CMakeLists.txt

   1 cmake_minimum_required (VERSION 3.1)
   2 set(CMAKE_CXX_STANDARD 11)
   3 set(CMAKE_CXX_STANDARD_REQUIRED ON)
   4
   5 # Project name
   6 project (SOLVERLAB C CXX)
   7 set (SOLVERLAB_VERSION_MAJOR 0)
   8 set (SOLVERLAB_VERSION_MINOR 1)
   9
  10 option (SOLVERLAB_WITH_DOCUMENTATION "Generate SOLVERLAB documentation" ON)
  11 option (SOLVERLAB_WITH_PYTHON        "Compile Python interface of SOLVERLAB" ON)
  12 option (SOLVERLAB_WITH_GUI           "Compile a Graphic user Interface for SOLVERLAB" OFF)
  13 option (SOLVERLAB_WITH_PACKAGE       "Generate RPM, Debian and tarball packages" OFF)
  14 option (SOLVERLAB_WITH_COREFLOWS     "Generate COREFLOWS module" ON)
  15 option (SOLVERLAB_WITH_TESTS         "Generate SOLVERLAB example tests" ON)
  16
  17 #Path to installed libraries
  18 set (PETSC_DIR            OFF CACHE STRING "PETSc library path" )
  19 set (SLEPC_DIR            OFF CACHE STRING "SLEPc library path" )
  20 set (HDF5_ROOT            OFF CACHE STRING "HDF5 library path" )#For the compilation of MED with a specific version of HDF5
  21 set (MEDFILE_ROOT_DIR     OFF CACHE STRING "MED library path" )
  22 set (MEDCOUPLING_ROOT_DIR OFF CACHE STRING "MEDCoupling library path" )
  23 set (PYTHON_ROOT_DIR      OFF CACHE STRING "Python library path" )
  24
  25 #url of tarball librairies
  26 set (DOWNLOAD_PETSC         http://ftp.mcs.anl.gov/pub/petsc/release-snapshots/petsc-lite-3.14.0.tar.gz
  27      CACHE STRING           "PETSc tarball path/url" )
  28 set (DOWNLOAD_SLEPC         https://slepc.upv.es/download/distrib/slepc-3.14.0.tar.gz
  29      CACHE STRING           "SLEPC tarball path/url" )
  30 set (DOWNLOAD_F2CBLASLAPACK https://www.mcs.anl.gov/petsc/mirror/externalpackages/f2cblaslapack-3.4.2.q4.tar.gz
  31      CACHE STRING           "F2CBLASLAPACK tarball path/url" )
  32 set (DOWNLOAD_HDF5          https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.10/hdf5-1.10.3/src/hdf5-1.10.3.tar.gz
  33      CACHE STRING           "HDF5 tarball path/url" )
  34 set (DOWNLOAD_MED           http://files.salome-platform.org/Salome/other/med-4.1.0.tar.gz
  35      CACHE STRING           "MED tarball path/url")
  36 set (DOWNLOAD_MEDCOUPLING   http://files.salome-platform.org/Salome/other/medCoupling-9.4.0.tar.gz
  37      CACHE STRING           "MEDCoupling tarball path/url" )
  38
  39 set (CMAKE_BUILD_TYPE Release CACHE STRING "Installation mode")
  40
  41 list (APPEND CMAKE_MODULE_PATH "${SOLVERLAB_SOURCE_DIR}/cmake_files")
  42
  43 include(ExternalProject)#For PETSc, MED and MEDCoupling
  44
  45 set(Python_ROOT_DIR $ENV{PYTHON_ROOT_DIR} )
  46 set(PARAVIEW_ROOT_DIR $ENV{PARAVIEW_ROOT_DIR} )
  47 set(MATPLOTLIB_ROOT_DIR $ENV{MATPLOTLIB_ROOT_DIR} )
  48 set(HDF5_ROOT_DIR $ENV{HDF5_ROOT_DIR} )
  49
  50 ######################################################
  51 # Detection or compilation of PETSc+SLEPc+HDF5       #
  52 ######################################################
  53   if ( DEFINED ENV{PETSC_DIR} OR PETSC_DIR)
  54     if   (NOT PETSC_DIR)
  55       set(PETSC_DIR $ENV{PETSC_DIR})
  56       message ( STATUS "Checking variable PETSC_DIR : " $ENV{PETSC_DIR} )
  57     else (NOT PETSC_DIR)
  58       message ( STATUS "Checking variable PETSC_DIR : " ${PETSC_DIR} )
  59     endif(NOT PETSC_DIR)
  60
  61     find_package (PETSc 3.4 REQUIRED)
  62     petsc_get_version ()
  63
  64     message ( STATUS "PETSc found. Version is ${PETSC_VERSION_MAJOR}.${PETSC_VERSION_MINOR}.${PETSC_VERSION_SUBMINOR}" )
  65     set(PETSC_INSTALL ${PETSC_DIR})
  66
  67     #Define and search slepc variables
  68     if   ( NOT SLEPC_DIR )
  69       if   ( DEFINED ENV{SLEPC_DIR} )
  70         set(SLEPC_DIR $ENV{SLEPC_DIR})
  71       else ( DEFINED ENV{SLEPC_DIR} )
  72         set(SLEPC_DIR ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH})
  73       endif( DEFINED ENV{SLEPC_DIR} )
  74     endif( NOT SLEPC_DIR)
  75
