (DOWNLOAD_MED           http://files.salome-platform.org/Salome/other/med-4.1.0.tar.gz
  34      CACHE STRING           "MED tarball path/url")
  35 set (DOWNLOAD_MEDCOUPLING   http://files.salome-platform.org/Salome/other/medCoupling-9.4.0.tar.gz
  36      CACHE STRING           "MEDCoupling tarball path/url" )
  37
  38 list (APPEND CMAKE_MODULE_PATH "${SOLVERLAB_SOURCE_DIR}/cmake_files")
  39
  40 ######################################################
  41 # Detection or compilation of PETSc+SLEPc+HDF5       #
  42 ######################################################
  43   if ( DEFINED ENV{PETSC_DIR} OR PETSC_DIR)
  44     if   (NOT PETSC_DIR)
  45       set(PETSC_DIR $ENV{PETSC_DIR})
  46       message ( STATUS "Checking variable PETSC_DIR : " $ENV{PETSC_DIR} )
  47     else (NOT PETSC_DIR)
  48       message ( STATUS "Checking variable PETSC_DIR : " ${PETSC_DIR} )
  49     endif(NOT PETSC_DIR)
  50
  51     find_package (PETSc 3.4 REQUIRED)
  52     petsc_get_version ()
  53
  54     message ( STATUS "PETSc found. Version is ${PETSC_VERSION_MAJOR}.${PETSC_VERSION_MINOR}.${PETSC_VERSION_SUBMINOR}" )
  55     set(PETSC_INSTALL ${PETSC_DIR})
  56
  57     #Define and search slepc variables
  58     if   ( NOT SLEPC_DIR )
  59       if   ( DEFINED ENV{SLEPC_DIR} )
  60         set(SLEPC_DIR $ENV{SLEPC_DIR})
  61       else ( DEFINED ENV{SLEPC_DIR} )
  62         set(SLEPC_DIR ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH})
  63       endif( DEFINED ENV{SLEPC_DIR} )
  64     endif( NOT SLEPC_DIR)
  65
  66     message ( STATUS "Checking variable SLEPC_DIR" )
  67     if ( IS_DIRECTORY ${SLEPC_DIR}/include AND EXISTS ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc.so)
  68       set(SLEPC_INCLUDES ${SLEPC_DIR}/include)
  69       set(SLEPC_LIBRARIES ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc.so)
  70       message( STATUS "SLEPc found at ${SLEPC_DIR}" )
  71     else()
  72       message( FATAL_ERROR "SLEPc not found at ${SLEPC_DIR}" )
  73     endif()
  74
  75     #define hdf5 variables
  76     if   ( NOT HDF5_ROOT )#hdf5 is not defined in cmake arguments
  77       if  ( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is defined in the environment
  78         set(HDF5_ROOT $ENV{HDF5_ROOT})
  79       else( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is not defined in the environment
  80         #HDF5 to be found in petsc external packages
  81         set(HDF5_ROOT ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH})# define hint for hdf5/med installation in petsc external packages
  82       endif( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )
  83     endif( NOT HDF5_ROOT )
  84     set(HDF5_LIBRARY_DIR ${HDF5_ROOT}/lib)
  85     set(HDF5_INCLUDE_DIRS ${HDF5_ROOT}/include)
  86   else ( DEFINED ENV{PETSC_DIR} OR PETSC_DIR )
  87     message ( STATUS "PETSC_DIR not set, searching PETSc and SLEPc in the system" )
  88
  89     if ( IS_DIRECTORY "/usr/include/petsc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libpetsc.so" )  #Case fedora/redhat system install
  90       message ( STATUS "PETSC includes found in /usr/include/petsc/" )
  91       message ( STATUS "PETSC library found in /usr/lib64" )
  92       set(PETSC_DIR /usr/)
  93       set(PETSC_INCLUDES  /usr/include/petsc /usr/include/petsc/petsc/mpiuni)
  94       set(PETSC_LIBRARIES /usr/lib64/libpetsc.so)
  95
  96       set(PETSC_VERSION "3.8") #3.8 for fedora 26 , 3.9 for fedora 29 , 3.10 for fedora 30, , 3.12 for fedora 32
  97
  98       set(CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES   "${CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES}, petsc-devel (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