  76     message ( STATUS "Checking variable SLEPC_DIR" )
  77     if ( IS_DIRECTORY ${SLEPC_DIR}/include AND EXISTS ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc.so)
  78       set(SLEPC_INCLUDES  ${SLEPC_DIR}/include)
  79       set(SLEPC_LIBRARIES ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc.so)
  80       message( STATUS "SLEPc found at ${SLEPC_DIR}" )
  81     else()
  82       message( FATAL_ERROR "SLEPc not found at ${SLEPC_DIR}" )
  83     endif()
  84
  85     #define hdf5 variables
  86     if   ( NOT HDF5_ROOT )#hdf5 is not defined in cmake arguments
  87       if  ( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is defined in the environment
  88         set(HDF5_ROOT $ENV{HDF5_ROOT})
  89       else( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is not defined in the environment
  90         #HDF5 to be found in petsc external packages
  91         set(HDF5_ROOT ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH})# define hint for hdf5/med installation in petsc external packages
  92       endif( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )
  93     endif( NOT HDF5_ROOT )
  94     set(HDF5_LIBRARY_DIR  ${HDF5_ROOT}/lib)
  95     set(HDF5_INCLUDE_DIRS ${HDF5_ROOT}/include)
  96   else ( DEFINED ENV{PETSC_DIR} OR PETSC_DIR )
  97     message ( STATUS "PETSC_DIR not set, searching PETSc and SLEPc in the system" )
  98
  99     if ( IS_DIRECTORY "/usr/include/petsc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libpetsc.so" )  #Case fedora/redhat system install
 100       message ( STATUS "PETSC includes found in /usr/include/petsc/" )
 101       message ( STATUS "PETSC library  found in /usr/lib64" )
 102       set(PETSC_DIR /usr/)
 103       set(PETSC_INCLUDES  /usr/include/petsc /usr/include/petsc/petsc/mpiuni)
 104       set(PETSC_LIBRARIES /usr/lib64/libpetsc.so)
 105
 106       set(PETSC_VERSION "3.8") #3.8 for fedora 26 , 3.9 for fedora 29 , 3.10 for fedora 30, , 3.12 for fedora 32
 107
 108       set(CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES   "${CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES}, petsc-devel (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 109       set(PETSC_INSTALL ${PETSC_DIR})
 110
 111       #Define and search slepc variables
 112       if   ( IS_DIRECTORY "/usr/include/slepc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libslepc.so" )
 113         message( STATUS "SLEPc includes found in /usr/include/slepc/" )
 114         message( STATUS "SLEPc library  found in /usr/lib64/slepc/" )
 115         set(SLEPC_DIR /usr/)
 116         set(SLEPC_INCLUDES  ${SLEPC_DIR}/include)
 117         set(SLEPC_LIBRARIES ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc.so)
 118         set (CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES   "${CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES}, slepc-devel (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 119       else ( IS_DIRECTORY "/usr/include/slepc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libslepc.so" )
 120         message( FATAL_ERROR "SLEPc not found in the system" )
 121       endif( IS_DIRECTORY "/usr/include/slepc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libslepc.so" )
 122
 123       #HDF5 to be found in the system
 124       if   ( NOT HDF5_ROOT AND NOT DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is not defined in the environment
 125         find_package(HDF5 REQUIRED)
 126         set(CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS "libhdf5-dev")
 127         set(CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES   "hdf5-devel")
 128       endif( NOT HDF5_ROOT AND NOT DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )
 129
 130     #elseif ( IS_DIRECTORY "/usr/lib/petsc/include" AND EXISTS "/usr/lib/petsc/lib/libpetsc_real.so" ) #Case ubuntu/debian system install
 131     #  message ( STATUS "PETSc includes found in /usr/lib/petsc/include")
 132     #  message ( STATUS "PETSc library  found in /usr/lib/petsc/lib/libpetsc_real.so")
 133     #  set(PETSC_DIR /usr/lib/petsc/)
 134     #  set(PETSC_INCLUDES  ${PETSC_DIR}/include ${PETSC_DIR}/include/petsc/mpiuni)
 135     #  set(PETSC_LIBRARIES ${PETSC_DIR}/lib/libpetsc_real.so)
 136
 137     #  find_package (PETSc 3.4 REQUIRED)
 138     #  petsc_get_version ()
 139     #  set (CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS "${CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS}, petsc-dev   (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 140
 141     #  Define and search slepc variables
 142     #  if   ( IS_DIRECTORY "/usr/lib/slepc/include" AND EXISTS "/usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 143     #    message( STATUS "SLEPc includes found in /usr/lib/slepc/include" )
 144     #    message( STATUS "SLEPc library  found in /usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 145     #    set(SLEPC_DIR /usr/lib/slepc/)
 146     #    set(SLEPC_INCLUDES ${SLEPC_DIR}/include)
 147     #    set(SLEPC_LIBRARIES ${SLEPC_DIR}/lib/libslepc_real.so)
 148     #    set (CPACK_DEBIAN_PACKAGE_REQUIRES   "${CPACK_DEBIAN_PACKAGE_REQUIRES}, slepc-devel (>= 3.4)") # This is not fully working yet.
 149     #  else ( IS_DIRECTORY "/usr/lib/slepc/include" AND EXISTS "/usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 150     #    message( FATAL_ERROR "SLEPc not found in the system" )
 151     #  endif( IS_DIRECTORY "/usr/lib/slepc/include" AND EXISTS "/usr/lib/slepc/lib/libslepc_real.so" )
 152
 153     #elseif ( IS_DIRECTORY "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/petsc") #Case ubuntu/debian system pip install
 154
 155     else ( IS_DIRECTORY "/usr/include/petsc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libpetsc.so" )  # No petsc in system, do compile petsc along with slepc as an external package
 156       message (STATUS "PETSC not found in the system")
 157       message (STATUS "PETSC will be downloaded and compiled from ${DOWNLOAD_PETSC}" )
 158       message (STATUS "SLEPC will be downloaded and compiled from ${DOWNLOAD_SLEPC}" )
 159       message (STATUS "HDF5  will be downloaded and compiled from ${DOWNLOAD_HDF5}" )
 160
 161       #extract tarball name
 162       string(LENGTH "${DOWNLOAD_PETSC}" tarball_url_length)#length of the tarball
 163       string(FIND   "${DOWNLOAD_PETSC}" "/" start_tarball_name REVERSE )# last occurence of "/"
 164       MATH(EXPR start_tarball_name  "${start_tarball_name}+1")#start after the occurence of "/"
 165       MATH(EXPR tarball_name_length "${tarball_url_length}-${start_tarball_name}-7")#name ends before .tar.gz that counts for 7 characters
 166       string(SUBSTRING ${DOWNLOAD_PETSC} ${start_tarball_name} ${tarball_name_length} PETSC_TARBALL_NAME)
 167
 168       set(PETSC_DIR ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis/${PETSC_TARBALL_NAME}) # Location of the final install
 169       set(PETSC_ARCH arch-linux-c-opt)
 170       set(PETSC_INSTALL ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/petsc)#folder to copy petsc libraries and include files
 171
 172       ExternalProject_Add (PETSc
 173       URL               ${DOWNLOAD_PETSC}
 174       SOURCE_DIR        ${PETSC_DIR}
 175       BUILD_IN_SOURCE   TRUE
 176       CONFIGURE_COMMAND <SOURCE_DIR>/configure --prefix=${PETSC_INSTALL} --with-debugging=0 --with-mpi=0 --download-f2cblaslapack=${DOWNLOAD_F2CBLASLAPACK} --with-fc=0 --download-slepc=${DOWNLOAD_SLEPC} --download-hdf5=${DOWNLOAD_HDF5}
 177       BUILD_COMMAND     make all
 178       TEST_COMMAND      make check
 179       INSTALL_COMMAND   make install
 180       INSTALL_DIR       ${PETSC_DIR}
 181       STAMP_DIR         ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis
 182       LOG_DOWNLOAD      TRUE           # Wrap download in script to log output
 183       LOG_UPDATE        TRUE           # Wrap update in script to log output