  99       set(PETSC_INSTALL ${PETSC_DIR})
 100
 101       #Define and search slepc variables
 102       if   ( IS_DIRECTORY "/usr/include/slepc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libslepc.so" )
 103         message( STATUS "SLEPc includes found in /usr/include/slepc/" )
 104         message( STATUS "SLEPc library found in /usr/lib64/slepc/" )
 105         set(SLEPC_DIR /usr/)
 106         set(SLEPC_INCLUDES ${SLEPC_DIR}/include)
 107         set(SLEPC_LIBRARIES ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc.so)
 108         set (CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES   "${CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES}, slepc-devel (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 109       else ( IS_DIRECTORY "/usr/include/slepc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libslepc.so" )
 110         message( FATAL_ERROR "SLEPc not found in the system" )
 111       endif( IS_DIRECTORY "/usr/include/slepc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libslepc.so" )
 112
 113       #HDF5 to be found in the system
 114       if   ( NOT HDF5_ROOT AND NOT DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is not defined in the environment
 115         find_package(HDF5 REQUIRED)
 116         set(CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS "libhdf5-dev")
 117         set(CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES "hdf5-devel")
 118       endif( NOT HDF5_ROOT AND NOT DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )
 119
 120
 121     #elseif ( IS_DIRECTORY "/usr/lib/petsc/include" AND EXISTS "/usr/lib/petsc/lib/libpetsc_real.so" ) #Case ubuntu/debian system install
 122     #  message ( STATUS "PETSc includes found in /usr/lib/petsc/include")
 123     #  message ( STATUS "PETSc library  found in /usr/lib/petsc/lib/libpetsc_real.so")
 124     #  set(PETSC_DIR /usr/lib/petsc/)
 125     #  set(PETSC_INCLUDES  ${PETSC_DIR}/include ${PETSC_DIR}/include/petsc/mpiuni)
 126     #  set(PETSC_LIBRARIES ${PETSC_DIR}/lib/libpetsc_real.so)
 127
 128     #  find_package (PETSc 3.4 REQUIRED)
 129     #  petsc_get_version ()
 130     #  set (CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS "${CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS}, petsc-dev   (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 131
 132     #  Define and search slepc variables
 133     #  if   ( IS_DIRECTORY "/usr/lib/slepc/include" AND EXISTS "/usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 134     #    message( STATUS "SLEPc includes found in /usr/lib/slepc/include" )
 135     #    message( STATUS "SLEPc library  found in /usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 136     #    set(SLEPC_DIR /usr/lib/slepc/)
 137     #    set(SLEPC_INCLUDES ${SLEPC_DIR}/include)
 138     #    set(SLEPC_LIBRARIES ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc_real.so)
 139     #    set (CPACK_DEBIAN_PACKAGE_REQUIRES   "${CPACK_DEBIAN_PACKAGE_REQUIRES}, slepc-devel (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 140     #  else ( IS_DIRECTORY "/usr/lib/slepc/include" AND EXISTS "/usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 141     #    message( FATAL_ERROR "SLEPc not found in the system" )
 142     #  endif( IS_DIRECTORY "/usr/lib/slepc/include" AND EXISTS "/usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 143
 144     #elseif ( IS_DIRECTORY "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/petsc") #Case ubuntu/debian system pip install
 145
 146     else ( IS_DIRECTORY "/usr/include/petsc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libpetsc.so" )  # No petsc in system, do compile petsc along with slepc as an external package