 184       LOG_CONFIGURE     TRUE           # Wrap configure in script to log output
 185       LOG_BUILD         TRUE           # Wrap build in script to log output
 186       LOG_TEST          TRUE           # Wrap test in script to log output
 187       LOG_INSTALL       TRUE           # Wrap install in script to log output
 188        )
 189
 190       message( STATUS "PETSc, SLEPc and HDF5 will be installed at ${PETSC_INSTALL}")
 191
 192       string(LENGTH "${PETSC_TARBALL_NAME}" tarball_name_length)#length of the tarball
 193       string(FIND   "${PETSC_TARBALL_NAME}" "-" start_version_name REVERSE )# last occurence of "-"
 194       MATH(EXPR start_version_name  "${start_version_name}+1")#start after the occurence of "/"
 195       string(SUBSTRING ${PETSC_TARBALL_NAME} ${start_version_name} ${tarball_name_length} PETSC_VERSION)
 196       message( STATUS "PETSc version ${PETSC_VERSION}  will be installed" )
 197
 198       set(PETSC_INCLUDES  ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/include ${PETSC_DIR}/include)
 199       set(PETSC_LIBRARIES ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/lib/libpetsc.so)
 200
 201       #define slepc variables
 202       set(SLEPC_DIR ${PETSC_INSTALL})
 203       set(SLEPC_INCLUDES ${SLEPC_DIR}/include  ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/externalpackages/slepc-3.13.4/include ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/externalpackages/slepc-3.13.4/installed-arch-linux2-c-opt/include)
 204       set(SLEPC_LIBRARIES ${PETSC_DIR}/${PETSC_ARCH}/externalpackages/slepc-3.13.4/installed-arch-linux2-c-opt/lib/libslepc.so)
 205       message( STATUS "SLEPc includes ${SLEPC_INCLUDES}")
 206
 207       #define hdf5 variables
 208       if   ( NOT HDF5_ROOT )#hdf5 is not defined in cmake arguments
 209         if  ( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is defined in the environment
 210           set(HDF5_ROOT $ENV{HDF5_ROOT})
 211         else( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )#hdf5 is not defined in the environment
 212           set(HDF5_ROOT ${PETSC_INSTALL})#HDF5 to be found in petsc installation
 213         endif( DEFINED ENV{HDF5_ROOT} )
 214       endif( NOT HDF5_ROOT )
 215       set(HDF5_LIBRARY_DIR ${HDF5_ROOT}/lib)
 216       set(HDF5_INCLUDE_DIRS ${HDF5_ROOT}/include)
 217
 218     endif ( IS_DIRECTORY "/usr/include/petsc/" AND EXISTS "/usr/lib64/libpetsc.so" )
 219   endif ( DEFINED ENV{PETSC_DIR} OR PETSC_DIR )
 220
 221   if   ( ${PETSC_VERSION} VERSION_GREATER 3.5 )
 222     add_definitions(-DPETSC_VERSION_GREATER_3_5)
 223   endif( ${PETSC_VERSION} VERSION_GREATER 3.5 )
 224
 225 string(REPLACE ";" ":"  PETSC_INCLUDES_INSTALL "${PETSC_INCLUDES}")# use colon instead of semicolon in environment file env_SOLVERLAB.sh
 226
 227 add_library(petsc   SHARED IMPORTED)
 228 set_property(TARGET petsc  PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${PETSC_LIBRARIES})
 229 add_library(slepc   SHARED IMPORTED)
 230 set_property(TARGET slepc  PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${SLEPC_LIBRARIES})
 231
 232 ######################################################
 233 # Detection or compilation of MEDFile                #
 234 ######################################################
 235 if( MEDFILE_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDFILE_ROOT_DIR})
 236
 237   if   ( NOT MEDFILE_ROOT_DIR )
 238     set(MEDFILE_ROOT_DIR $ENV{MEDFILE_ROOT_DIR} )
 239   endif( NOT MEDFILE_ROOT_DIR )
 240
 241   find_package (MEDFile REQUIRED)
 242   message (STATUS "MEDFile found in ${MEDFILE_ROOT_DIR}")
 243
 244 else( MEDFILE_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDFILE_ROOT_DIR})
 245
 246   message(STATUS "MED will be downloaded and installed from ${DOWNLOAD_MED}")
 247   set(MACHINE PCLINUX)
 248   set(MEDFILE_DEFINITIONS "-D${MACHINE} -DMEDFILE_INSTALL_DOC=OFF")#Comment ne pas compiler la doc ?
 249   set(MEDFILE_ROOT_DIR ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/med) # Location of the final install
 250
 251   #extraction of the tarball archive name
 252   string(LENGTH "${DOWNLOAD_MED}" tarball_url_length)#length of the name of the tarball
 253   string(FIND "${DOWNLOAD_MED}" "/" start_tarball_name REVERSE )# last occurence of "/"
 254   MATH(EXPR start_tarball_name "${start_tarball_name}+1")#start after the occurence of "/"
 255   MATH(EXPR tarball_name_length "${tarball_url_length}-${start_tarball_name}-7")#name ends before .tar.gz that counts for 7 characters
 256   string(SUBSTRING ${DOWNLOAD_MED} ${start_tarball_name} ${tarball_name_length} MED_TARBALL_NAME)
 257
 258   ExternalProject_Add (MED
 259         URL               ${DOWNLOAD_MED}  #location of med tarball
 260         SOURCE_DIR        ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis/${MED_TARBALL_NAME}
 261         BUILD_IN_SOURCE   TRUE
 262         CONFIGURE_COMMAND <SOURCE_DIR>/configure --prefix=${MEDFILE_ROOT_DIR}  --with-hdf5=${HDF5_ROOT} --with-hdf5-include=${HDF5_ROOT}/include --with-hdf5-lib=${HDF5_LIBRARY_DIR} --with-hdf5-bin=${HDF5_ROOT}/bin  --with-swig=yes
 263         BUILD_COMMAND     make
 264         INSTALL_COMMAND   make install
 265         INSTALL_DIR       ${MEDFILE_ROOT_DIR}
 266         STAMP_DIR         ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis
 267         LOG_DOWNLOAD      TRUE           # Wrap download in script to log output
 268         LOG_UPDATE        TRUE           # Wrap update in script to log output
 269         LOG_CONFIGURE     TRUE           # Wrap configure in script to log output
 270         LOG_BUILD         TRUE           # Wrap build in script to log output
 271         LOG_TEST          TRUE           # Wrap test in script to log output
 272         LOG_INSTALL       TRUE           # Wrap install in script to log output
 273   )
 274
 275   set(MEDFILE_INCLUDE_DIRS ${MEDFILE_ROOT_DIR}/include)# Nécessaire pour le medloader et les sous-dossiers mesh, et IJKMesh
 276   set(MEDFILE_LIBRARIES    ${MEDFILE_ROOT_DIR}/lib)# Nécessaire pour le env_SOLVERLAB.sh
 277   set(MEDFILE_C_LIBRARIES med medC)# Nécessaire pour le medloader
 278
 279 endif( MEDFILE_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDFILE_ROOT_DIR})
 280
 281 add_library(med   SHARED IMPORTED)
 282 set_property(TARGET med  PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDFILE_ROOT_DIR}/lib/libmed.so)
 283 add_library(medC   SHARED IMPORTED)
 284 set_property(TARGET medC PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDFILE_ROOT_DIR}/lib/libmedC.so)
 285
 286 string(REPLACE ";" ":"  MEDFILE_LIBRARIES_INSTALL "${MEDFILE_LIBRARIES}")# use colon instead of semicolon in environment file env_SOLVERLAB.sh
 287
 288 ######################################################
 289 # Detection or compilation of MEDCoupling            #
 290 ######################################################
 291 if( MEDCOUPLING_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR})
 292
 293   if( NOT MEDCOUPLING_ROOT_DIR )
 294     set(MEDCOUPLING_ROOT_DIR $ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR} )
 295   endif( NOT MEDCOUPLING_ROOT_DIR )
 296
 297   message (STATUS "Seeking MEDCoupling library in ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}")
 298
 299   if( NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include/MEDCoupling.hxx)
 300     message (FATAL_ERROR "MEDCoupling library not found in ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}")
 301   else( NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include/MEDCoupling.hxx)
 302     message (STATUS "MEDCoupling library found in ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}")
 303   endif( NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so OR NOT EXISTS ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include/MEDCoupling.hxx)
 304
 305 else( MEDCOUPLING_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR})
 306   message(STATUS "MEDCoupling will be downloaded and installed from ${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}")
 307   set(MEDCOUPLING_ROOT_DIR ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/medcoupling) # Location of the final install
 308   SET(ENV{HDF5_ROOT} ${HDF5_ROOT})#MEDCoupling install process seems to require an environment variable
 309
 310   #extraction of the tarball archive name
 311   string(LENGTH "${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}" tarball_url_length)#length of the tarball
 312   string(FIND   "${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}" "/" start_tarball_name REVERSE )# last occurence of "/"