 147       message (STATUS "PETSC not found in the system")
 148       message (STATUS "PETSC will be downloaded and compiled from ${DOWNLOAD_PETSC}" )
 149       message (STATUS "SLEPC will be downloaded and compiled from ${DOWNLOAD_SLEPC}" )
 150       message (STATUS "HDF5  will be downloaded and compiled from ${DOWNLOAD_HDF5}" )
 151
 152       #extract tarball name
 153       string(LENGTH "${DOWNLOAD_PETSC}" tarball_url_length)#length of the tarball
 154       string(FIND   "${DOWNLOAD_PETSC}" "/" start_tarball_name REVERSE )# last occurence of "/"
 155       MATH(EXPR start_tarball_name "${start_tarball_name}+1")#start after the occurence of "/"
 156       MATH(EXPR tarball_name_length "${tarball_url_length}-${start_tarball_name}-7")#name ends before .tar.gz that counts for 7 characters
 157       string(SUBSTRING ${DOWNLOAD_PETSC} ${start_tarball_name} ${tarball_name_length} PETSC_TARBALL_NAME)
 158
 159       set(PETSC_DIR ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis/${PETSC_TARBALL_NAME}) # Location of the final install
 160       set(PETSC_INSTALL ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/petsc)#folder to copy petsc libraries and include files
 161
 162       ExternalProject_Add (PETSc
 163       URL               ${DOWNLOAD_PETSC}
 164       SOURCE_DIR        ${PETSC_DIR}
 165       BUILD_IN_SOURCE   TRUE
 166       CONFIGURE_COMMAND <SOURCE_DIR>/configure --prefix=${PETSC_INSTALL} --with-debugging=0 --with-mpi=0 --download-f2cblaslapack=${DOWNLOAD_F2CBLASLAPACK} --with-fc=0 --download-slepc=${DOWNLOAD_SLEPC} --download-hdf5=${DOWNLOAD_HDF5}
 167       BUILD_COMMAND     make
 168       TEST_COMMAND      make check
 169       INSTALL_COMMAND   make all
 170       INSTALL_DIR       ${PETSC_DIR}
 171       STAMP_DIR         ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis
 172       LOG_DOWNLOAD      TRUE           # Wrap download in script to log output
 173       LOG_UPDATE        TRUE           # Wrap update in script to log output
 174       LOG_CONFIGURE     TRUE           # Wrap configure in script to log output
 175       LOG_BUILD         TRUE           # Wrap build in script to log output
 176       LOG_TEST          TRUE           # Wrap test in script to log output
 177       LOG_INSTALL       TRUE           # Wrap install in script to log output
 178        )
 179
 180       #file (STRINGS "${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/include/petscversion.h" vstrings REGEX "#define PETSC_VERSION_(RELEASE|MAJOR|MINOR|SUBMINOR|PATCH) ")
 181       #message( STATUS "PETSc version is ${PETSC_VERSION_MAJOR}.${PETSC_VERSION_MINOR}.${PETSC_VERSION_SUBMINOR}" )
 182       message( STATUS "PETSc, SLEPc and HDF5 will be installed at ${PETSC_INSTALL}")
 183
 184       string(SUBSTRING ${PETSC_TARBALL_NAME} 6 ${tarball_name_length} PETSC_VERSION)
 185       #define slepc variables
 186       set(SLEPC_DIR ${PETSC_INSTALL})
 187       set(SLEPC_INCLUDES ${SLEPC_DIR}/include)
 188       set(SLEPC_LIBRARIES ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc.so)
 189
 190       #define hdf5 variables
 191       if   ( NOT HDF5_ROOT )#hdf5 is not defined in cmake arguments
 192         if  ( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is defined in the environment
 193           set(HDF5_ROOT $ENV{HDF5_ROOT})
 194         else( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is not defined in the environment
 195           set(HDF5_ROOT ${PETSC_INSTALL})#HDF5 to be found in petsc installation
 196         endif( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )
 197       endif( NOT HDF5_ROOT )
 198       set(HDF5_LIBRARY_DIR ${HDF5_ROOT}/lib)
 199       set(HDF5_INCLUDE_DIRS ${HDF5_ROOT}/include)
 200
 201     endif ( IS_DIRECTORY "/usr/include/petsc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libpetsc.so" )
 202   endif ( DEFINED ENV{PETSC_DIR} OR PETSC_DIR )
 203
 204   if   ( ${PETSC_VERSION} VERSION_GREATER 3.5 )
 205     add_definitions(-DPETSC_VERSION_GREATER_3_5)
 206   endif( ${PETSC_VERSION} VERSION_GREATER 3.5 )
 207 string(REPLACE ";" ":"  PETSC_INCLUDES_INSTALL "${PETSC_INCLUDES}")# use colon instead of semicolon in environment file env_CDMATH.sh
 208
 209 ######################################################
 210 # Detection or compilation of MEDFile                #
 211 ######################################################
 212 if( MEDFILE_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDFILE_ROOT_DIR})
 213
 214   if   ( NOT MEDFILE_ROOT_DIR )
 215     set(MEDFILE_ROOT_DIR $ENV{MEDFILE_ROOT_DIR} )
 216   endif( NOT MEDFILE_ROOT_DIR )
 217
 218   find_package (MEDFile REQUIRED)
 219   message (STATUS "MEDFile found in ${MEDFILE_ROOT_DIR}")
 220
 221 else( MEDFILE_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDFILE_ROOT_DIR})
 222   #string(FIND "${HDF5_LIBRARIES}" "libhdf5.so" pos)
 223   #string(SUBSTRING "${HDF5_LIBRARIES}" 0 ${pos} HDF5_LIBRARY_DIR)
 224
 225   message(STATUS "MED will be downloaded and installed from ${DOWNLOAD_MED}")
 226   set(MACHINE PCLINUX)
 227   set(MEDFILE_DEFINITIONS "-D${MACHINE} -DMEDFILE_INSTALL_DOC=OFF")#Comment ne pas compiler la doc ?
 228   set(MEDFILE_ROOT_DIR ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/med) # Location of the final install
 229
 230   #extraction of the tarball archive name
 231   string(LENGTH "${DOWNLOAD_MED}" tarball_url_length)#length of the name of the tarball
 232   string(FIND "${DOWNLOAD_MED}" "/" start_tarball_name REVERSE )# last occurence of "/"
 233   MATH(EXPR start_tarball_name "${start_tarball_name}+1")#start after the occurence of "/"
 234   MATH(EXPR tarball_name_length "${tarball_url_length}-${start_tarball_name}-7")#name ends before .tar.gz that counts for 7 characters
 235   string(SUBSTRING ${DOWNLOAD_MED} ${start_tarball_name} ${tarball_name_length} MED_TARBALL_NAME)
 236
 237   ExternalProject_Add (MED
 238         URL               ${DOWNLOAD_MED}  #location of med tarball
 239         SOURCE_DIR        ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis/${MED_TARBALL_NAME}
 240         BUILD_IN_SOURCE   TRUE
 241         CONFIGURE_COMMAND <SOURCE_DIR>/configure --prefix=${MEDFILE_ROOT_DIR}  --with-hdf5=${HDF5_ROOT} --with-hdf5-include=${HDF5_ROOT}/include --with-hdf5-lib=${HDF5_LIBRARY_DIR} --with-hdf5-bin=${HDF5_ROOT}/bin  --with-swig=yes
 242         BUILD_COMMAND     make
 243         INSTALL_COMMAND   make install
 244         INSTALL_DIR       ${MEDFILE_ROOT_DIR}
 245         STAMP_DIR         ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis
 246         LOG_DOWNLOAD      TRUE           # Wrap download in script to log output
 247         LOG_UPDATE        TRUE           # Wrap update in script to log output
 248         LOG_CONFIGURE     TRUE           # Wrap configure in script to log output
 249         LOG_BUILD         TRUE           # Wrap build in script to log output
 250         LOG_TEST          TRUE           # Wrap test in script to log output
 251         LOG_INSTALL       TRUE           # Wrap install in script to log output
 252   )
 253
 254   set(MEDFILE_INCLUDE_DIRS ${MEDFILE_ROOT_DIR}/include)# Nécessaire pour le medloader et les sous-dossiers mesh, et IJKMesh
 255   set(MEDFILE_LIBRARIES    ${MEDFILE_ROOT_DIR}/lib)# Nécessaire pour le env_SOLVERLAB.sh
 256   set(MEDFILE_C_LIBRARIES med medC)# Nécessaire pour le medloader
 257
 258 endif( MEDFILE_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDFILE_ROOT_DIR})
 259
 260 add_library(med   SHARED IMPORTED)
 261 set_property(TARGET med  PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDFILE_ROOT_DIR}/lib/libmed.so)
 262 add_library(medC   SHARED IMPORTED)
 263 set_property(TARGET medC PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDFILE_ROOT_DIR}/lib/libmedC.so)
 264
 265 string(REPLACE ";" ":"  MEDFILE_LIBRARIES_INSTALL "${MEDFILE_LIBRARIES}")# use colon instead of semicolon in environment file env_SOLVERLAB.sh
 266
 267 ######################################################
 268 # Detection or compilation of MEDCoupling            #
 269 ######################################################
 270 if( MEDCOUPLING_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR})
 271
 272   if( NOT MEDCOUPLING_ROOT_DIR )
 273     set(MEDCOUPLING_ROOT_DIR $ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR} )
 274   endif( NOT MEDCOUPLING_ROOT_DIR )
 275
 276   message (STATUS "Seeking MEDCoupling library in ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}")
 277
 278   if( NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include/MEDCoupling.hxx)
 279     message (FATAL_ERROR "MEDCoupling library not found in ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}")
 280   else( NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include/MEDCoupling.hxx)
 281     message (STATUS "MEDCoupling library found in ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}")
 282   endif( NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include/MEDCoupling.hxx)
 283
 284 else( MEDCOUPLING_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR})
 285   message(STATUS "MEDCoupling will be downloaded and installed from ${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}")
 286   set(MEDCOUPLING_ROOT_DIR ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/medcoupling) # Location of the final install
 287   SET(ENV{HDF5_ROOT} ${HDF5_ROOT})#MEDCoupling install process seems to require an environment variable
 288
 289   #extraction of the tarball archive name
 290   string(LENGTH "${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}" tarball_url_length)#length of the tarball
 291   string(FIND   "${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}" "/" start_tarball_name REVERSE )# last occurence of "/"
 292   MATH(EXPR start_tarball_name "${start_tarball_name}+1")#start after the occurence of "/"
 293   MATH(EXPR tarball_name_length "${tarball_url_length}-${start_tarball_name}-7")#name ends before .tar.gz that counts for 7 characters
 294   string(SUBSTRING ${DOWNLOAD_MEDCOUPLING} ${start_tarball_name} ${tarball_name_length} MEDCOUPLING_TARBALL_NAME)
 295   string(SUBSTRING ${MEDCOUPLING_TARBALL_NAME} 12 ${tarball_name_length} MEDCOUPLING_VERSION_NAME)
 296
 297   message(STATUS "MEDCoupling version is ${MEDCOUPLING_VERSION_NAME}")
 298
 299   ExternalProject_Add (MEDCoupling
 300         URL               ${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}  #location of medcoupling tarball
 301         SOURCE_DIR        ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis/${MEDCOUPLING_TARBALL_NAME}
 302 #        BUILD_IN_SOURCE   FALSE
 303         CONFIGURE_COMMAND cmake <SOURCE_DIR>/${MEDCOUPLING_TARBALL_NAME} -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=${MEDCOUPLING_ROOT_DIR} -DCONFIGURATION_ROOT_DIR=<SOURCE_DIR>/configuration-${MEDCOUPLING_VERSION_NAME} -DMEDFILE_ROOT_DIR=${MEDFILE_ROOT_DIR} -DMEDCOUPLING_ENABLE_PARTITIONER=OFF -DMEDCOUPLING_PARTITIONER_METIS=OFF -DMEDCOUPLING_PARTITIONER_SCOTCH=OFF -DMEDCOUPLING_ENABLE_RENUMBER=OFF -DMEDCOUPLING_BUILD_DOC=OFF -DHDF5_ROOT_DIR=${HDF5_ROOT}