 313   MATH(EXPR start_tarball_name "${start_tarball_name}+1")#start after the occurence of "/"
 314   MATH(EXPR tarball_name_length "${tarball_url_length}-${start_tarball_name}-7")#name ends before .tar.gz that counts for 7 characters
 315   string(SUBSTRING ${DOWNLOAD_MEDCOUPLING} ${start_tarball_name} ${tarball_name_length} MEDCOUPLING_TARBALL_NAME)
 316   string(SUBSTRING ${MEDCOUPLING_TARBALL_NAME} 12 ${tarball_name_length} MEDCOUPLING_VERSION_NAME)
 317
 318   message(STATUS "MEDCoupling version is ${MEDCOUPLING_VERSION_NAME}")
 319
 320   ExternalProject_Add (MEDCoupling
 321         URL               ${DOWNLOAD_MEDCOUPLING}  #location of medcoupling tarball
 322         SOURCE_DIR        ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis/${MEDCOUPLING_TARBALL_NAME}
 323 #        BUILD_IN_SOURCE   FALSE
 324         CONFIGURE_COMMAND cmake <SOURCE_DIR>/${MEDCOUPLING_TARBALL_NAME} -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=${MEDCOUPLING_ROOT_DIR} -DCONFIGURATION_ROOT_DIR=<SOURCE_DIR>/configuration-${MEDCOUPLING_VERSION_NAME} -DMEDFILE_ROOT_DIR=${MEDFILE_ROOT_DIR} -DMEDCOUPLING_ENABLE_PARTITIONER=OFF -DMEDCOUPLING_PARTITIONER_METIS=OFF -DMEDCOUPLING_PARTITIONER_SCOTCH=OFF -DMEDCOUPLING_ENABLE_RENUMBER=OFF -DMEDCOUPLING_BUILD_DOC=OFF -DHDF5_ROOT_DIR=${HDF5_ROOT}
 325         BUILD_COMMAND     make
 326         INSTALL_COMMAND   make install
 327         INSTALL_DIR       ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}
 328         STAMP_DIR         ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/pre_requis
 329         LOG_DOWNLOAD      TRUE           # Wrap download in script to log output
 330         LOG_UPDATE        TRUE           # Wrap update in script to log output
 331         LOG_CONFIGURE     TRUE           # Wrap configure in script to log output
 332         LOG_BUILD         TRUE           # Wrap build in script to log output
 333         LOG_TEST          TRUE           # Wrap test in script to log output
 334         LOG_INSTALL       TRUE           # Wrap install in script to log output
 335   )
 336
 337 endif( MEDCOUPLING_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{MEDCOUPLING_ROOT_DIR} )
 338
 339 set(MEDCOUPLING_INCLUDE_DIR ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/include)
 340 set(MEDCOUPLING_LIBRARIES   ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib    )#for environment file env_SOLVERLAB.sh
 341
 342 add_library(medloader   SHARED IMPORTED )
 343 set_property(TARGET medloader   PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedloader.so)
 344 add_library(medcoupling SHARED IMPORTED )
 345 set_property(TARGET medcoupling PROPERTY IMPORTED_LOCATION ${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/lib/libmedcoupling.so)
 346
 347 if   (TARGET MED AND TARGET PETSc)
 348   ExternalProject_Add_StepDependencies( MED build PETSc )#PETSc doit être compilé avant MED car c'est PETSc qui compile HDF5
 349 endif(TARGET MED AND TARGET PETSc)
 350
 351 if   (TARGET MED AND TARGET MEDCoupling)
 352   ExternalProject_Add_StepDependencies( MEDCoupling build MED )#MED doit être compilé avant MEDCoupling
 353 endif(TARGET MED AND TARGET MEDCoupling)
 354
 355 if   (TARGET PETSc AND TARGET MEDCoupling)
 356   ExternalProject_Add_StepDependencies( MEDCoupling build PETSc )#PETSc doit être compilé avant MEDCoupling (car il contient hdf5)
 357 endif(TARGET PETSc AND TARGET MEDCoupling)
 358
 359 ####################
 360 # Final operations #
 361 ####################
 362
 363 # Paraview variables to choose python version and for env_SOLVERLAB.sh
 364 if  ( DEFINED PARAVIEW_VERSION OR DEFINED ENV{PARAVIEW_VERSION} )
 365   if   ( NOT DEFINED PARAVIEW_VERSION )
 366     set( PARAVIEW_VERSION  $ENV{PARAVIEW_VERSION})
 367   endif( NOT DEFINED PARAVIEW_VERSION )
 368   message(STATUS "ParaView version is ${PARAVIEW_VERSION}" )
 369 else( DEFINED PARAVIEW_VERSION OR DEFINED ENV{PARAVIEW_VERSION} )
 370   if  ( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{PARAVIEW_ROOT_DIR})
 371     if  ( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR )
 372       set( PARAVIEW_INCLUDE_DIR   ${PARAVIEW_ROOT_DIR}/include)
 373       set( PARAVIEW_LIBRARIES_DIR ${PARAVIEW_ROOT_DIR}/lib)
 374     else( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR )
 375       set( PARAVIEW_INCLUDE_DIR   $ENV{PARAVIEW_ROOT_DIR}/include)
 376       set( PARAVIEW_LIBRARIES_DIR $ENV{PARAVIEW_ROOT_DIR}/lib)
 377     endif( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR )
 378   else( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{PARAVIEW_ROOT_DIR})
 379     message(STATUS "PARAVIEW_VERSION and PARAVIEW_ROOT_DIR not set. Trying to detect paraview.")