 304         BUILD_COMMAND     make
 305         INSTALL_COMMAND   make install
 306         INSTALL_DIR       ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}
 307         STAMP_DIR         ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis
 308         LOG_DOWNLOAD      TRUE           # Wrap download in script to log output
 309         LOG_UPDATE        TRUE           # Wrap update in script to log output
 310         LOG_CONFIGURE     TRUE           # Wrap configure in script to log output
 311         LOG_BUILD         TRUE           # Wrap build in script to log output
 312         LOG_TEST          TRUE           # Wrap test in script to log output
 313         LOG_INSTALL       TRUE           # Wrap install in script to log output
 314   )
 315
 316 endif( MEDCOUPLING_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR} )
 317
 318 set(MEDCOUPLING_INCLUDE_DIR ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include)
 319 set(MEDCOUPLING_LIBRARIES   ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib    )#for environment file env_SOLVERLAB.sh
 320
 321 add_library(medloader   SHARED IMPORTED )
 322 set_property(TARGET medloader   PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so)
 323 add_library(medcoupling SHARED IMPORTED )
 324 set_property(TARGET medcoupling PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so)
 325
 326 if   (TARGET MED AND TARGET PETSc)
 327   ExternalProject_Add_StepDependencies( MED build PETSc )#PETSc doit être compilé avant MED car c'est PETSc qui compile HDF5
 328 endif(TARGET MED AND TARGET PETSc)
 329
 330 if   (TARGET MED AND TARGET MEDCoupling)
 331   ExternalProject_Add_StepDependencies( MEDCoupling build MED )#MED doit être compilé avant MEDCoupling
 332 endif(TARGET MED AND TARGET MEDCoupling)
 333
 334 if   (TARGET PETSc AND TARGET MEDCoupling)
 335   ExternalProject_Add_StepDependencies( MEDCoupling build PETSc )#PETSc doit être compilé avant MEDCoupling (car il contient hdf5)
 336 endif(TARGET PETSc AND TARGET MEDCoupling)
 337
 338 ####################
 339 # Final operations #
 340 ####################
 341
 342 # Paraview variables for env_SOLVERLAB.sh
 343 if( NOT DEFINED PARAVIEW_VERSION )
 344   if( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR)
 345     set( PARAVIEW_INCLUDE_DIR   ${PARAVIEW_ROOT_DIR}/include)
 346     set( PARAVIEW_LIBRARIES_DIR ${PARAVIEW_ROOT_DIR}/lib)
 347   else( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR)
 348     set( PARAVIEW_INCLUDE_DIR /usr/include/paraview/)
 349     set( PARAVIEW_LIBRARIES_DIR /usr/lib/paraview/:/usr/lib64/paraview/)
 350   endif( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR)
 351
 352   #extraction of the paraview version"
 353   IF   ( EXISTS ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR}/vtkPVConfig.h )
 354     file(STRINGS ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR}/vtkPVConfig.h vtkConfig)
 355   ELSE ( EXISTS ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR}/vtkPVConfig.h )
 356     message(WARNING "Could not find ParaView configuration file vtkPVConfig.h in folder ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR}. Postprocessing may not work")
 357   ENDIF( EXISTS ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR}/vtkPVConfig.h )
 358
 359   FOREACH(line ${vtkConfig})
 360     string(FIND "${line}" "#define PARAVIEW_VERSION_FULL " pos)
 361     IF(NOT ${pos} EQUAL -1)
 362       string(LENGTH ${line} line_length)#length of the tarball
 363       MATH(EXPR start_pv_version "${line_length}-6")#line ends with "x.y.z", that counts for 7 characters
 364       string(SUBSTRING ${line} ${start_pv_version} 5 PARAVIEW_VERSION)
 365       break()
 366     ENDIF(NOT ${pos} EQUAL -1)
 367   ENDFOREACH(line vtkConfig)
 368 endif(NOT DEFINED PARAVIEW_VERSION)
 369
 370 message(STATUS "ParaView version is ${PARAVIEW_VERSION}" )
 371 IF   ( ${PARAVIEW_VERSION} STRGREATER "5.6" OR ${PARAVIEW_VERSION} STREQUAL "5.6" )#Use python 3, use VERSION_GREATER_EQUAL if cmake >=3.7
 372   SET(PYTHON2OR3 "3")
 373 ELSE ( ${PARAVIEW_VERSION} STRGREATER "5.6" OR ${PARAVIEW_VERSION} STREQUAL "5.6" )#Use python 2
 374   SET(PYTHON2OR3 "2")
 375 ENDIF( ${PARAVIEW_VERSION} STRGREATER "5.6" OR ${PARAVIEW_VERSION} STREQUAL "5.6" )
 376
 377     set (PV_LIB_DIR    /usr/lib/python${PYTHON2OR3}.7/dist-packages/paraview/:${PARAVIEW_LIBRARIES_DIR})
 378     set (PV_PYTHON_DIR /usr/lib/python${PYTHON2OR3}.7/dist-packages/paraview/:/usr/lib64/paraview/site-packages/:/usr/lib64/paraview/site-packages/paraview/:/usr/lib64/paraview/site-packages/vtk/:/usr/lib64/paraview/python${PYTHON2OR3}.7/site-packages/:/usr/lib64/paraview/python${PYTHON2OR3}.7/site-packages/paraview/:/usr/lib64/paraview/python${PYTHON2OR3}.7/site-packages/vtkmodules:/usr/lib/paraview/site-packages/paraview:/usr/lib/paraview/site-packages/paraview/vtk)
 379
 380 # Find python
 381 IF   (${CMAKE_VERSION} VERSION_GREATER "3.12.0")
 382   find_package(Python ${PYTHON2OR3} REQUIRED COMPONENTS Interpreter Development )
 383   SET(PYTHON_EXECUTABLE ${Python_EXECUTABLE})
 384 ELSE (${CMAKE_VERSION} VERSION_GREATER "3.12.0")
 385   find_package(PythonInterp ${PYTHON2OR3} REQUIRED )
 386   find_package(PythonLibs   ${PYTHON2OR3} REQUIRED )
 387   set(Python_LIBRARIES    ${PYTHON_LIBRARIES})
 388   set(Python_INCLUDE_DIRS ${PYTHON_INCLUDE_DIRS})
 389   set(Python_VERSION      ${PYTHON_VERSION_STRING})
 390 ENDIF(${CMAKE_VERSION} VERSION_GREATER "3.12.0")
 391
 392 message(STATUS "Python version is ${Python_VERSION}")
 393 find_package (SWIG 3.0 REQUIRED)
 394
 395 if (SOLVERLAB_WITH_DOCUMENTATION)                                                                           #
 396   find_package (Doxygen)                                                                                    #
 397   set (CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS "${CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS}, doxygen, graphviz, mscgen")
 398   set (CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES "${CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES}, doxygen, graphviz, mscgen")
 399   if   (NOT DOXYGEN_FOUND)
 400     message (FATAL_ERROR "Doxygen is needed to build the documentation. Please install it correctly.")
 401   endif(NOT DOXYGEN_FOUND)
 402 endif()
 403 if (SOLVERLAB_WITH_TESTS)                                                                                  #
 404   find_package (CPPUNIT REQUIRED)
 405 endif()
 406 find_package (XDR REQUIRED)
 407
 408 # Enter subdirectories
 409 set( CMAKE_INSTALL_PREFIX ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/cdmath)
 410 add_subdirectory (CDMATH)
 411 if(SOLVERLAB_WITH_COREFLOWS)
 412   set( CMAKE_INSTALL_PREFIX ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/../coreflows)
 413   add_subdirectory (CoreFlows)
 414 endif(SOLVERLAB_WITH_COREFLOWS)
 415
 416 set( CMAKE_INSTALL_PREFIX ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/../)
 417 # Configuration file
 418 configure_file(
 419     ${PROJECT_SOURCE_DIR}/env_SOLVERLAB.sh
 420     ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/env_SOLVERLAB.sh
 421     @ONLY
 422 )
 423
 424