 380     set( PARAVIEW_INCLUDE_DIR /usr/include/paraview/)
 381     set( PARAVIEW_LIBRARIES_DIR /usr/lib/paraview/:/usr/lib64/paraview/:/usr/lib64/vtk/:/usr/lib/vtk/)
 382   endif( DEFINED PARAVIEW_ROOT_DIR OR DEFINED ENV{PARAVIEW_ROOT_DIR})
 383
 384   set( PARAVIEW_SUFFIXES paraview-5.0 paraview-5.1 paraview-5.2 paraview-5.3 paraview-5.4 paraview-5.5 paraview-5.6 paraview-5.7 paraview-5.8 paraview-5.9 )
 385   find_file( vtkConfig_file vtkPVConfig.h HINTS ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR} PATH_SUFFIXES ${PARAVIEW_SUFFIXES})
 386
 387   #extraction of the paraview version"
 388   IF   ( ${vtkConfig_file} STREQUAL "vtkConfig_file-NOTFOUND" )
 389     message(WARNING "Could not find ParaView configuration file vtkPVConfig.h in folder ${PARAVIEW_INCLUDE_DIR} and subdirectories  ${PARAVIEW_SUFFIXES}. Postprocessing may not work")
 390     set( PARAVIEW_VERSION  "5.0")
 391   ELSE ( ${vtkConfig_file} STREQUAL "vtkConfig_file-NOTFOUND" )
 392     message( STATUS "Found vtkPVConfig.h in ${vtkConfig_file}")
 393     file(STRINGS ${vtkConfig_file} vtkConfig)
 394     FOREACH(line ${vtkConfig})
 395       string(FIND "${line}" "#define PARAVIEW_VERSION_FULL " pos)
 396       IF(NOT ${pos} EQUAL -1)
 397         string(LENGTH ${line} line_length)#length of the tarball
 398         MATH(EXPR start_pv_version "${line_length}-6")#line ends with "x.y.z", that counts for 7 characters
 399         string(SUBSTRING ${line} ${start_pv_version} 5 PARAVIEW_VERSION)
 400         break()
 401       ENDIF(NOT ${pos} EQUAL -1)
 402     ENDFOREACH(line ${vtkConfig})
 403     message(STATUS "ParaView detected, version is ${PARAVIEW_VERSION}" )
 404   ENDIF( ${vtkConfig_file} STREQUAL "vtkConfig_file-NOTFOUND" )
 405 endif( DEFINED PARAVIEW_VERSION OR DEFINED ENV{PARAVIEW_VERSION} )
 406
 407
 408 IF   ( ${PARAVIEW_VERSION} STRGREATER "5.6" OR ${PARAVIEW_VERSION} STREQUAL "5.6" )#Use python 3, use VERSION_GREATER_EQUAL if cmake >=3.7
 409   SET(PYTHON2OR3 "3")
 410   message(STATUS "PARAVIEW_VERSION greater than 5.6. We need python3 for postprocessing scripts.")
 411 ELSE ( ${PARAVIEW_VERSION} STRGREATER "5.6" OR ${PARAVIEW_VERSION} STREQUAL "5.6" )#Use python 2
 412   SET(PYTHON2OR3 "2")
 413   message(STATUS "PARAVIEW_VERSION smaller than 5.6. We need python2 for postprocessing scripts.")
 414 ENDIF( ${PARAVIEW_VERSION} STRGREATER "5.6" OR ${PARAVIEW_VERSION} STREQUAL "5.6" )
 415
 416 # Find python
 417 IF  ( PYTHON_ROOT_DIR OR ENV{PYTHON_ROOT_DIR})
 418   IF  ( PYTHON_ROOT_DIR )
 419     set(Python_ROOT_DIR ${PYTHON_ROOT_DIR} )
 420   ELSE( PYTHON_ROOT_DIR })
 421     set(Python_ROOT_DIR $ENV{PYTHON_ROOT_DIR} )
 422   ENDIF( PYTHON_ROOT_DIR })
 423 ENDIF(PYTHON_ROOT_DIR OR ENV{PYTHON_ROOT_DIR})
 424
 425 IF   (${CMAKE_VERSION} VERSION_GREATER "3.12.0")
 426   find_package(Python ${PYTHON2OR3} REQUIRED COMPONENTS Interpreter Development )
 427   SET(PYTHON_EXECUTABLE ${Python_EXECUTABLE})
 428 ELSE (${CMAKE_VERSION} VERSION_GREATER "3.12.0")
 429   find_package(PythonInterp ${PYTHON2OR3} REQUIRED )
 430   find_package(PythonLibs   ${PYTHON2OR3} REQUIRED )
 431   set(Python_LIBRARIES     ${PYTHON_LIBRARIES})
 432   set(Python_INCLUDE_DIRS  ${PYTHON_INCLUDE_DIRS})
 433   set(Python_VERSION       ${PYTHON_VERSION_STRING})
 434   set(Python_VERSION_MAJOR ${PYTHON_VERSION_MAJOR})
 435   set(Python_VERSION_MINOR ${PYTHON_VERSION_MINOR})
 436 ENDIF(${CMAKE_VERSION} VERSION_GREATER "3.12.0")
 437
 438 #Paraview library paths
 439 set (PV_LIB_DIR    /usr/lib/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/dist-packages/paraview/:/usr/lib64/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/site-packages/vtk/:${PARAVIEW_LIBRARIES_DIR})
 440 set (PV_PYTHON_DIR /usr/lib/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/dist-packages/paraview/:/usr/lib64/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/site-packages/vtk/:/usr/lib64/paraview/site-packages/:/usr/lib64/paraview/site-packages/paraview/:/usr/lib64/paraview/site-packages/vtk/:/usr/lib64/paraview/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/site-packages/:/usr/lib64/paraview/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/site-packages/paraview/:/usr/lib64/paraview/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/site-packages/vtkmodules:/usr/lib/paraview/site-packages/paraview:/usr/lib/paraview/site-packages/paraview/vtk:${PARAVIEW_LIBRARIES_DIR}/python${Python_VERSION_MAJOR}.${Python_VERSION_MINOR}/site-packages/vtkmodules/)
 441
 442 message(STATUS "Python version found is ${Python_VERSION}")
 443 find_package (SWIG 3.0 REQUIRED)
 444
 445 if (SOLVERLAB_WITH_DOCUMENTATION)                                                                           #
 446   find_package (Doxygen)                                                                                    #
 447   set (CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS "${CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS}, doxygen, graphviz, mscgen")
 448   set (CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES "${CPACK_RPM_PACKAGE_REQUIRES}, doxygen, graphviz, mscgen")
 449   if   (NOT DOXYGEN_FOUND)
 450     message (FATAL_ERROR "Doxygen is needed to build the documentation. Please install it correctly.")
 451   endif(NOT DOXYGEN_FOUND)
 452 endif()
 453 if (SOLVERLAB_WITH_TESTS)                                                                                  #
 454   enable_testing ()
 455   find_package (CPPUNIT REQUIRED)
 456 endif()
 457 find_package (XDR REQUIRED)
 458
 459 # Enter subdirectories
 460 add_subdirectory (CDMATH)
 461 if(SOLVERLAB_WITH_COREFLOWS)
 462   add_subdirectory (CoreFlows)
 463 endif(SOLVERLAB_WITH_COREFLOWS)
 464
 465 # Configuration file
 466 configure_file(
 467     ${PROJECT_SOURCE_DIR}/env_SOLVERLAB.sh
 468     ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/env_SOLVERLAB.sh
 469     @ONLY
 470 )
 471
 472